教育部“新世纪优秀人才支持计划”(NCET-09-0928)
- 作品数：3 被引量：3H指数：1
- 相关作者：刘红博廖飞李元丽杨晓兰夏淑芳更多>>
- 相关机构：重庆医科大学重庆邮电大学重庆医科大学附属永川医院更多>>
- 发文基金：教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家自然科学基金重庆市自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术更多>>
- 基于变步长的混合图像自适应盲分离算法被引量：3
- 2011年
- 根据混合信号的分离程度,提出了一种新的图像信号分离算法,通过建立分离矩阵控制步长因子变化,利用自适应不完整自然梯度法实现图像的有效分离。新算法既很好地解决了固定步长算法收敛速度和稳态误差之间的矛盾,也解决了其他变步长算法须选择较小初始步长才能实现分离的问题。仿真结果表明新算法收敛速度快,稳态误差小,综合分离性能明显优于其他算法。
- 夏淑芳张天骐李雪松高清山
- 关键词：盲源分离变步长
- 尿酸酶突变体的高通量筛选方法
- 2015年
- 建立一种尿酸酶突变体的高通量筛选方法。将野生型苛求芽孢杆菌尿酸酶及其突变体的表达载体转入大肠杆菌,每个克隆诱导培养后超声裂解上清液为样品,全自动酶标仪测定293 nm光吸收,并分析反应启动后8～28 min的数据计算酶活性,Bradford法测定总蛋白;ROC比较用酶活性或比活性识别阳性突变体的可靠性。任2种突变体酶活性或比活性比值〉2时,ROC分析曲线下面积接近1;当酶活性或比活性仅增加50%时,分析比活性所得曲线下面积比分析酶活性更大,将ROC分析比活性提高近1倍。突变体敏感度达90%时,比活性为判断阳性突变体阈值,其相当于以起始物比活性均值加1.7倍标准差;此阈值能用于高通量筛选变体库中比活性增加1倍以上的阳性突变体。
- 廖娟刘红博高昂杨晓兰李元丽廖飞
- 关键词：尿酸酶
- 二甲基酚橙法测定尿酸酶活性和识别尿酸酶高活性突变体
- 2013年
- 考察了采用二甲基酚橙测定过氧化氢(Xylenol-orange-assay-of-hydrogen-peroxide,XOAHP)法测定尿酸酶活性的可靠性以及识别高活性尿酸酶突变体的方法.将苛求芽孢杆菌(Bacillus fastidious)尿酸酶4种突变体成对组合,使其催化效力比值在1.3-4.1间变化;将每种突变体表达载体转化大肠杆菌,取30个克隆分别转移到1.0 mL液体培养基放大,18℃诱导表达16 h,收集细胞后超声裂解得裂解液.在pH 8.9的Tris-HCl缓冲液中0.33 mmol/L以下尿酸对XOAHP法测定尿酸酶活性无干扰.SDS-PAGE分析发现不同突变体蛋白表达丰度有差异,酶活性同裂解液中总蛋白浓度正相关.Receiver-operation-curve(ROC)分析发现尿酸酶间催化效力比值越大,则所得曲线下面积(Area-under-the-curve,AUC)越接近1.00,此比值接近1.8时AUC约0.95.以突变体与起始物的酶活性浓度差值超过起始物标准差1.4倍为阈值,能识别催化效力达起始物1.8倍以上的突变体.因此,用XOAHP法测定裂解液中尿酸酶活性,以起始物活性均值加标准差1.4倍为阈值,有望高通量筛选尿酸酶突变体库.
- 刘苗苗冯娟刘红博杨晓兰冯丽萍李元丽廖飞
- 关键词：尿酸酶突变体高通量筛选ROC曲线
