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国家自然科学基金(30671847)
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相关作者:
孟哲峰
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HIV-1辅助蛋白与病毒复制
2008年
孟哲峰
邵一鸣
关键词:
辅助蛋白
病毒复制
我国HIV-1 CRF07_BC流行重组毒株Tat蛋白第一外显子CTL表位预测
2010年
目的 通过测定和分析我国HIV-1 CRF07_BC毒株Tat蛋白第一外显子的基因序列预测其CTL表位的分布情况.方法 236份来自第3次全国HIV分子流行病学调查中感染CRF07_BC毒株的患者的血浆样本,应用巢式聚合酶链反应(nested-PeR)扩增tat基因第一外显子基因区并测序,使用BIMAS HLA Peptide Binding Predictions在线软件和统计学软件对CTL表位进行预测分析.结果 236份CRF07_BC毒株来自16个省份,主要为静脉吸毒传播(58.9%),其次为性传播(25.0%).236条CRF07_BC Tat蛋白第一外显子区共分布有12种CTL表位,主要分布于脯氨酸富集区、半胱氨酸富集区和疏水核心区,碱性区和谷氨酰胺富集区没有发现已知的CTL表位分布,这些表位主要受5种HLA基因型(A * 2501、A * 2902、B * 15、B * 5301和Cw * 1203)以及6种HLA血清型(B53、B58、B57、A3、A68和Cw12)限制,其中5种表位的单氨基酸变异频率大于50%.结论 我国HIV-1 CRF07_BC毒株Tat蛋白第一外显子CTL表位分布于不同功能区,并且存在氨基酸变异.
方志明
邢辉
孟哲峰
洪坤学
廖玲洁
何翔
吕建新
邵一鸣
关键词:
人免疫缺陷病毒
TAT蛋白
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