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中国部分甲肝病毒流行株结构蛋白VP3-VPl区基因特点分析被引量：1: 2011年; 目的分析中国部分甲肝病毒流行株结构蛋白VP3-VPl区基因特点。方法收集42份甲肝患者急性期血清标本，经核酸提取、逆转录及巢氏PCR，测得结构一非结构蛋白VP3-VPl-2A区序列，进行序列同源性比较并分析其基因特点。结果42株HAV病毒株在VPl-2A连接处核苷酸和氨基酸序列同源性分别为89．1％～100％和97．3％～100％；在全长结构蛋白VP3-VPl区的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为87．6％～100％和98．8％～100％。VPl-2A连接处序列相同的病毒株在全长结构蛋白VP3．VPl区的核苷酸同源性为98．4％～100％，0～2个氨基酸位点不同。本实验所得序列在中和抗原位点处氨基酸序列均未变异。结论42株病毒株均属于I型，40株是IA亚型，2株IB亚型。本实验所用HAV流行株在结构蛋白VP3．VPl区的核苷酸存在差异但是氨基酸序列高度保守且没有中和抗原位点处的变异。VPl-2A结合处核苷酸序列相同的分离株在全长结构蛋白VP3-VPl区核苷酸序列相同或相近，氨基酸序列保守。; 郑惠惠曹经瑗毕胜利; 关键词：肝炎病毒甲型基因型

新疆伊犁2005年甲型肝炎病毒流行株基因分型研究被引量：12: 2007年; 为了解2005年新疆伊犁甲型肝炎病毒（甲肝病毒）流行株分子流行病学特征，收集了部分甲肝病人血清标本，用国际上通用的甲肝病毒结构区基因VP1—2A分型引物，经核酸提取，做RT-PCR，序列测定，对甲肝病毒基因进行分型研究，并对甲肝病毒在甲型肝炎（甲肝）病人血清中存在的时间进行了探讨。结果显示，甲肝病毒核苷酸序列变异在0～3．2％之间，分为不同的基因簇，但都属于1A亚型（同一基因亚型间核苷酸序列变异小于7．5％）;氨基酸序列几乎相同。甲肝发病8周后的病人血清中仍能检测到甲肝病毒。结果说明该流行区有多株甲肝病毒存在，其传染源可能有多个传播途径，当人群免疫水平较低时，可引起甲肝流行。甲肝病毒在病人血液中可存在较长时间。这些工作为今后进一步开展甲肝病毒溯源研究及有效控制甲肝病毒流行提供了理论和技术支撑。; 曹经瑗孟庆玲李新兰张丽杰袁俊范德生王春玲王小平克里木.玛木提张丽文张勇毕胜利; 关键词：甲型肝炎病毒基因型分子流行病学

不同标本中甲型肝炎病毒核酸检测方法的建立及应用: 2008年; 目的建立水、贝类、血液及唾液中甲型肝炎病毒核酸RT—PCR检测方法。方法加入一定量甲肝病毒到贝类、水、血液及唾液标本中，贝类经研磨后，PEG沉淀浓缩；水直接经PEG沉淀浓缩：以上标本及血液、唾液标本用Trizol试剂提取核酸，套式RT-PCR检测甲肝病毒核酸。引物位于甲肝病毒结构区VPI-2A区。结果病毒培养液中能检测到0．1TCID50甲肝病毒；水、血清及唾液中能检测到1TCID50甲肝病毒；毛蚶中能检测到1-10TCID50甲肝病毒。某地甲肝病毒污染的水及患者血清标本中检测到了甲肝病毒核酸，并进行了序列分析比对。结论本研究建立的不同标本中甲型肝炎病毒核酸RT-PCR检测方法，敏感、特异、快速，具有广泛的应用价值，将为甲肝的溯源研究及分子流行病学研究打下理论基础及提供技术支撑.; 孟庆玲郭子杰曹经瑗毕胜利; 关键词：肝炎病毒甲型病毒检测逆转录聚合酶链反应

河北石家庄2005-2007年甲肝病毒流行株基因分型研究: 2009年; 目的了解石家庄地区甲型肝炎病毒（HAV）流行株基因型特征，为HAV溯源研究打下基础。方法收集了2005--2007年石家庄地区部分甲肝患者急性期血清标本，用HAV结构．非结构区VP1—2A基因引物，经核酸提取，RT-PCR，序列测定，对HAV进行基因分型分析。结果石家庄地区2005--2007年HAV流行株VP1-2A区核苷酸序列同源性为95％～100％，都属于IA亚型；该区氨基酸序列几乎相同。结论石家庄地区存在有多株甲肝病毒流行株，同一株甲肝病毒可以存在不同地区，同一地区可以检测到相同或不相同的HAV毒株。为今后进一步开展甲肝病毒分子流行病学研究及有效控制HAV流行提供了理论和技术支撑。; 戴二黑郭子杰卢建华刘玉珍侯军良曹治宸孟庆玲曹经瑗毕胜利; 关键词：基因型逆转录聚合酶链反应

新疆和田2006年甲肝病毒流行株基因分型研究被引量：3: 2009年; 目的了解2006年新疆和田甲型肝炎病毒（HAV）流行株基因型特征，为HAV溯源研究打下基础。方法收集了新疆和田部分甲肝病人血清标本，用HAV结构．非结构区基因VPI-2A引物，经核酸提取，RT-PCR，序列测定，对HAV进行基因分型研究。结果新疆和田VP1—2A区HAV核苷酸序列变异为0％-3．9％，分为不同基因簇，但都属1A亚型；VP1-2A区氨基酸序列只有0—2个差异。与已发表的2005年新疆伊犁部分甲肝病毒流行株基因有相同序列或同源性较高。结论和田有多株甲肝病毒存在，本研究流行可能有多个传染源，多个传播链，在人群免疫水平较低时，引起甲肝流行。结果表明HAV分子流行病学方法在HAV流行株遗传变异及溯源研究中，以及控制HAV流行中具有重要作用。; 阿依古丽·伊尔哈力曹经瑗艾德尔·艾力文前杨世平库热席孟庆玲李新兰毕胜利; 关键词：基因型流行病学分子

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