四川省科技厅科技支撑计划项目(2010SZ0050)
- 作品数：7 被引量：43H指数：5
- 相关作者：颜其贵郭玲陈世界雷燕舒蕾更多>>
- 相关机构：四川农业大学四川出入境检验检疫局中国保护大熊猫研究中心更多>>
- 发文基金：四川省科技厅科技支撑计划项目成都大熊猫繁育研究基金长江学者和创新团队发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 基于H蛋白基因的犬瘟热病毒遗传变异分析被引量：6
- 2012年
- 犬瘟热是犬瘟热病毒(Canine distemper virus,CDV)感染犬和其他食肉动物造成的多发性、致死性传染病,本文从分子水平上探讨CDV遗传进化特性、变异情况与流行规律之间的关系。通过收集2002—2010年在中国地区分离的14株CDV野毒株、2006—2007年在全球各地分离的12株CDV野毒株以及从不同宿主分离的12株CDV野毒株和4株疫苗株,将其分为4组,将前3组野毒株分别与国内外正在使用的4株疫苗株的H基因进行遗传变异分析。分析发现,CDV野毒株与疫苗株间H蛋白基因的核苷酸相似性为86.2%～92.1%,其氨基酸相似性为89.1%～91.9%;H基因的584位的天冬酰胺糖基化位点是Asia-Ⅰ型CDV所特有的;H蛋白3555区域的非同义氨基酸替换概率较高。作者推测H蛋白抗原变异可能造成弱毒疫苗免疫效力降低,不能为某些CDV株的感染提供完全有效的保护。
- 郭玲雷燕陈世界王成东杨晓龙颜其贵
- 关键词：犬瘟热病毒基因型
- 纤维素酶在畜牧业中的应用及研究进展被引量：16
- 2014年
- 纤维素酶是一种重要的复合酶,能催化纤维素转化成寡糖或单糖,在我国食品、纺织、饲料业中有着不可替代的位置。纤维素酶作为一种饲料添加剂,能提高粗饲料的转化率、改善动物的生产性能,在畜牧业中有着广阔的研究和应用前景。文章介绍了纤维素酶在畜牧业中的应用现状及其研究进展,以期为生产实践提供理论依据。
- 赵珊刘杰佘容颜其贵
- 关键词：纤维素酶畜牧业
- 大熊猫轮状病毒CH-1株VP1基因的克隆和生物信息学分析被引量：1
- 2014年
- 为研究大熊猫源轮状病毒(RV)CH-1株外衣壳蛋白VP1基因的结构及功能,采用MA-104细胞增殖大熊猫源RV,提取总RNA,运用RT-PCR扩增VP1基因,将阳性克隆进行测序,用生物信息学软件预测其功能,并构建系统进化树。结果显示,成功获得了长3 287bp的GPRV VP1蛋白基因(GenBank登录号:HQ641297);经生物信息学分析,此序列包含有一个3 267bp的完整开放阅读框,编码1 089个氨基酸;无信号肽;无跨膜区,其整个蛋白都位于病毒膜外区;抗原表位预测显示VP1蛋白有41个抗原表位;系统进化树分析显示大熊猫轮状病毒CH-1株VP1基因与猪A组轮状病毒VP1基因的进化距离最近。本研究成功获得了大熊猫源RV VP1基因,为今后研究此基因的生物学功能奠定了基础。
- 郭玲杨绍林张和民李德生王承东曹三杰黄晓波文心田陈世界颜其贵
- 关键词：VP1基因克隆生物信息学分析
- 大熊猫轮状病毒CH-1株外衣壳蛋白VP4基因的克隆与生物信息学分析被引量：6
- 2011年
- 利用MA-104细胞培养增殖大熊猫轮状病毒CH-1株,提取总RNA,运用RT-PCR扩增外衣壳蛋白VP4基因,将其与pMD19-T simple vector连接并转化DH5α,经PCR扩增和测序分析进行鉴定,用生物信息学软件预测其功能,并构建系统进化树。结果显示,成功获得大熊猫轮状病毒VP4蛋白基因,长2 362bp,包含一个2 331bp的开放阅读框,编码776个氨基酸,测序结果在GenBank中的登录号为HQ641296。生物信息学分析表明,VP4蛋白基因编码产物分子质量为86 768.8u,理论等电点为5.56,半衰期为30h(体外哺乳类网状细胞),不稳定系数为28.64,脂肪指数为82.53,总平均亲水性为-0.265,最大疏水性为2.244,最小疏水性为-2.911;无信号肽序列;跨膜结构分析显示VP4蛋白无跨膜区,位于病毒膜外区;在VP4序列中的抗原决定簇主要位于VP4的N-末端和C-末端。预测其可能包含8个N-糖基化作用位点,15个蛋白激酶C磷酸化作用位点、15个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化作用位点、12个N-豆蔻酰化位点。系统进化分析显示,大熊猫轮状病毒的VP4基因与猪轮状病毒的VP4基因的进化距离最近。本试验成功获得大熊猫轮状病毒VP4基因,为以后研究此基因的生物学功能、建立该病毒的检测方法以及研制新型大熊猫轮状病毒基因疫苗奠定了基础。
- 雷燕颜其贵张志和王成东陈世界王旭左兰程喻任玉鹏郭玲
- 关键词：大熊猫轮状病毒VP4基因生物信息学分析
- 犬细小病毒PCR诊断方法的建立及对大熊猫粪便的检测被引量：9
- 2013年
- 根据GenBank中登录的犬细小病毒(CPV)VP2基因序列,设计合成1对特异性引物;以CPV疫苗株为模板,建立了一种快速检测CPV的PCR检测方法,并应用于CPV诊断。结果显示,以此对引物进行PCR扩增能得到与理论设计值大小一致的342bp的特异性条带,对犬瘟热病毒(CDV)、犬冠状病毒(CCV)、狂犬病病毒(RV)、新城疫病毒(NDV)和猫泛白细胞减少症病毒(FPV)扩增结果均为阴性;最低可检出约1.4pg的病毒核酸;重复性试验结果表明,其检测重复性好;对45份临床宠物犬病料进行检测,并与免疫胶体金抗原检测拭纸检测结果进行比较,吻合率为90.0%。将此方法初步应用于大熊猫粪便中细小病毒的检测,结果表明,从熊猫基地采集的52份正常大熊猫粪便样品中有8份为细小病毒阳性,阳性率为15.3%。大熊猫是通过自然感染还是弱毒苗感染细小病毒的机制还不清楚。
- 郭玲杨绍林张志和陈世界阳爱国李德生王成东刘丹刘杰潘海波李乡城舒蕾颜其贵
- 关键词：犬细小病毒PCR大熊猫
- 大熊猫轮状病毒CH-1株NSP4基因的克隆与生物信息学分析被引量：3
- 2010年
- 用MA-104细胞增殖大熊猫轮状病毒(RV),并提取总RNA,经RT-PCR扩增,获得NSP4基因,将其克隆到载体进行测序,应用生物信息学方法初步分析NSP4基因的结构及功能,并与不同动物的RV构建系统进化树。结果显示,获得了长750bp的大熊猫RVNSP4基因,此序列包含1个528bp的完整开放阅读框,编码175个氨基酸;预测大熊猫RVNSP4基因的理论分子质量为20223.7u,等电点为6.84,半衰期为30h,不稳定系数为30.40,总平均亲水性为-0.240,疏水性为-2.400～2.622;无信号肽序列;跨膜结构分析表明,NSP4有1个跨膜区,其N端位于病毒膜外区,C端位于病毒膜内区;抗原表位预测显示,NSP4有6个抗原决定簇;结构预测显示,其可能包含2个N-糖基化作用位点、6个蛋白激酶C磷酸化作用位点、3个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化作用位点和1个酪氨酸激酶磷酸化作用位点;系统进化树分析显示,大熊猫RV NSP4基因与猪RV NSP4基因的进化距离最近。
- 刘菲雷燕颜其贵张志和王成东郭万柱陈斌王旭左兰程渝
- 关键词：大熊猫轮状病毒生物信息学分析
- 犬瘟热病毒RT-PCR检测方法的建立被引量：7
- 2012年
- 根据GenBank中登录的犬瘟热病毒(CDV)核衣壳蛋白基因序列,设计合成了1对特异性引物,以CDV疫苗株ONP为模板,通过对反应条件进行优化,建立了一种快速检测CDV的RT-PCR方法。结果显示,以该引物进行RT-PCR扩增,能得到与理论设计值大小一致的242bp的特异性条带;该方法最低可以检测出约20pg含量的CDV;对已知CDV阳性和阴性病料进行重复性和稳定性试验,结果均一致;用该方法检测犬细小病毒(CPV)、犬冠状病毒(CCV)、狂犬病病毒(RV)和同为副黏病毒科的新城疫病毒(NDV),均无交叉反应;对32份临床病料进行检测,并与免疫胶体金抗原检测试纸检测结果进行比较,符合率为93.75%。结果表明,此方法特异性强,敏感性高,重复性和稳定性均好,可用于犬瘟热病毒的临床诊断和试验研究。
- 郭玲万莉马磊张琦谢志勇杨映舒蕾陈世界杨晓农颜其贵
- 关键词：犬瘟热病毒RT-PCR
