国家自然科学基金(60970005)
- 作品数：3 被引量：3H指数：1
- 相关作者：张倩董亚非王振晔冯婷郭韬更多>>
- 相关机构：陕西师范大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金陕西省自然科学基金西安市科技计划项目更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学更多>>
- 分子算法在公交网络问题中的应用被引量：1
- 2012年
- 分子生物计算是一门很有潜力的发展中学科。首次尝试将其用于解决公交网络问题。通过对公交网络问题的分析,巧妙地将该出行优化问题转化成一个赋权图问题,综合考虑道路长度、拥堵系数、换乘等因素,并结合自组装的思想对其进行建模。在此基础之上,以西安市局部公共交通网络图为例,给出了该分子计算模型的详细生化操作步骤,显示了分子生物计算的可行性及巨大的优越性。该算法大大降低了公交网络计算的复杂性,同时扩展了分子生物计算的研究领域。
- 张倩王振晔董亚非
- 关键词：公交网络自组装
- 基于二维DNA分子tiler自组装求解最大团问题被引量：1
- 2011年
- 针对常用算法在求解完全NP问题中最大团问题时,存在实验操作步骤过多、活体内不易操作以及环化效率不高等问题,设计了一种用二维DNA(k-臂DNA分子)结构来解决最大团问题的方法.该方法将二维DNA分子设计为分子tiler,通过二维DNA分子构建三维DNA图结构并建立计算模型,以减少解决问题所需的时间和步骤.该算法是求解最大团问题的一种可以降低复杂度的新算法,对DNA计算和DNA计算机的研究是一次有意义的实践.
- 冯婷张倩董亚非
- 关键词：DNA计算最大团问题
- miRNA-124靶标功能的生物信息学挖掘被引量：1
- 2010年
- 以miRNA-124为例,将miRNA的靶标预测信息与芯片数据分析中下调的基因信息整合起来,从而筛选出miRNA-124的候选靶标,然后对这些靶标的功能进行了深入分析.研究结果表明miRNA-124的靶标可分为两类:直接靶标和间接靶标,间接靶标是通过直接靶标的调控起作用的.miRNA-124靶标的功能主要是蛋白结合作用.miRNA-124靶标的筛选和功能挖掘,为科学工作者选择和验证其它miRNAs靶标的功能打下了坚实的基础,同时此方法可以推广到其它miRNAs的功能研究中.
- 魏强李广林郭韬
- 关键词：靶标生物信息学芯片分析
