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上海市科学技术委员会基础研究重点项目(074119521)
作品数:
2
被引量:2
H指数:1
相关作者:
季育华
曹国君
孙佳彬
方风琴
陆怡德
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相关机构:
上海交通大学医学院附属瑞金医院
复旦大学
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发文基金:
上海市科学技术委员会基础研究重点项目
国家教育部博士点基金
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相关领域:
医药卫生
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曹国君
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季育华
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张玥
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章莉
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谢琼
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华丽
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毛客自
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陆怡德
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孙佳彬
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方风琴
传媒
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上海交通大学...
年份
2篇
2010
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人巨细胞病毒耐药相关蛋白PUL97局部结构模拟和突变分析
2010年
目的初步探索人巨细胞病毒耐药相关蛋白PUL97局部序列(329~572aa)的三维模拟结构并进行突变的耐药分析。方法采用巢式PCR方法扩增UL97基因776 bp片段并测序,以此发现非同义突变;然后利用SWISS-MODEL结构模拟综合服务器和其他相关软件比对模式对野生型PUL97蛋白片段进行同源模建并优化,通过各种指标或服务器来评估模拟结构的优劣并作筛选。将筛选所得的最佳模拟结构用于非同义新突变型的初步耐药分析。结果最终筛选出的模拟结构是以1YDTE为模板,以L1.FASTA为比对文件所得的Model A。整个分子的能量最低,ProQ的预测分数最高。分子对接分析也发现了潜在的ATP和GCV结合口袋。利用已知的阴阳性耐药点突变验证了该结构的合理性。同时根据突变前后结构信息的改变,提示C518Y单点突变以及联合突变(E517G和C518Y)呈现高度可疑的耐药特性。结论 PUL97野生型蛋白计算机结构模拟和突变分析法是初步评估新突变型耐药特性的又一方便快捷的方法 ,可用于实验验证前的筛选;但模拟结构本身的准确性是成功运用该方法的前提。
方风琴
谢琼
张玥
毛客自
章莉
陆怡德
华丽
曹国君
季育华
关键词:
人巨细胞病毒
突变分析
病毒microRNA研究进展
被引量:2
2010年
microRNA(miRNA)是一种含有约22个核苷酸的RNA分子,它可以介导基因表达的转录后调节,可调节细胞的生长、分化、凋亡、细胞周期和免疫反应等。已逐步发现多种病毒miRNA,该文就近年来病毒miRNA的研究进展作一综述。
曹国君
孙佳彬
季育华
关键词:
病毒
MICRORNA
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