国家林业局948项目(2006-G55B)
- 作品数：6 被引量：65H指数：5
- 相关作者：孔杰栾生王清印王伟继孟宪红更多>>
- 相关机构：中国水产科学研究院黄海水产研究所全国水产技术推广总站连云港市海洋与水产科学研究所更多>>
- 发文基金：引进国际先进农业科技计划国家高技术研究发展计划江苏省海洋生物技术重点建设实验室基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 中国对虾家系水平遗传多样性的AFLP分析被引量：5
- 2008年
- 采用扩增片段长度多态性分子标记技术对中国对虾的40个家系共200个样品进行了家系水平的遗传多样性分析。利用10对引物共产生307个表达清晰可用于分析的标记,其中189个标记表现为多态性,占总标记数的61.56%;中国对虾各个家系多态位点百分率在12.7%～34.2%之间;各个家系基因多样性指数在0.0494～0.122之间,Shannon指数的范围在0.0725～0.182之间(家系水平为0.1975)。对40个家系的AMOVA分析结果显示,家系间的基因分化系数Gst=0.4713,即总的遗传变异中有47.13%的变异存在于家系间,家系内的遗传变异占总遗传变异的52.87%。采用UPGMA法对中国对虾的40个家系进行了聚类分析,确定了各个家系之间的遗传亲缘关系;并且对200个个体进行了聚类分析。结果表明,90%同一家系的子代个体能完全聚类在一起。通过家系间的遗传分化系数Gst对中国对虾的40个家系间的基因流进行了估测,结果显示,Nm=0.5609,表明基因流处于较低水平。
- 孟鹏刘晓敏王伟继孔杰李晓静王清印
- 关键词：中国对虾家系AFLP
- 水产动物育种值估计方法及其应用的研究进展被引量：30
- 2008年
- 育种值是选种和配种计划制定的基础,育种值估计是水产动物选择育种的重要内容之一,育种值估计的准确性直接影响着育种项目的遗传进展和选择效果。本文综述了3种育种值估计方法,选择指数、最佳线性无偏预测BLUP法和标记辅助BLUP方法的原理、优缺点及其在水产动物育种中的应用进展。众多研究表明,基于系谱结构和表型信息的BLUP方法将成为水产动物育种中一种快速有效的育种值估计方法。
- 栾生孔杰王清印
- 关键词：水产动物育种值估计BLUP
- 水产动物育种分析与管理系统的开发和应用被引量：11
- 2008年
- 针对国内水产动物多性状选择育种研究处于起步阶段的现状,以BLUP遗传评定为核心的水产动物多性状复合育种技术体系为依托,结合国内水产动物育种项目研究,开发了一套适合大多数水产动物育种分析与项目管理的软件系统。该系统是在WindowsXP环境下利用MicrosoftSQLServer2000数据库和基于ObjectPascal语言的DelphiIDE工具开发完成的。主要包括6个功能模块:系统管理、基本信息、种质管理、性能管理、育种分析和销售管理等,覆盖整个育种项目周期,并对流程实行标准化,能够自动化完成种质和性能测定数据的管理、遗传参数估计、育种值计算和配种方案制定等主要工作。软件已经在中国对虾、大菱鲆和罗氏沼虾等育种项目中得到应用,其推广和应用能够有效提升行业的整体育种技术水平,推动我国水产动物育种工作的发展。
- 栾生孔杰王清印张晓明张兆明胡红浪孙喜模
- 关键词：BLUP育种
- 中国明对虾基因组微卫星重复单元类型与其多态性关系被引量：11
- 2009年
- 利用超声波粉碎中国明对虾Fenneropenaeus chinensis基因组后建立随机基因组文库,对其测序后获得了1996个克隆序列,经Seqm anⅡ(DNAstar)拼装后获得独立克隆数目为1900个,每个序列长度从400—700bp不等。利用重复序列分析软件对这些序列中含有微卫星重复序列的序列进行分析,共找到136个包含完整侧翼序列的重复序列。利用引物设计软件从以上重复序列中设计出34对引物,合成引物后,通过PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳的方法获得了各个微卫星位点的等位基因数目。34对引物中,除4个没有扩增出产物外,其他都有较好的扩增结果,可以分辨出多态性信息情况,并据此分析了不同微卫星重复序列类型与其对应的位点多态性之间的关系。结果表明,两碱基重复类型具有较高的遗传多态性,而三碱基和四碱基以及复合型重复类型的平均多态性不高;两碱基重复序列类型各拷贝类别间的多态性信息没有明显的差异。进一步对两碱基的重复拷贝数目与多态性信息(等位基因数目)的相关关系进行分析,以考察拷贝数多少与等位基因数目之间的关系。利用SPSS软件进行相关分析,结果表明重复拷贝数目和等位基因数目呈一定相关(相关系数0.121),但相关性不显著(P=0.621)。
- 高焕于飞栾生孟宪红蔡生力孔杰
- 关键词：中国明对虾微卫星多态性
- 利用中国明对虾单对杂交亲本及其F_2群体构建RAPD遗传连锁图谱被引量：1
- 2007年
- 由中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)单对杂交亲本(G♀和G♂)及其F2为作图群体,构建了中国明对虾RAPD分子标记的遗传连锁图谱。109个引物共产生284个符合孟德尔分离规律的位点,符合1∶1孟德尔分离类型的位点共234个,符合3∶1孟德尔分离类型的位点50个。利用拟测交理论分别构建中国明对虾雌虾、雄虾的遗传连锁图谱。107个1∶1分离标记分布于雌虾连锁图谱中,包括31个连锁群,图谱总长度为1 406.1 cM,所有标记间的平均间隔为18.5 cM;91个1∶1分离标记分布于雄虾连锁图谱中,包括26个连锁群,图谱总长度为1 187.7 cM,所有标记间的平均间隔为18.27 cM;利用F2自交模型构建了雌虾和雄虾共同的分子标记,35个3∶1分离标记分布于雌雄共有的连锁图谱中,包括10个连锁群,图谱总长度为432.9 cM,所有标记间的平均间隔为17.3 cM。
- 李晓静王伟继孔杰孟宪红田燚孟鹏毛连菊
- 关键词：中国明对虾RAPD分子标记遗传连锁图谱
- 中国对虾遗传连锁图谱的构建被引量：7
- 2008年
- 中国对虾是中国重要的水产资源之一,其自然群体主要分布于中国黄渤海沿海海域和朝鲜半岛海域.中国对虾遗传连锁图谱的构建,可以加速分子标记辅助育种和控制重要经济性状基因鉴定的研究,为中国对虾遗传改良和优良品种的培育提供基础信息.利用中国对虾F2群体家系和AFLP分子标记技术进行了中国对虾遗传连锁图谱的构建.利用55对AFLP引物组合对F2家系的110个个体进行了研究,检测到532个符合作图策略的AFLP标记.对于符合3∶1比例的分离位点利用F2自交模型构建性别平均连锁图谱,对于符合1∶1比例的分离位点利用拟测交理论分别构建中国对虾的雌性和雄性遗传连锁图谱.雌性遗传图谱分别由103标记组成28个连锁群,没有未连锁标记,图谱长度分别为1090cM.雄性遗传图谱由144个标记构成35个连锁群,有10个未连锁标记,图谱长度分别为1617cM.中国对虾雄性遗传连锁图谱比雌性遗传连锁图谱长32.6%,这可能说明中国对虾不同性别存在不同的重组率.性别平均遗传图谱有44个连锁群,由216个标记组成,有2个未连锁标记,图谱实际长度为1772.1cM.中国对虾遗传连锁图谱基因组估计长度为2420cM,符合与人类基因组相比的对虾类基因组长度.通过皮尔逊相关系数检测认为AFLP标记在中国对虾图谱上分布均匀.本研究利用AFLP标记构建的中国对虾遗传连锁图谱为中国对虾基因组研究和遗传改良提供一定的基础,同时开发的微卫星标记也为遗传连锁图谱的整合提供条件.
- 田燚孔杰王伟继
- 关键词：AFLP中国对虾遗传连锁图谱
