国家自然科学基金(20473083)
- 作品数:2 被引量:9H指数:1
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- 相关领域:生物学理学更多>>
- DNA序列编码及相似度计算被引量:9
- 2006年
- 将DNA的一级序列如β-球蛋白基因的第一个外显子(Exon)转化为分子“结构图”,然后由所得“结构图”提取图的不变量,如分子连接性指数.以图的不变量作为自变量,再由相似度计算公式或距离公式进行相似度计算,其相似度的大小显示不同物种间亲缘关系的远近程度.运用这种方法对人、猴及鼠等8个物种的β-球蛋白基因的第一个外显子的相似度进行计算,所得结果与生物学中的进化树符合得较好.
- 张宝华王海水许禄
- 关键词:DNA序列外显子分子连接性指数进化树
- 脱氧核糖核酸一级序列特殊碱基组合及相关性研究
- 2006年
- 在脱氧核糖核酸(DNA)一级序列中,4种碱基可以有16种两两组合的方式(例如,ct,ag,cg,tc等),不同的组合方式在DNA的该种序列中出现的次数也不一样,其中,cg出现的频数甚少.本文将cg所处位置及频率作为一种数学的量,计算了各物种的分子连接性指数,并以之为参数进行了物种间相似性分析.在此基础上,进一步对10种物种做了分组和归类.
- 张宝华王海水许禄
- 关键词:分子连接性指数