国家教育部博士点基金(20103250120006)
- 作品数:1 被引量:6H指数:1
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- 发文基金:扬州市科技攻关计划项目国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 13个物种BPI基因编码区生物信息学分析被引量:6
- 2013年
- 本研究采用生物信息学的方法比较不同物种BPI基因编码区CDS序列,分析人、小家鼠、褐家鼠、牛、白颊长臂猿、原鸡、家兔、野猪、猕猴、家马、非洲爪蟾、毛猩猩、犬13个物种BPI基因编码区的遗传多样性,且对BPI氨基酸序列组成、信号肽、疏水性/亲水性、跨膜结构、二级结构及保守结构域进行预测分析。结果表明,在13个物种的29条BPI基因CDS序列中,共检测到532个多态位点,生成了15种单倍型,BPI基因在种群间及种群内均存在较大的遗传变异,BPI基因具有较强的密码子偏爱性。BPI蛋白理论等电点均大于7,呈碱性,N端大都有信号肽,肽链表现为亲水性,基本属于跨膜蛋白和分泌蛋白。BPI蛋白主要二级结构元件为α螺旋、β折叠和无规则卷曲,有2个保守结构域BPI1和BPI2。
- 吴正常苏先敏王瑾郑先瑞吴圣龙包文斌
- 关键词:编码区生物信息学