国家高技术研究发展计划(102-10-03-05) 作品数:7 被引量:15 H指数:3 相关作者: 沈岩 赵军 梅品超 贡金英 范钰 更多>> 相关机构: 中国医学科学院中国协和医科大学 中国医学科学院基础医学研究所 天津医科大学 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
DNA重新甲基化酶3b在成年及新生小鼠部分组织中的选择性剪接表达 被引量:2 2000年 目的 探讨哺乳动物 DNA重新甲基转移酶 3b(Dnm t3b)在新生及成年小鼠多种组织中的选择性剪接表达。方法 采用 RT- PCR结合毛细管电泳分析新生及成年小鼠主要器官中 Dnmt3b的选择性剪接表达产物 ,并通过计算机分析 Dnm t3b外显子 10和外显子 2 1、2 2选择性剪接对该基因功能可能产生的影响。结果 成年小鼠肝组织中大部分 Dnm t3b转录本保留外显子 10 ,而其它组织的大部分转录本中此序列被剪切掉。成年小鼠肺组织主要表达缺失外显子 10的 Dnmt3b转录本 ,而新生小鼠肺组织则表达保留外显子 10的转录本。亲水性及二级结构分析表明 ,选择性剪接区域编码的肽段均位于 Dnmt3b蛋白分子的表面。结论 小鼠 Dnm t3b基因的选择性剪接具有组织及发育阶段特异性 ,其选择性剪接区域编码的肽段可能与蛋白分子的调控或酶分子的靶序列识别有关。 林岚 许琪 张焱 尹斌 范钰 罗一菁 韩少梅 张正国 吴冠芸 沈岩关键词:甲基转移酶 选择性剪接 毛细管电泳 DNA 一个遗传性乳光牙本质家系致病基因的初步定位 被引量:5 2000年 目的 研究遗传性乳光牙本质家系致病基因是否与染色体 4q2 1连锁。方法 提取在天津塘沽地区发现的一个遗传性乳光牙本质家系成员的外周血 DNA,选择染色体 4q2 1上的 4个短串联重复序列多态性标记 (short tandem repeatpolymorphism,STRP) :GATA6 2 A11、DSP(P)、SPP1和 D4S15 6 3做荧光标记 PCR、等位片段分析 ,用 L od连锁分析法分析该家系致病基因位点与上述 4个 STR的连锁关系。结果分别得到 13个家庭成员上述 4个位点的基因型和单体型。ML INK软件分析显示 :GATA6 2 A11、DSP(P)与致病基因位点连锁的最大 L od值分别为 1.6 3(θ=0 )和 1.6 8(θ=0 )。结论 遗传性乳光牙本质家系的致病基因初步定位在 张晓海 赵军 朱席琳 高山 李常福 范钰 刘萍 金英淑 张连云 邱长春 沈岩关键词:遗传性 致病基因 人3p24-p25478kb完全基因组序列的注释 2002年 目的对我国承担的人类基因组测序项目中的3p24-p25478kb完全基因组序列进行注释。方法采用从头预测、数据库相似性比较和全长或部分mRNA序列与基因组序列的比对等手段,识别基因组序列中的编码蛋白质的基因,并采用EMBOSS软件包分析基因组序列的组分特征。结果识别出该区域中的两个编码蛋白质的已知基因,即SLC6A1和SLC6A11(其中后者在基因组草图序列中未被定位);对这段基因组序列中组分特征预测分析结果显示,该基因组序列的平均GC含量为47%,并存在3个假想的CpG岛,其中两个CpG岛分别位于130685~131516bp及307090~307870bp,另一个位于415585~416308bp。结论采用上述方法对基因组序列3p24-p25478kb进行了正确的注释,揭示了基因组序列中的有关的基因结构、GC含量、CpG岛等信息。 丁克越 张以琳 陈立宏 沈岩关键词:人类基因组计划 基因组注释 基因结构 GC含量 CPG岛 一家系遗传性乳光牙本质治疗及修复的临床研究 2011年 目的:探讨遗传性乳光牙本质的临床治疗及修复方法。方法:选取天津市塘沽区遗传性乳光牙本质一家系成员,根管治疗患牙后分别采取覆盖义齿及桩核烤瓷冠修复,进行临床疗效评价。结果:桩核烤瓷冠修复效果较好,疗效可靠。结论:遗传性乳光牙本质临床上可以采取桩核烤瓷冠修复。 张青松 邢晓艳 赵军关键词:遗传性乳光牙本质 桩核 烤瓷冠 脆性X智力低下蛋白与NDK/Nm23-H2的相互作用 被引量:4 2001年 目的筛选与脆性X智力低下蛋白(FMRP)相互作用的蛋白,为FMRP生理功能的阐释提供新线索。方法以5月龄人胚海马mRNA为模板制备cDNA,重组于DNA激活结构域载体pGAD10,构建酵母双杂交文库,从中筛选与FMRP相互作用的蛋白。应用酵母双杂交体系对FMRP的相互作用区域进行定位。结果(1)所构建的5月龄人胚海马cDNA酵母双杂交文库含1×106克隆,插入片段平均长度约1.5kb,有效克隆90%;(2)在该文库中筛选到一个与FMRP相互作用的阳性克隆。序列分析表明:该克隆为人的核苷酸二磷酸激酶亚基B(NDK/Nm23-H2)cDNA;(3)NDK/Nm23-H2与缺少外显子12、14-17的FMRP异构体,以及含FMRP外显子1-12的克隆相互作用,而与FMRP外显子1-6、外显子2-7不能直接结合。结论人Nm23-H2在酵母细胞内能与FMRP结合,其相互作用区域定位于FMRP的前1-11个外显子。Nm23-H2具反式调控因子特性,FMRP与Nm23-H2的相互作用提示FMRP参与基因表达调控。这一发现有助于进一步研究FMRP在细胞核内的生物学功能。 楼蓉 梅品超 贡金英 朱宁 寇朝辉 吴冠芸 沈岩关键词:酵母双杂交体系 脆性X智力低下蛋白 脆性X综合征 遗传性疾病 早老蛋白氨基端与羧基端结构域的相互作用 被引量:1 2000年 目的研究早老蛋白分子相互作用及相互作用结构域。方法利用 RT- PCR扩增人早老蛋白- 1和早老蛋白- 2全长 cDNA。在此基础上构建多种缺失体,采用酵母双杂交体系分析它们之间的相互作用。结果 (1)早老蛋白- 1的氨基端多肽与羧基端多肽之间存在直接的相互作用,能形成同源二(多)聚体。早老蛋白- 1羧基端相互作用位点定位于第 361~ 447位氨基酸。这一相互作用不依赖于其旁侧亲水环结构功能域的存在,也无需其它配体参与;( 2)早老蛋白- 1氨基端片段或羧基端片段自身之间均不能形成同源二(多)聚体;( 3)早老蛋白- 2氨基端多肽与羧基端多肽之间也存在上述相互作用,能形成同源二(多)聚体;( 4)早老蛋白- 1的羧基端片段与早老蛋白- 2的氨基端片段、早老蛋白- 2的羧基端片段与早老蛋白- 1的氨基端片段不发生相互作用。结论早老蛋白氨基端多肽与羧基端多肽之间直接的相互作用可能参与、并有助于早老蛋白的装配和成熟,是其功能的结构基础。 梅品超 楼蓉 李兰英 周义 贡金英 陈雨亭 吴冠芸 沈岩关键词:早老蛋白 相互作用 早老性痴呆 用酵母双杂交体系筛选与FMRP相作用蛋白的cDNA 被引量:4 1998年 目的采用酵母双杂交体系寻找与脆性X智力低下蛋白(Fragile X men-tal retadation protein,FMRP)相互作用的蛋白,探讨FMRP的生物医学功能。方法以编码FMRP_(Pro327-Thr518)肽段的cDNA序列与pBTM116质粒DNA结合结构域重组作为"钓饵",从小鼠胚胎cDNA文库中筛选与之相互作用蛋白的cDNA。结果筛选出13个与FMRP_(Pro327-Thr518)肽段特异性地相互作用的克隆,其中12个为小鼠泛素转运酶9(UBC9),1个是在GenBank中无高同源序列的未知cDNA序列。结论小鼠UBC9与人UBC9的氨基酸序列完全相同,且FMRP与UBC9蛋白表达的时空特征相似,因此认为人UBC9是与FMRP相互作用的蛋白,其相互作用的生物学意义有待进一步研究。本工作表明酵母双杂交体系是研究蛋白质相互作用的有效方法。 陈雨亭 Anne Sittler 余珉 Barbara Bardoni 吴冠芸 Jean Louis Mandel 沈岩关键词:蛋白 酵母双杂交体系 CDNA