内蒙古自治区自然科学基金(2011MS0504)
- 作品数：7 被引量：4H指数：2
- 相关作者：蔡禄赵秀娟赵宏宇李珺王建英更多>>
- 相关机构：内蒙古科技大学中国科学院植物研究所中国科学院研究生院更多>>
- 发文基金：内蒙古自治区自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 酿酒酵母YPH499 Ⅲ号染色体上ARS形成核小体能力的比较
- 2014年
- 核小体定位是复制起始调控的重要因素,但是核小体定位是如何调控真核生物的复制起始,目前还不是很清楚。研究酵母Ⅲ号染色体上的不同活性复制起始序列形成核小体能力对探究真核生物DNA复制起始机制有着重要的生物学意义。酿酒酵母Ⅲ号染色体上的10个复制起始序列分为高活性和低活性两组复制起始序列,利用核小体体外组装技术,将回收纯化的高活性和低活性复制起始序列分别与组蛋白八聚体在体外进行梯度盐透析组装形成核小体,并进行Biotin标记检测,然后用Image J软件分析不同复制起始序列组装形成核小体能力的强弱。结果表明,用Image J软件对核小体组装能力强弱进行分析:ARS304>ARS303>ARS313>ARS302>ARS306>ARS314,ARS305,ARS307,ARS309,ARS315。低活性复制起始序列较高活性复制起始序列更易形成核小体;复制起始位点偏好出现于核小体缺乏区。
- 赵秀娟郑晓东薛涛涛蔡禄
- 关键词：酿酒酵母核小体定位
- 离散增量结合二次判别分析预测人类DNA甲基化位点
- 2012年
- DNA甲基化作为直接作用于DNA序列的一种表观遗传修饰,能够在不改变DNA分子一级结构的情况下影响基因表达,在生命活动中扮演着重要的角色.在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在C_pG二核苷酸的胞嘧啶上,并且在基因组中呈现不均匀分布.准确预测DNA甲基化位点有助于阐明DNA甲基化对基因表达的调控作用,并为肿瘤的早期诊断及治疗提供新的依据.本文应用离散增量结合二次判别分析的方法,对人类的C_pG二核苷酸甲基化状态进行了识别.5折交叉检验的整体准确率超过了80%,受试者操作特性曲线面积也达到了0.86.与现有方法相比,预测成功率显著提高.这说明离散增量结合二次判别分析方法适用于甲基化位点的预测;基因组序列中甲基化位点具有序列依赖性.
- 刘佳赵秀娟裴智勇秦笙蔡禄
- 关键词：DNA甲基化二次判别分析
- α因子调控酿酒酵母细胞同步化
- 2014年
- 利用α因子可以使MATa酵母细胞的生长停滞在细胞周期的G期，获得同步化的YKN-10酵母菌细胞，主要研究在25～200μg·mL^-1浓度下的n因子对酿酒酵母YKN-10对数早期细胞作用0～5h的同步化影响，每隔0．5h在荧光倒置显微镜下观察酵母细胞的出芽形态，记录细胞的出芽率，然后用SPSS17．0对酵母细胞的出芽率进行统计分析，α因子的浓度、α因子作用时间及二者的交互效应均对酵母细胞的平均出芽率有显著影响；α因子浓度在175～200μg·mL^-1下培养酵母细胞约3．5～4h时，酵母细胞基本上达到了同步化状态，运用α因子停滞细胞生长法获得了同步化的YKN-10酵母菌群体，为非Abarl突变菌株的同步化研究提供了参考．
- 郑晓东赵秀娟蔡禄王建英
- 关键词：细胞同步化出芽率芽殖酵母G1期
- 酿酒酵母ARS305侧翼序列对其自主复制活性的影响
- 2013年
- 利用PCR技术扩增了酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)Ⅲ号染色体上以ARS(Autonomously replicating sequence,ARS)305为核心的不同长度侧翼序列,并将其构建到酵母整合型载体pRS405中获得了重组质粒PA500、PA1000、PA2000,然后通过电转化法转入酿酒酵母细胞中,测定了不同ARS305片段对酵母转化效率及质粒在酵母中稳定性。结果表明,并非侧翼序列越长ARS活性越高,重组质粒PA1000具有比PA2000更高转化频率和转化稳定性,推测ARS两侧序列存在一些顺式和反式的调控机制影响ARS自主复制功能。
- 李珺张启声王馨赵秀娟蔡禄
- 关键词：重组质粒
- 5-溴脱氧尿嘧啶核苷标记酵母基因组DNA的方法被引量：2
- 2012年
- 胸腺嘧啶类似物5-溴脱氧尿嘧啶核苷(BrdU)标记技术是一种研究DNA复制、修复等生命过程的有效手段。由于酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中缺少胸腺嘧啶核苷酸补救途径,胞外BrdU不能有效的渗入到基因组中,使该技术在酿酒酵母中的应用受到极大制约。通过在基因组中引入单纯疱疹病毒胞苷激酶(HSV-TK)和人类平衡核苷转运蛋白(hENT1)基因,工作建立了BrdU标记酵母基因组DNA的方法。在生长对数中期加入0.2mg/ml BrdU,离体检测法检测发现,标记3h的荧光信号较1h、5h时强;胞内检测法结果显示,标记3h时55.3%的基因组DNA中能够渗入BrdU。该工作为酿酒酵母DNA复制、修复等方面提供了直接有效的研究方法。
- 赵宏宇赵玥王建英李珺蔡禄
- 关键词：5-溴脱氧尿嘧啶核苷酿酒酵母DNA复制
- 原核生物大肠杆菌基因组序列形成核小体能力的预测
- 2013年
- 以大肠杆菌基因组为研究对象,基于体外组装的核小体序列中k-mers频数信息,采用多样性增量结合二次判别算法对核心DNA和连接DNA进行分类预测,整体准确率和相关系数分别达到83.08%和0.619.对大肠杆菌、酵母和人类基因组中核小体定位序列与缺失序列中偏好的k-mers进行了比较,结果表明核小体缺失序列更为保守.
- 陈冰任松叶赵秀娟蔡禄
- 关键词：大肠杆菌基因组核小体定位
- 与人遗传病相关的DNA重复序列的体外核小体定位特性被引量：2
- 2013年
- 目的研究与人遗传病相关的DNA重复序列的体外核小体定位。方法构建含有(GAA)42、(ATTCT)43、(GCCT)18和601序列的重组质粒,体外利用盐透析将质粒与组蛋白八聚体组装形成染色质结构,微球菌核酸酶消化后,用琼脂糖凝胶电泳分析染色质的结构。结果含有ATTCT重复序列的质粒较含GAA重复序列质粒在体外易于形成核小体。结论在重组质粒中,由于引入的重复序列片段形成核小体能力的不同会影响其局部染色质结构。
- 柴荣赵宏宇蔡禄
- 关键词：DNA重复序列核小体定位染色质结构
