北京市属高等学校人才强教计划资助项目(PHR20100718) 作品数:10 被引量:50 H指数:4 相关作者: 张卓勇 相玉红 黄安民 宋静林 杨帆 更多>> 相关机构: 首都师范大学 中国林业科学研究院 首都医科大学附属北京妇产医院 更多>> 发文基金: 北京市属高等学校人才强教计划资助项目 北京市自然科学基金 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 理学 化学工程 自动化与计算机技术 更多>>
人工神经网络结合近红外光谱用于木材树种识别 被引量:18 2012年 测量了不同产地及品种的89个木材样品的近红外光谱,并分别使用反向传播人工神经网络(backpropagation artificial neural networks,BPANN)与广义回归神经网络(generalized regression neural network,GRNN)建立了NIRS树种识别模型。通过方差分析分别选择两种神经网络所用参数,并采用最优参数进行网络训练。考虑到样品光谱的差异,对含不同水平白噪声与不同水平偏置的光谱进行模拟,并使用建立的模型对模拟光谱进行预测。发现两种神经网络模型均有较好的预测结果,其中BPANN模型,对含偏置水平不高于2%、噪声水平不高于4%的模拟光谱识别正确率在97%以上;GRNN模型,对含偏置水平不高于2%、噪声水平不高于4%的模拟光谱识别正确率在99%以上。 马明宇 王桂芸 黄安民 张卓勇 相玉红 顾轩关键词:人工神经网络 近红外光谱 方差分析 正交信号校正用于子宫内膜癌组织的近红外光谱诊断研究 光谱预处理对于光谱的解析和建模具有重要的影响。讨论了一种加强正交信号校正方法(emphaticorthogonal signal Correction,EOSC),并与主成分正交信号校正(principal compon... 张卓勇 张家进 相玉红关键词:子宫内膜癌 近红外光谱分析技术 文献传递 苯甲酰氨类HDAC2抑制剂的3D-QSAR及虚拟筛选研究 被引量:2 2014年 本文应用传统比较分子力场分析法CoMFA,比较分子相似性指数法CoMSIA和Topomer CoMFA方法,对组蛋白去乙酰化酶2(HDAC2)的苯甲酰胺类抑制剂进行了构效关系和基于药效团的筛选研究。基于分子片段建模的Topomer CoMFA的交叉验证系数q^2为0.594,预测相关系数r^2_(pred)为0.973。基于对接活性构象叠合得到的CoMFA,CoMSIA的交叉验证相关系数q^2分别为0.634,0.561,预测相关系数r^2_(pred)分别为0.905,0.68。基于药效团模型011叠合的CoMFA,CoMSIA交叉验证相关系数q^2分别为0.588,0.592,预测相关系数r^2_(pred)分别为0.68,0.859。结果表明这5个3D-QSAR模型均具有良好的稳定性和预测能力。另外,由18个活性较高结构多样的分子建立了可靠的药效团模型。运用药效团模型011和016对NCI数据库进行筛选,将筛选得到的分子与HDAC2蛋白酶进行分子对接,并由PASS进行活性验证,最终得到了18个分子,且对接打分值都大于6,可作为新的HDAC2抑制剂。 齐娜 宋静林 相玉红 张卓勇关键词:药效团 3D-QSAR 人工神经网络-近红外光谱法测定桉树中综纤维素的含量 被引量:1 2011年 采用近红外光谱技术结合广义回归神经网络(GRNN)建立测定桉树中综纤维素的定量分析模型。以72个桉树样品作为实验材料,对光谱数据进行平滑、求导、压缩以及归一化,用桉树的近红外光谱数据建立广义回归神经网络模型.预测模型的预测均方根误差为0.0198。结果表明,该方法测量比较准确,可以用于桉树中综纤维素含量的预测。 焦淑菲 黄安民 相玉红 张卓勇关键词:广义回归神经网络 近红外光谱 桉树 综纤维素 Logistic回归算法结合近红外光谱对子宫内膜癌组织切片分类的研究 被引量:4 2013年 子宫内膜癌是一种常见的妇科癌症。实验将Logistic回归作为一种建模方法引入到子宫内膜癌分类诊断模型中。77个样本通过主成分判别分析和支持向量机判别分析进行降维,应用拉丁配分方法选择训练集和测试集并确定Logistic回归模型参数。结果表明,Logistic回归模型不仅能够对样本进行正确的分类,而且能将样本的分类归属趋势与临床诊断结果很好的一致。主成分判别分析结合Logistic回归有望发展为一种近红外光谱检测癌症组织的新方法。 张家进 张卓勇 相玉红 杨帆关键词:子宫内膜癌 近红外光谱 LOGISTIC回归 过渡金属脒配合物的合成与应用研究进展 2011年 脒及其衍生物是一类具有广泛而良好生物活性的有机物,也是重要的有机合成中间体。脒作为一类良好的配体,具有多种成键类型,所生成的脒过渡金属配合物也具有很多特殊性质与重要用途。本文主要综述了脒配合物合成方法的进展及其性能与应用。其中腈胺加成"一锅"法制备脒配合物的有效性和方便性,不但可以利用过渡金属诱导有机腈与胺耦合成脒,而且在原位就可直接与金属配位得到过渡金属脒配合物。 于博 刘灏 姚敏 邓玉恒基于主成分正交信号校正算法和加强正交信号校正算法对柑桔酸度的检测 被引量:5 2012年 应用便携式近红外光谱分析仪对112个柑桔进行无损检测,运用主成分正交信号校正、加强正交信号校正结合广义回归神经网络的方法分别建立柑桔酸度定量分析模型。结果表明:采用EOSC方法能够使模型具有良好的预测能力并能够防止对数据造成过度校正。EOSC柑桔酸度模型校正集相关系数Rc=0.888 0,预测集相关系数Rp=0.885 6,RMSEP=0.081 65。研究结果表明EOSC预处理方法结合广义回归神经网络可以用于柑桔样本的酸度测定。 杨帆 邱晓臻 郝睿 高帆 杜薇 张卓勇关键词:近红外光谱 柑桔 酸度 亲电酮类HDAC抑制剂的3D-QSAR和分子对接研究 被引量:4 2011年 组蛋白去乙酰化酶抑制剂(histone deacetylase inhibitor,HDACi)是近年来治疗癌症的重要靶向药物,其中羟氨酸类,苯甲酰胺类多种药物已进入临床试验阶段,但对于亲电酮类HDACi还有待于进一步研究,本研究应用比较分子力场分析法(comparative molecular field analysis,CoMFA),比较分子相似性指数法(compara-tive similarity indices analysis,CoMSIA)对29个亲电酮类HDAC抑制剂分子进行了定量构效关系分析,CoMFA模型的q2=0.668,r2=0.999;CoMSIA模型的q2=0.686,r2=0.995,所建模型预测能力较好。分子对接(sur-flex-dock)研究也进一步揭示出抑制剂分子与蛋白酶的作用模式,结合其作用模式比较合理地探讨了这类抑制剂的活性原因,为设计新型高效的亲电酮类HDACi提供了理论依据。 赵彩红 相玉红 张卓勇关键词:组蛋白去乙酰化酶抑制剂 分子对接 基于近红外光谱和支持向量机的子宫内膜癌早期诊断研究 被引量:5 2011年 近红外光谱结合化学计量学方法对癌症的辅助诊断已有了文献报道。该文测定了77例不同生理阶段的子宫内膜组织病理切片的近红外光谱,对其分别进行多元散射校正(MSC)、正交信号校正(OSC)以及二者联用的预处理方法,采用拉丁配分法选择3/4样本作为训练集,1/4样本作测试集,建立支持向量机(SVM)模型进行分类,并与基于同样预处理方法建立的偏最小二乘(PLS)模型分类结果进行了比较。SVM对正常、增生和癌变三类不同的组织样品分类结果较好,总分类正确率约92%,好于PLS模型的结果(最高正确率90%)。研究结果表明,光谱数据的预处理和建模方法对分类结果有重要影响,SVM结合子宫内膜组织的近红外光谱有望发展成为一种新型的肿瘤诊断方法。 翟玮 相玉红 代荫梅 张家进 张卓勇关键词:近红外光谱 子宫内膜癌 支持向量机 一种正交信号校正方法在子宫内膜癌组织诊断中的应用 正交信号校正法(OSC)可去除复杂的背景同时保留有用的信息。各种不同的正交信号校正法均基于找到一组与类别差异信号正交的空间基向量。因此各种方法的不同在于寻找这组基向量的方法。NIRS中充斥着各种无用的干扰噪声,比如复杂体... 张卓勇 张家进 相玉红 代荫梅 梁学爱 Peter de B.Harrington关键词:子宫内膜癌 近红外光谱分析 正交信号校正