国家自然科学基金(30571323)
- 作品数：40 被引量：159H指数：7
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- 相关机构：扬州大学盐城师范学院南通大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江苏省高校自然科学研究项目国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 新疆阿勒泰羊MSTN基因序列的多样性分析被引量：2
- 2010年
- 为进一步探究新疆阿勒泰羊的遗传分化状况,根据普通绵羊的MSTN基因设计引物,用PCR的方法扩增并对新疆阿勒泰羊MSTN基因编码区进行测序,并与绵羊以及Gen-Bank上5个物种相应基因编码区核苷酸序列进行比对分析。结果表明:在阿勒泰羊群体内部亲缘性较高,同时测得阿勒泰羊MSTN基因和绵羊、山羊、普通牛、猪、家鼠、鸡的同源性大小分别是99.9%,99.5%,96.4%,94.6%,89.5%,82.3%,依据序列构建的分子进化树显示表明MSTN基因具有很高的保守性,适合研究物种的进化分析,为新疆阿勒泰羊的遗传资源保护,开发与利用提供分子遗传学方面的基础。
- 李锐杨章平冀德君毛永江张小龙常洪
- 关键词：阿勒泰羊MSTN基因遗传分化
- 雷琼牛Cyt b基因序列分析及其分子系统发生探讨
- 2007年
- 通过对20头雷琼牛(Bos indicus)细胞色素b(Cyt b)基因序列(1 140 bp)的比对和分析,共发现7个变异位点,定义了6种单倍型。经与GenBank上6个牛种的Cyt b基因序列进行比较,分析其碱基组成和核苷酸序列变异,计算不同牛种间的kimura双参数遗传距离。以亚洲水牛(Bubalusbubalis)为外群,应用邻接法构建牛属动物分子系统发育树。结果表明:雷琼牛与印度瘤牛(Bos indicus)一样同属于典型的瘤牛,但两者有明显的区别,推测中国可能是世界瘤牛的发源地之一,不支持雷琼牛含有爪哇牛(Bos javanicus)血统的观点。
- 李世平常洪陈宏宇马国龙
- 关键词：细胞色素B基因分子系统发生
- 江苏地方山羊不同地域群体间的遗传分化被引量：1
- 2008年
- 在采用多座位电泳法检测江苏地方山羊群体结构基因座遗传变异的基础上,分析群体间的遗传分化水平并探讨了影响群体遗传分化的主要因素。结果显示,4个山羊群体间的遗传分化系数在0.0067-0.0368之间,平均仅为0.0177,说明群体间的遗传分化水平很低,遗传变异绝大部分存在于群体内;不同地域山羊群体的分布符合地理隔离模式,而且群体间的基因流十分通畅;亲缘关系的模糊聚类结果与已知的品种史也是吻合的。据此可认为,大而通畅的基因流是江苏4个地方山羊群体间遗传分化水平很低的主要原因,而生境异质性则是引起群体发生轻微遗传分化的原因。
- 王兰萍耿荣庆常洪杨章平孙伟冀德君王庆华
- 关键词：山羊遗传分化基因流地理隔离
- 中国牛亚科6个物种MSTN基因外显子2多态性及分化研究被引量：7
- 2009年
- 采用PCR扩增了6个中国牛种共101个样本的MSTN基因外显子2的编码区,序列分析显示,MSTN基因外显子2编码区含372个碱基对,在所检测样本中,存在10个核苷酸多态位点,定义了7种单倍型,雷琼牛、蒙古牛、独龙牛与巴音郭楞牦牛享有共同的单倍型;MSNT基因外显子2在6个牛种中多态性较丰富。结果表明:两水牛与牛属群体间分化明显;牛属群体中牦牛独自聚成一类;大额牛存在一个独立分支;雷琼牛与一部分独龙牛、大部分蒙古牛和瘤牛聚成一支,说明蒙古牛、雷琼牛、独龙牛种间存在着基因交流。牦牛与普通牛、瘤牛的分化较明显,亲缘关系较远;研究证实了水牛的属分类地位,一定程度上支持牦牛及大额牛划为牛亚科中单独的一个属。
- 冀德君常春芳常洪耿荣庆李永红
- 关键词：MSTN基因多态性
- 青海高原牦牛遗传多样性研究被引量：8
- 2008年
- 以中心产区简单随机抽样在青海省西宁市共抽取青海高原牦牛76头,用垂直平板聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)和水平淀粉凝胶电泳技术检测21个编码血液蛋白(酶)结构基因座及12个微卫星位点的多态性,并进行中性检验及连锁不平衡分析。结果表明:在所检测的21个血液蛋白基因座中,有6个存在多型,多态位点百分比为28.57%,12个微卫星位点全部为多态,共检测出63个等位基因;两层次标记所反映的群体内遗传变异水平均较低,21个血液蛋白基因座平均有效等位基因数、观察杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别为1.118、0.0665、0.0729和0.0603,12个微卫星位点相应指标分别为2.9005、0.4138、0.5325和0.4903;除Alp外,其余5个血液蛋白多态基因座和12个微卫星位点均为中性基因。除Alp-CA、LDH1-ADH两对血液蛋白基因座和8对微卫星显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)处于连锁不平衡状态外,其余13对血液蛋白基因座和58对微卫星均处于连锁平衡状态(P>0.05);另外,6个血液蛋白多态基因座、12个微卫星位点或是两者的合并数据从群体水平上均处于连锁平衡状态(P>0.05)。
- 毛永江常洪杨章平张柳宋光明王小龙
- 关键词：青海高原牦牛微卫星
- 3个中国地方黄牛品种遗传结构及其遗传分化的研究被引量：15
- 2007年
- 利用12对微卫星引物对中国3个地方黄牛品种(鲁西黄牛、渤海黑牛及闽南黄牛)及2个对照群体(中国荷斯坦牛和青海牦牛)的群体遗传结构、遗传分化及基因流水平进行研究,结合聚类分析,结果表明:5个牛群体总近交系数(Fit)为58.5%,群体内近交系数(Fis)为43.2%,群体间基因分化系数(Fst)为26.9%,3个指标均达到极显著水平(P<0.001)。5个牛群体内近交系数(Fis)鲁西黄牛最高(0.640),青海牦牛最低(0.231)。鲁西黄牛与荷斯坦牛间每世代群体间有效迁移个体数(Nem)最大(1.149),牦牛与鲁西黄牛间最小(0.509)。5个牛群体每个体属于所属群体的平均概率从91.4%到98.5%不等。结合聚类分析、基因流分析及STRUCTURE分析结果,5个牛群可分为3大类:鲁西黄牛和中国荷斯坦牛为一类,渤海黑牛和闽南黄牛为一类,牦牛自为一类,这说明在鲁西黄牛和渤海黑牛的形成过程中,鲁西黄牛受普通牛影响较大,而渤海黑牛受瘤牛影响较大,同时探讨了以上品种的演化与形成过程。
- 毛永江常洪杨章平张柳许明孙伟常国斌宋光明Henner Simianer
- 关键词：遗传分化鲁西黄牛渤海黑牛闽南黄牛微卫星
- 雷琼牛肌肉生长抑制素基因序列研究被引量：2
- 2008年
- 通过PCR方法对18头雷琼牛的MSTN基因进行扩增、测序。编码区序列分析结果表明:雷琼牛MSTN基因比外域瘤牛存在较丰富的多态性,共发现4个突变位点(2个转换,2个颠换),定义了6种单倍型,群体单倍型多样性较高(0.810±0.057);分析结果表明:MSTN基因的相关突变的发生可能早于Bos属瘤牛、普通牛、牦牛的分化;在瘤牛种内,我国南方的瘤牛可能是更原始的种群。
- 常春芳常洪冀德君耿荣庆李世平李永红马国龙陈宏宇宋光明
- 关键词：MYOSTATIN基因单倍型
- 青海高原牦牛血液蛋白基因座群体遗传学分析被引量：3
- 2008年
- 以中心产区简单随机抽样在青海省西宁市共抽取青海高原牦牛76头,用垂直平板聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)和水平淀粉凝胶电泳技术检测21个编码血液蛋白(酶)结构基因座的多态性,并进行中性检验及连锁不平衡分析。结果表明:在所检测的21个基因座中,有6个存在多型,多态位点百分比为28.57%,群体内遗传变异水平相对较低,21个基因座平均有效等位基因数、观察杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别为1.118、0.0665、0.0729和0.0603。CA、LDH1和ADH 3个基因座杂合子缺失达到极显著水平(P<0.001),而Alp杂合子呈极显著增加状态(P<0.001)。除Alp外,其余5个多态基因座均为中性基因。除Alp-CA和LDH1-ADH 2对基因座组合处于连锁不平衡状态外,其余13对基因座组合和群体水平上均处于连锁平衡状态(P>0.05)。
- 毛永江常洪杨章平宋光明王小龙
- 关键词：群体遗传学青海高原牦牛
- 雷琼牛母系起源的遗传学证据被引量：10
- 2008年
- 在测定雷琼牛线粒体Cyt b基因全序列的基础上,引用其它牛种的序列资料,以探讨雷琼牛的起源演化。雷琼牛Cyt b基因全长1 140 bp,存在2个突变位点,碱基A+T的平均含量(56.8%)明显高于碱基G+C的平均含量(43.2%),第3密码子表现出较强的碱基组成偏倚。以Cyt b基因单倍型序列构建的系统发育树表明,雷琼牛3个地域群Cyt b基因所有的单倍型都与瘤牛聚为一类,从母系遗传的角度确认雷琼牛起源于瘤牛。Cyt b基因单倍型间的进化网络关系分析发现,雷琼牛与亚洲其它地区的瘤牛共享一条祖先序列,表明它们可能是在不同的地点由野生的瘤原牛独立驯化而来的,进一步推论中国南方某些地区在史前也应该是一个独立的瘤原牛驯化中心。
- 耿荣庆常洪冀德君王兰萍常国斌李世平马国龙陈宏宇常春芳李永红
- 关键词：CYTB基因母系起源
- 中国牛亚科家畜GH基因编码区序列的遗传变异研究被引量：3
- 2008年
- 采用PCR产物直接双向测序法，分段扩增普通牛、瘤牛、牦牛、大额牛和亚洲水牛共5个牛种的GH基因，并拼接成编码区全序列，分析中国牛亚科家畜不同牛种GH基因编码区序列变异及其分子进化特征。结果表明，牛GH基因编码区序列全长654bp，种间核苷酸突变率在0．1％～1．84％。5个牛种编码区序列定义了10种单倍型，瘤牛的单倍型多样性最高，大额牛和水牛均无单倍型多样性。GH基因编码区序列的密码子使用存在偏倚性，共发现了25个偏好性密码子。核苷酸的替代以转换为主，转换明显高于颠换，转换／颠换比为3．0。非同义突变位点远远少于同义突变位点，同义与非同义替代发生的速率比都小于或等于1，表明GH基因编码区序列不受达尔文正选择的影响。以GH基因单倍型序列为基础的分子进化树表明，水牛与普通牛、瘤牛、牦牛、大额牛间分化很明显；普通牛、瘤牛、牦牛、大额牛间序列分化并不明显，并且它们共同拥有一条相同的祖先核苷酸序列。说明中国牛亚科家畜GH基因编码区序列的变异相当贫乏，并且由于功能的约束表现得相当保守，进化速率相当缓慢。
- 耿荣庆常洪李永红冀德君常春芳王兰萍常国斌
- 关键词：牛亚科生长激素基因分子进化
