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上海市自然科学基金(12ZR1420400)

作品数:34 被引量:34H指数:3
相关作者:李代禧刘宝林刘立余华星张燕更多>>
相关机构:上海理工大学上海交通大学海南灵康制药有限公司更多>>
发文基金:上海市自然科学基金上海市教育委员会重点学科基金国家自然科学基金更多>>
相关领域:化学工程理学自动化与计算机技术医药卫生更多>>

文献类型

  • 33篇中文期刊文章

领域

  • 13篇化学工程
  • 12篇理学
  • 10篇自动化与计算...
  • 8篇医药卫生
  • 2篇生物学
  • 1篇轻工技术与工...
  • 1篇一般工业技术

主题

  • 20篇分子
  • 11篇动力学
  • 10篇分子动力学
  • 10篇分子模拟
  • 9篇胰岛
  • 9篇胰岛素
  • 6篇活性
  • 5篇动力学模拟
  • 5篇稳定性
  • 5篇分子动力学模...
  • 5篇包合
  • 4篇蛋白
  • 4篇包合物
  • 3篇低温保护剂
  • 3篇冻干
  • 3篇药物
  • 3篇依那西普
  • 3篇离子
  • 3篇解离
  • 3篇抗氧化

机构

  • 31篇上海理工大学
  • 7篇上海交通大学
  • 1篇台湾中山大学
  • 1篇天津大学
  • 1篇复旦大学上海...
  • 1篇石家庄制药集...
  • 1篇国立中山大学
  • 1篇上海东富龙科...
  • 1篇海南灵康制药...

作者

  • 30篇李代禧
  • 14篇刘立
  • 14篇刘宝林
  • 13篇余华星
  • 11篇翟振
  • 11篇张燕
  • 9篇潘琦
  • 6篇魏冬青
  • 6篇柴培
  • 3篇张冬兵
  • 2篇陈正隆
  • 2篇刘亚茹
  • 2篇徐斐
  • 2篇王丹丹
  • 2篇潘晓莉
  • 1篇蔡东晨
  • 1篇胥义
  • 1篇周国燕
  • 1篇袁敏
  • 1篇龚俊波

传媒

  • 10篇计算机与应用...
  • 3篇高等学校化学...
  • 3篇中国药学杂志
  • 3篇化工学报
  • 3篇生物医学工程...
  • 2篇应用化工
  • 2篇上海理工大学...
  • 2篇制冷学报
  • 1篇食品工业科技
  • 1篇原子与分子物...
  • 1篇软件
  • 1篇Chines...
  • 1篇现代食品科技

年份

  • 5篇2019
  • 2篇2018
  • 1篇2017
  • 5篇2016
  • 10篇2015
  • 5篇2014
  • 4篇2013
  • 1篇2012
34 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
Improvement in the Stability of Gabapentin by the Complexation of Gabapentin with Different Metal Ions: a DFT Study
2019年
Gabapentin undergoes intramolecular cyclization by alkylamine nucleophilic attacking on carboxylate carbonyl. And the above self-dehydration condensation can produce gabapentin lactam which has some toxic effects. Therefore, in order to decrease the above subsidiary reaction, the effects of several metal ions on the reaction mechanism and the potential barriers of self-dehydration condensation of gabapentin are analyzed. Each molecular structure of gabapentin in the presence of several metal ions is optimized using the density functional theory(DFT) with B3LYP method at the 6-311+G(d,p) basis set level. And its geometric and thermodynamic parameters are also investigated. The calculated results showed that gabapentin can form stable complexes with divalent metal ions and exhibit the highest affinity for small and highly charged metal cations. The binding ability of these metal ions with gabapentin ranks in an order of Fe^2+>Zn^2+> Mg^2+> Ca^2+> Na^+> K^+. Besides, the potential barriers of subsidiary reaction of gabapentin increase obviously in the presence of several metal ions than that of free gabapentin. This means that the above metal ions can inhibit effectively the intramolecular cyclization of gabapentin.
YANG Li-XiangLI Dai-XiLIU Bao-LinGUO Bai-SongWEI Dong-Qing
关键词:GABAPENTINBARRIERSTABILIZATION
维生素C和羟基酪醇抗氧化性的理论研究被引量:3
2015年
运用量子化学计算,模拟了维生素C和羟基酪醇在真空、非极性溶剂(四氯化碳)和极性溶剂(水)3种环境下发生氧化反应的机理,探究了其在3种环境下的抗氧化活性。通过分析维生素C和羟基酪醇的自由基解离焓、质子解离焓、绝热电离电位、最高占有轨道(HOMO)和最低空轨道(LUMO),我们得到维生素C的抗氧化性稍强于羟基酪醇。表现为不论在真空、极性溶剂,还是在非极性溶剂中,质子解离焓均远大于自由基解离焓,这说明二者抗氧化性的机理均为自由基反应,而且都是两个羟基同时均裂的协同反应。在不同的溶剂环境中,二者的自由基解离焓均相差不大,这表明溶剂环境的极性对于其抗氧化能的影响不大,证明维生素C和羟基酪醇是一类以自由基均裂反应为主的优良抗氧化剂。
潘琦李代禧柴培刘立余华星刘宝林
关键词:抗氧化维生素C
低温保护剂对关节软骨冻结过程中热膨胀行为的定量构效关系研究
2015年
在对关节软骨进行低温保存时,常常缺乏对实验条件和保护剂种类的筛选依据。本论文通过计算不同醇类保护剂的分子结构描述符,利用GFA模型,对筛选后的分子结构描述符建立了关于猪软骨冷冻过程中结晶焓及热应变的QSAR模型。两种模型的R2和Rpre2分别为0.931、0.881和0.845、0.733,均具有良好的拟合性和预测性。通过对模型的分析,发现保护剂分子极性面积越大,脂水分配系数越高,保护剂发挥的保护作用越强;而所添加的保护剂羟基数和碳原子数合适配比时,结晶焓值较小,保护效果更佳;降温速率和保护剂浓度仍然是影响结晶焓和热应变的主要因素。其中,降温速率对结晶焓的影响受到保护剂分子量的制约,而对热应变的影响则存在最佳降温速率(3℃/min)。可以看出,保护剂的分子结构是决定低温保护效果的重要因素,利用建立的QSAR模型可以实现对冷冻条件的优化。
余华星李代禧徐斐柴培潘琦王丹丹
关键词:定量构效关系热膨胀冷冻保护剂
低温干燥过程中LEA-motif对热敏性药物胰岛素的活性保护研究被引量:1
2014年
用LEA蛋白特征重复片段作为干燥活性保护剂,研究其对热敏性胰岛素的干燥保护效果和作用机理。结果表明,LEA-motif保护的胰岛素的三维活性结构保持良好,并且氨基酸残基振动明显减弱,LEA-motif保护的胰岛素六聚体冻干后的效价稳定,说明LEA蛋白特征重复片段对热敏性蛋白药物有良好的干燥活性保护效果。
张燕李代禧郭柏松翟振刘立杨春生余华星
关键词:胰岛素分子模拟效价
依那西普抗体的活性结构保护被引量:1
2018年
采用Gromacs软件,利用分子动力学模拟方法,研究了在真空干燥及水溶液环境下,抗体蛋白药物依那西普在不同保护剂体系中分子结构的稳定性。通过分析依那西普的结构变化以及抗体蛋白与保护剂之间的相互作用,采用单因素方差法,给出了不同保护体系与抗体蛋白之间的差异。结果表明,海藻糖–甘露醇复合保护体系和蔗糖–甘露醇复合保护体系对抗体蛋白的稳定效果明显优于海藻糖单一保护体系,其中海藻糖–甘露醇复合保护体系对依那西普抗体蛋白活性结构的保护效果最好。这说明不同的小分子保护剂可以协同保护蛋白药物的活性结构,溶剂化环境对于抗体蛋白的稳定性具有显著影响,而真空冷冻干燥可以提高其结构的稳定性。
房筱李代禧郭柏松杨春生
关键词:依那西普稳定性
尿素(520)晶面可控结晶的分子动力学模拟被引量:1
2019年
由于尿素结晶呈白色针状,晶貌单一,且传统结晶工艺不可控,严重影响药物的一致性评价结果。采用分子动力学模拟方法,从分子水平上研究不同种类的添加剂对尿素晶体生长的调控作用,揭示添加剂对药物晶体生长的调控机制。结果表明:(1)六种添加剂(海藻糖、蔗糖、葡萄糖、山梨醇、赖氨酸、精氨酸)在101.325kPa、290 K下相较于无添加剂时都能不同程度地抑制(520)晶面的生长;(2)添加剂对尿素晶面(520)的吸附能越负,其抑制晶面生长效果越好,其中海藻糖抑制(520)晶面生长效果最好;(3)添加剂分子携带基团的种类与数目决定与晶层的相互作用的强弱,特别是海藻糖、蔗糖双糖类分子含有8个羟基,与晶层上的尿素分子氢键相互作用强,与溶液层中的溶质形成竞争性吸附,能更好抑制(520)晶面生长。
蔡惊涛李代禧刘宝林栾翰森郭柏松魏冬青王浩
关键词:分子模拟添加剂
含巯基小分子药物抗氧化活性及机理研究
2015年
本文利用量子化学方法,分别对R型硫普罗宁,S型硫普罗宁,青霉胺,N-乙酰半胱氨酸和半胱氨酸,这5种含巯基小分子药物,在极性溶剂(水)和非极性溶剂(四氯化碳)下的抗氧化活性进行比较研究。在B3LYP/6-311++G(d,p)基组下,得到5种化合物的优化结构、解离焓(BDE)、质子解离焓(PDE)、键长、前线轨道能级。通过计算,发现虽然巯基的抗氧化性会随着溶剂极性的变化有一定的改变,但无论是极性还是非极性溶剂下,含巯基小分子药物消除自由基的反应机理仍主要倾向于S-H键断裂的自由基反应,5种含巯基小分子药物的抗氧化活性强弱顺序依次为:R型硫普罗宁>S型硫普罗宁>D-青霉胺>半胱氨酸>N-乙酰半胱氨酸。通过S-H键键长分析,发现S-H键键长的结果与解离焓结果具有较高一致性,说明S-H键键长可用于含巯基药物的抗氧化活性研究。
刘立李代禧潘琦余华星柴培陈正隆刘宝林
关键词:巯基密度泛函理论抗氧化活性
As^(3+)与DNA4种碱基相互作用的理论研究被引量:1
2015年
砷在进入生物体后,可通过对基因损伤和基因表达等多方面的影响而发挥其毒性。本文运用量子化学计算,研究了As3+与DNA4种碱基的配位作用。从理论上确立了As3+与4种碱基的配合特征和各种配合物的相对稳定性以及As3+对4种碱基配合的选择性。当As3+与碱基结合时,最多能与3个碱基配体形成稳定构型,我们共得到17个稳定的三配体配合物。其中,As3+与O和N所形成配位键As-O和As-N的键长范围分别为(1.76~1.85)?和(1.88~2.01)?。As3+与4种不同碱基作用时,倾向与鸟嘌呤发生配位反应,且易于结合位点羰基O处发生反应。
柴培李代禧潘琦徐斐余华星刘立袁敏
关键词:砷中毒分子识别鸟嘌呤
胰岛素活性结构在水合离子液体中的稳定性被引量:1
2017年
离子液体以其独特的、可修饰的分子结构以及优良的物理化学性质被应用于蛋白质的稳定性研究。采用分子动力学模拟方法及微量热法,研究热敏性蛋白药物胰岛素在不同水质量分数下水合离子液体中活性结构的稳定性,并深入分析离子液体与胰岛素之间的相互作用及水分子与蛋白质稳定性之间的关系。研究结果表明,当水质量分数低于25.00%时,胰岛蛋白的热变性温度能保持在68℃以上。且通过模拟分析得出,含水量25.00%的水合离子液体体系中,大量阴、阳离子在胰岛蛋白表面聚集,并通过较强的静电相互作用吸附在其表面,从而对蛋白质的活性结构展现出良好的稳定效果。结合宏观实验研究及微观动力学计算阐释了不同水含量的离子液体稳定蛋白质的作用机理,并为离子液体对蛋白质的稳定作用研究提供了一种新的分析方法。
潘晓莉李代禧魏冬青
关键词:离子液体胰岛素蛋白质稳定性分子模拟微量热法
Bukn还原型硫辛酸抗氧化活性的理论研究
2015年
硫辛酸是一种强抗氧化剂,本文运用量子化学计算,模拟了还原型硫辛酸即二氢硫辛酸(DHLA)和谷胱甘肽(GSH)在真空、水和四氯化碳3种溶剂环境中发生氧化反应的过程,来研究它们在这3种溶剂条件下的抗氧化活性。以GSH作对比,分析得出DHLA上的巯基抗氧化活性较强,且其作用机理为2个S-H键同时发生断裂。此外,通过对比分析真空和溶剂环境中的键解离焓、质子解离焓和HOMO、LUMO能级差值,发现溶剂环境极性越大,越容易发生电子转移反应:极性越小,越易发生自由基反应。
柴培李代禧陈雯霞刘立潘琦余华星王丹丹
关键词:抗氧化谷胱甘肽巯基
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