国家自然科学基金(30971985) 作品数:9 被引量:59 H指数:5 相关作者: 胡桂兵 王惠聪 胡福初 赵志常 杨转英 更多>> 相关机构: 华南农业大学 中国热带农业科学院 海南省农业科学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家现代农业产业技术体系建设项目 国家科技支撑计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
荔枝果皮MADS-box基因的克隆与初步表达分析 被引量:1 2012年 采用RT-PCR结合RACE技术从‘糯米糍’荔枝果皮中克隆到了1个1 208 bp的MADS-box基因,命名为LcMADS9。该基因包含1个738 bp的完整的开放阅读框,编码245个氨基酸,具有典型的MADS-box基因结构,其编码的蛋白与其它植物的MADS-box蛋白有较高的一致性,其中与欧洲白桦(Betula pendula)的同源性高达80%。系统发育树分析结果表明,LcMADS9基因属于MADS-box基因家族中AP1/SQUA-like亚家族。实时荧光定量PCR分析结果表明,该基因在叶片、果皮和花中均有表达,而在根、茎和果肉中几乎没有表达。 肖靖 赖彪 赵志常 秦永华 胡桂兵关键词:荔枝 果皮 荔枝类黄酮糖基转移酶(UFGT)基因的克隆及其原核表达研究 被引量:11 2011年 类黄酮糖基转移酶(UFGT)可以把不稳定的花色素催化成花色素苷,是花色素苷合成过程中的最后一个酶。在一定范围内,类黄酮糖基转移酶活性与花色素苷的合成呈现正相关,抑制UFGT酶活性比抑制其他酶更能影响花色素苷的合成。很多研究结果表明,UFGT是花色素苷合成的关键酶基因。本研究根据在荔枝上已知的UFGT基因片段,采用3′RACE和5′RACE技术克隆得到UFGT的全长cDNA。采用特异引物扩增得到该基因的基因组DNA的全长序列,发现该基因含有一个内含子。将该基因全长cDNA序列构建到原核表达载体pET32a中,通过1 mmol/L IPTG诱导表达,得到大约60 KDa的融合蛋白。 赵志常 胡福初 胡桂兵 王惠聪 杨转英 苏纯兰 李加强关键词:荔枝 花色素苷 基因克隆 原核表达 荔枝ANS基因的克隆及其序列分析 被引量:9 2012年 以3个不同发育时期的‘糯米糍’荔枝果皮和幼嫩叶片为试材,对其ANS基因进行了克隆及分析。结果表明:花青素合成酶(Anthocyanidin synthase,ANS)是花色素苷生化合成途径中的一个关键酶。利用同源克隆方法从荔枝果皮中克隆得到了1个ANS基因,该基因开放阅读框的长度为1 074bp,编码357个氨基酸。以基因组为模板,扩增得到了1 279bp的核苷酸序列与cDNA序列比对发现,基因组序列中还有1个内含子,位置在504~708bp之间。通过系统发育分析发现,该基因编码的蛋白与葡萄、可可豆、柑橘等聚为一类。 赵志常 胡福初 黄建峰 胡桂兵 杨转英 肖靖关键词:荔枝 ANS 基因克隆 实时荧光定量PCR检测荔枝果皮中基因表达方法的建立 被引量:3 2010年 以不同发育阶段的‘糯米糍’荔枝果皮和成熟时不同色泽表型的‘糯米糍’(红色)、‘乌皮荔’(紫色)和‘鸭姆笼’(绿色)荔枝果皮为试材,以甘油醛-3-磷酸脱氢酶(gapdh)基因做内标、类黄酮-3-O-葡糖基转移酶(ufgt)基因为目的基因,建立了基于SYBR Green I染料技术的Real-Time PCR检测体系,并分析ufgt基因在上述材料中的表达差异。结果表明:以cDNA为模板建立的标准曲线循环阈值(Ct)与标准cDNA模板在一定浓度范围内呈良好的线性关系,gapdh基因和ufgt基因标准曲线的相关系数分别为0.998和0.999,扩增效率分别为96.2%和95.3%,达到定量PCR分析的标准。利用该方法的分析结果表明,不同发育阶段的‘糯米糍’荔枝果皮和3个成熟时不同色泽品种荔枝果皮的ufgt基因表达有显著差异。 魏永赞 胡福初 秦永华 王惠聪 胡桂兵关键词:荔枝 REAL-TIME PCR 荔枝果肉总RNA的提取及实时定量PCR分析 被引量:1 2012年 荔枝果肉因含糖量高、水分大和含较高活性的氧化酶而难以提取高质量的总RNA。以妃子笑荔枝不同发育期果肉为试材,经过多种提取方法比较和改进,发现市售RNA提取试剂盒改进提取步骤后均可快速得到质量较高的总RNA,果肉总RNA完整性好、质量高,平均浓度都在20μg/g以上,符合进一步分子生物学试验的要求。以反转录后得到的cDNA为模板,进一步的实时定量PCR反应表明以未纯化的RNA反转录的cDNA为模板没有信号,而经纯化后即可得到有规律的基因表达。 杨转英 王惠聪 何小龙 秦永华 胡桂兵关键词:荔枝 果肉 总RNA 实时定量PCR 荔枝DFR基因的克隆及其序列分析 被引量:3 2013年 采用同源克隆的方法从荔枝果皮中克隆得到一个二氢黄酮醇4-还原酶(DFR)基因,该基因开放阅读框全长1062 bp,编码353个氨基酸.基因组扩增得到长度为2321 bp的片段,分析发现:该基因含有5个内含子,分别在119-255、426-1158、1353-1470、1632-1819、2013-2095 bp之间.通过系统发育分析发现,该基因编码的蛋白与山葡萄、海棠和山竹子等果树具有较近的亲缘关系. 赵志常 胡福初 胡桂兵 杨转英 肖靖关键词:荔枝 基因克隆 不同产地荔枝果实糖含量及组成的比较 被引量:14 2012年 以‘妃子笑’和‘糯米糍’荔枝果实为材料,比较分析了广东广州、阳江、东莞、茂名、台山和福建龙海6个不同产地荔枝果实糖分积累及组成。结果表明:不同产地的微环境和管理水平能在一定程度影响荔枝果实的糖分积累及组成,但并不改变品种的糖积累类型。通过对酸性转化酶(acid invertase,AI)、中性转化酶(neutral invertase,NI)、蔗糖合成酶(sucrose synthase,SS)和蔗糖磷酸合成酶(sucrose phosphate synthase,SPS)活性测定及相关基因表达分析发现,不同产地之间假种皮中蔗糖代谢酶活性差异较大,但基因表达则没有显著差异。 杨转英 王惠聪 赵志常 秦永华 胡桂兵关键词:荔枝 糖含量 糖组分 关键酶 用于荔枝qPCR分析的内参基因克隆及稳定性分析 被引量:16 2012年 利用基因克隆和测序,从‘妃子笑’荔枝果皮中获得了β-Actin、GAPDH和18S rRNA 3个qPCR分析常用的内参基因全长序列,其长度分别为1 273、1 368和1 712 bp;3个基因与其他物种高度同源,氨基酸序列相似性均超过了98%.在此基础上,结合已报道的UBQ、eEF和25S rRNA 3个常用的内参基因,对β-Actin、GAPDH、18S rRNA,UBQ、eEF和25S rRNA 6个常用内参基因在荔枝果实发育不同阶段和外源生长调节剂处理后表达稳定性进行了分析,同时比较了geNorm、Norm Finder和BestKeeper 3种不同算法的差异.结果表明:以上6个基因中,β-Actin基因在3种不同算法下均保持了较好的表达稳定性. 魏永赞 赖彪 胡福初 李晓静 胡桂兵 王惠聪关键词:荔枝 内参基因 克隆 稳定性分析 荔枝果皮中4种酚类代谢酶活性的测定方法 被引量:7 2013年 为了改进酚类物质生物合成途径中关键酶酶活性的测定方法,以南方重要常绿果树荔枝Litchi chinensis果皮为材料,采用两点法和酶动力法2种酶活性研究方法,结合分光光度法和高效液相色谱法检测产物浓度变化,优化了4种酚类代谢常见酶[包括苯丙氨酸解氨酶(PAL)、查儿酮异构酶(CHI)、二氢黄酮醇还原酶(DFR)和类黄酮糖基转移酶(UFGT)]的测定方法,指出了酶液的纯化、酶活性的保护以及反应底物的溶解方法等对试验结果的稳定性和可靠性的影响,介绍了试验过程中常遇到的问题和具体的解决方法以及试验过程中的注意事项.应用改进后的方法测定荔枝发育过程中果皮PAL、CHI、DFR和UFGT的酶活性,结果发现活性变化趋势与前人的报道基本一致.改进的PAL、CHI、DFR和UFGT酶活性的测定方法可靠,可为相关的研究提供重要的参考. 李晓静 黄旭明 胡桂兵 王惠聪关键词:荔枝