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国家自然科学基金(60934004)

作品数:4 被引量:578H指数:3
相关作者:李梢张博刘莉扬更多>>
相关机构:清华大学更多>>
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相关领域:医药卫生生物学农业科学更多>>

文献类型

  • 4篇中文期刊文章

领域

  • 3篇医药卫生
  • 1篇生物学
  • 1篇农业科学

主题

  • 2篇药理
  • 2篇药理学
  • 2篇中医
  • 2篇中医药
  • 2篇网络药理学
  • 2篇基因
  • 1篇药理学研究
  • 1篇英文
  • 1篇生物过程
  • 1篇中药
  • 1篇系统生物学
  • 1篇基因本体
  • 1篇基因本体论
  • 1篇基因组
  • 1篇基因组DNA
  • 1篇方剂
  • 1篇高通量
  • 1篇高通量测序
  • 1篇CANDID...
  • 1篇GENE_O...

机构

  • 3篇清华大学

作者

  • 2篇李梢
  • 2篇张博
  • 1篇刘莉扬

传媒

  • 1篇中国中药杂志
  • 1篇实验技术与管...
  • 1篇Scienc...
  • 1篇Chines...

年份

  • 1篇2013
  • 1篇2012
  • 1篇2011
  • 1篇2010
4 条 记 录,以下是 1-4
排序方式:
中药网络药理学:理论、方法与应用(英文)被引量:378
2013年
中医学将病人当作一个具有不同状态的系统来进行治疗,具有悠久的历史,积累了大量的方剂。中医学的整体观念与网络药理学、网络生物学等前沿科技的核心思想具有相通之处,也符合了对肿瘤等复杂疾病进行系统性治疗的需求。'中药网络药理学'这一新领域的研究旨在从系统层次和分子水平揭示中药方剂的奥秘,促进中药研究从当前的'单一靶标,单一药物'模式转向'网络靶标,多成分药物'的新模式。近年来,中药网络药理学的一系列方法得以创建,包括基于网络的疾病基因预测、中药成分的靶标谱和药理活性预测、药物-基因-疾病的共模块分析、中药方剂多成分协同作用的大规模筛选、中药方剂的配伍规律和网络调节机理分析等。这些方法在清络饮、六味地黄丸等方剂的药效物质与作用机理等方面得到了有效应用。研究结果表明中药网络药理学能够为中医学从基于经验的医学迈向基于证据的医学提供新的途径,并能加速中药药物发现的进程,同时改进当前的药物研究策略。
李梢张博
关键词:中医药网络药理学
Ranking effects of candidate drugs on biological process by integrating network analysis and Gene Ontology被引量:7
2010年
There are high preclinical attrition rates in current drug discovery. The efficient assessment approach in the high throughout candidate drugs screening still needs great improvement. We propose two hypotheses. First, both drug action process and biological process can be converted to a common space of gene or gene product profiling. Second, the strength of drug action on biological process can be realized in the context of biological network. Based on the above hypotheses, we establish an algorithm termed Network-based Assessment for Drug Action (NADA) to assess the action strength of candidate drugs on certain biological processes. Then NADA is used to prioritize the effects of six compounds from traditional Chinese medicine on endothelial cell migration, a simple process defined by Gene Ontology, in the biological network specific for a given pathological process, angiogenesis. The computational results are subsequently tested by the experiment on the migration of Human Umbilical Vein Endothelial Cells in vitro. The experimental ranks for six compounds generally agree with the predicted output of NADA. NADA also outperforms the DAVID and meet/min methods in terms of the experimental orders, suggesting that the network topological features may have a key role in catching the mechanistic relationship between drug action and biological process. Hopefully, the progress of network biology approaches for deciphering complex diseases will further expedite the preclinical screening and accelerate the development of treatment modalities.
LI LiSha ZHANG NingBo LI Shao
关键词:基因本体论生物过程
网络靶标:中药方剂网络药理学研究的一个切入点被引量:237
2011年
目前中药研究的一个重点和难点问题是理解中药方剂复杂化学体系与病证复杂生物系统的相互作用。作者通过多年研究,从网络药理学、系统生物学角度对该问题提出"网络靶标"这一新的概念与方法。网络靶标概念指的是将病证生物分子网络当作靶标,由此设计和预测最佳的药物干预方式。网络靶标方法旨在将病证、方药映射于生物分子网络,然后在网络上对病证与方药的关系进行机制性的计算、分析与预测,以期发现药效物质及其作用机制,阐释方剂配伍规律与方证关联,并进行组方用药的理性设计。该文概述作者课题组在网络靶标方法及其在中药方剂中的应用进展,希望能为中药方剂的网络药理学研究提供参考。
李梢
关键词:中医药方剂网络药理学系统生物学
超声波破碎仪在高通量测序中的应用被引量:1
2012年
高通量测序技术中的数据质量控制是测序过程中的重要问题,样本文库的质量则是获取高质量的测序数据的前提和基础。在各种样本文库的制备过程中,样本的片段化过程受到普遍关注。该文主要针对基因组DNA样本的片段化技术中,涉及到的非接触式全自动超声破碎仪Bioruptor和自动聚焦声波样本处理仪Covaris S220的使用技巧和仪器的优缺点进行了初步比较。
刘莉扬张博
关键词:基因组DNA高通量测序
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