国家教育部博士点基金(20050319009)
- 作品数:7 被引量:22H指数:3
- 相关作者:许晓风伍革民朱善良霍金龙苗永旺更多>>
- 相关机构:南京师范大学南京市畜牧家禽科学研究所江苏教育学院更多>>
- 发文基金:国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 山猪群体钙调蛋白酶抑制蛋白基因遗传变异研究被引量:3
- 2008年
- 目的:研究猪钙调蛋白酶抑制蛋白(CAST)基因在山猪群体的遗传变异情况,为山猪肉质研究奠定基础。方法:应用PCR-SSCP技术和测序方法检测山猪及其杂种猪CAST基因的遗传多态性,并与其他品种猪相应序列进行比较。结果:用pCT1引物在山猪及其杂种群体中检测到2个多态位点(A,B),用pCT2引物检测到3个多态位点(C,D,E);序列分析表明,C和E位点共同拥有6处变异。结论:通过与其他猪品种比较,发现山猪的CASTMsp基因型分布与梅山猪的基因型分布完全一样,而与国外品种猪的基因型分布差异明显。
- 伍革民许晓风章熙霞霍金龙张雪娜苗永旺霍海龙
- 昆虫纲与线虫纲miRNAs碱基组成特征分析被引量:1
- 2008年
- [目的]为全面认识miRNA的结构属性和miRNA基因识别策略的设计提供帮助。[方法]利用miRNA数据库,借助于相关的生物信息学软件和数据统计软件,对昆虫纲与线虫纲部分物种(黑腹果蝇、暗果蝇、西方蜜蜂、冈比亚疟蚊、秀丽线杆线虫、线虫种)的已知miRNA序列的碱基组成进行统计分析。[结果]6种生物的miRNA序列中,腺嘌呤(A)含量较为稳定,在碱基组成上AU含量高于GC含量。比较同一物种pre-miRNA与mat-miRNA间相同碱基含量发现,除黑腹果蝇pre-miRNA与mat-miRNA在胞嘧啶(C)的含量上存在显著差异外,其余均未见显著差异。[结论]推测miRNA碱基组成上AU含量高可能与其调控基因表达功能和物种的进化关系有关。
- 朱善良许琴许晓风
- 关键词:MIRNA生物信息学
- 山猪群体遗传结构的RAPD分析被引量:2
- 2007年
- 应用RAPD标记技术,对山猪群体内遗传结构情况进行分析。利用经过筛选的14个引物,在36个山猪样本内共扩增出105条带,其中多态性带57条,多态性带频率平均为54.29%。根据RAPD扩增结果,计算该群体内个体间平均遗传相似系数为0.903,群体内平均最低杂合度为0.311。结果表明,山猪群体内遗传分化程度较低,遗传变异较小,为防止山猪品种资源灭绝和重要优良基因丢失,应加快开展该品种的保护研究工作。
- 伍革民许晓风章熙霞
- 关键词:RAPD群体遗传结构
- 利用微卫星PCR技术分析山猪的遗传结构被引量:11
- 2008年
- 选用世界粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)联合推荐的23个微卫星位点对山猪群体的遗传多样性进行检测。通过等位基因频率、有效等位基因数、杂合度、多态信息含量的计算以及瓶颈效应分析,判断山猪群体目前遗传结构和濒危状况。结果表明,23个微卫星座位的多态信息含量在0.452-0.847之间。群体平均多态信息含量和平均杂合度分别为0.686和0.731。瓶颈效应分析表明,山猪群体拥有极显著的杂合度过剩位点数,在无限等位基因模型和逐步突变模型下的平均杂合度为0.559和0.672,推断其有效群体大小近几十年在明显下降,从而说明山猪群体已经处于被灭绝的威胁中。上述研究结果对于山猪的保种和开发利用具有重要的指导意义。
- 伍革民许晓风章熙霞霍金龙苗永旺霍海龙
- 关键词:微卫星
- 山猪UCP3基因遗传变异及其与胴体、肉质性状的相关研究被引量:8
- 2007年
- 将猪解耦联蛋白3(UCP3)基因作为山猪肉质性状研究的候选基因之一,应用PCR-SSCP技术检测山猪及其杂种猪UCP3基因的多态性,对具有多态性的位点进行测序后,与其他品种猪UCP3基因序列进行比较分析。结果在山猪及其杂种中检测到2种UCP3 PCR-SSCP多态型,测序及比较分析后共找到19处多态位点,其中A型具有独特的4处多态位点。对5个品种猪UCP3基因共有的15处多态位点比较后发现,山猪的B型与长白猪的相应序列相似性最高,15处多态位点中有14处相同(只1567处有一个替换),山猪UCP3的A型与内江猪相应序列相似性最高,15处多态位点中有11处相同。对11个品种猪AυaI的PCR-RFLP基因型分布进行比较,发现山猪与梅山猪、内江猪的分布较一致。利用SAS 6.12软件,对PCR-SSCP不同基因型个体胴体性状与肉质性状进行了显著性检验与多重比较,结果表明UCP3 PCR-SSCP不同基因型间肉质性状差异均不显著,在胴体性状中AA型背膘厚显著低于BB型,因此UCP3有可能作为胴体性状遗传标记用于标记辅助选择。
- 伍革民许晓风章熙霞张雪娜
- 关键词:基因肉质性状PCR-SSCP
- 13种脊椎动物miRNA碱基组成分析
- 2007年
- miRNAs是当前基因表达调控领域的研究热点.本研究借助于Sanger实验室提供的miRNA数据库9.0,使用相关的生物信息学软件统计分析13种脊椎动物miRNA的四种碱基、GC和AU含量,所取得的miRNA一级结构特征信息对全面了解miRNA的基本生物学特性以及miRNA基因识别策略的设计都具有重要意义.结果表明,所分析的13种脊椎动物的miRNA序列中,腺嘌呤(A)含量除了非洲蛙与褐家兔及小家鼠之间在前体miRNA存在差异外,其余均未见显著差异,表明不同物种的miRNA中A含量基本相同,保持相对稳定;同样,各种生物之间,成熟miRNA的鸟嘌呤(G)含量也未见显著性差异;在不同脊椎动物之间,miRNA序列碱基组成上存在一些差异.
- 朱善良姜敏许晓风
- 关键词:MIRNA脊椎动物
- 山猪血清蛋白质多态性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析研究
- 2006年
- 运用聚丙烯酰胺凝胶电泳分析了山猪血清蛋白质生化位点多态性的分布.结果表明,前白蛋白Pa、白蛋白Alb、后白蛋白Po可分离出4~6条区带,转铁蛋白Tf分离出2~3条区带.白蛋白的平均分子量约为69000Da,转铁蛋白的平均分子量约为88000Da.用聚丙烯酰胺凝胶电泳分离血清蛋白质重复性较好,分辨较高,测定蛋白质的多态性和分子量的变化对分析猪的遗传特征、选育优良品种和诊断诸多疾病有重要意义.
- 钱继宁朱善良许晓凤伍革民
- 关键词:血清蛋白质多态性聚丙烯酰胺凝胶电泳