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浙江省医药卫生科学研究基金(2008A036)
作品数:
3
被引量:5
H指数:2
相关作者:
何俊俊
严力行
王炜
章伟
朱发明
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2011
2篇
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HLA-B新等位基因B*9534的测序分析及其单链扩增技术的建立
2010年
目的分析HLA—B新等位基因HLA—B*9534的核苷酸序列,并建立HLA—B*9534单链扩增技术。方法采用商品化快速抽提试剂盒抽提标本基因组DNA,采用PCR技术扩增先证者HLA-B基因的第1—8外显子序列,PCR产物经双酶切后直接测序分析第2、3、4外显子。应用序列特异性引物PCR建立HLA-B*9534单链扩增技术,获得HLA—B*9534等位基因的单链产物,并对单链产物进行第2、3、4外显子测序分析。结果先证者标本存在2个HLA—B等位基因,直接测序结果经软件分析显示与最接近的HLA—B*1518和B*4601组合存在1个碱基不匹配,即第593位A/G杂合。单链扩增技术将先证者等位基因分离后,测序得到两个等位基因为HLA—B*4601和HLA—B*9534。与最接近的HLA—B*1518的第2—4外显子序列相比,HLA—B*9534仅在第3外显子存在一个碱基的不同,即第593位A→G的改变,导致第174位氨基酸天冬酰胺改变为丝氨酸,该等位基因序列已递交GenBank(EU046491),并经世界卫生组织HLA命名委员会正式命名为HLA-B*9534。结论发现一个新的HLA—B*9534等位基因,建立的HLA—B*9534单链扩增技术是可行的。
何俊俊
章伟
王炜
韩浙东
和艳敏
朱发明
严力行
关键词:
人类白细胞抗原
测序分析
聚合酶链反应
人类白细胞抗原A和C座位基因重组二个家系分析
被引量:3
2011年
目的探讨2个家系人类白细胞抗原(humanleukocyteantigen,HLA)座位的重组情况。方法采用聚合酶链反应一序列特异寡核苷酸探针技术检测2个家系成员HLA—A、-C、-B、-DRB1和-DQB1位点,应用测序分型方法进行HLA高分辨基因分型,然后通过家系遗传分析确定HLA基因重组相关位点,检测短串联重复序列位点确定其家系成员亲权关系。结果2个家系HLA单倍型的重组发生在HLA—A和C位点之间,家系调查显示1例为父源、1例为母源HLA单倍型发生了交换后遗传给子代,短串联重复序列结果证实2个家系成员内具有高度的亲权关系。结论发现了2个中国汉族人群HLA—A和C基因座位间的基因重组家系,为深入研究HLA的重组机制提供了基础。
王炜
韩浙东
陈男英
何俊俊
章伟
朱发明
吕杭军
严力行
关键词:
人类白细胞抗原
基因重组
家系分析
人类白细胞抗原-DRB1第3外显子单链测序方法的建立及其多态性分析
被引量:2
2010年
目的 建立人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-DRB1第3外显子单链测序方法,并分析其多态性.方法 采用组特异性引物扩增HLA-DRB1第2和3外显子序列,扩增产物经双酶切后进行双向测序分析,采用Assign 3.5 SBT分析软件指定等位基因型.结果 PCR产物经直接测序后得到清晰的序列冬,并向IMGT/HLA数据库提交了HLA-DRB1*08:09和DRB1*12:02:01第3外显子全部序列.在检测的25个等位基因中,HLA-DRB1第3外显子全长序列中存在27个单核苷酸多态性位点,占第3外显子序列碱基总数的9.56%.建立的方法可有效区分HLA-DRB1*14∶01∶01/14∶54歧义标本,证实中国人群中存在HLA-DRB1*14∶01∶01.结论 本实验建立的HLA-DRB1第3外显子测序方法是可行的,HLA-DRB1第3外显子存在多态性.
朱发明
和艳敏
陶苏丹
章伟
王炜
何俊俊
吕杭军
严力行
关键词:
人类白细胞抗原-DRB1
测序分析
遗传多态性
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