湖南省自然科学基金(10JJ4022)
- 作品数:3 被引量:30H指数:2
- 相关作者:谭晓风张琳龙洪旭林萍姚小华更多>>
- 相关机构:中南林业科技大学中国林业科学研究院更多>>
- 发文基金:湖南省自然科学基金国家林业公益性行业科研专项中南林业科技大学青年科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 油茶乙酰CoA酰基转移酶基因cDNA克隆及序列特征分析被引量:21
- 2011年
- 在已知油茶乙酰COA酰基转移酶基因EST序列基础上,设计6条特异引物,以油茶优良无性系‘湘林1号’种仁总RNA为模板,通过反应体系和反应条件优化,最终扩增出一条700 bp左右的目的片段,将该片段回收、克隆、测序,获得718 bp的cDNA序列,将该序列与油茶乙酰COA酰基转移酶基因进行序列拼接,确定了油茶乙酰COA酰基转移酶基因的全长cDNA序列,将该序列提交至GeneBank,登录号为GU594059。油茶乙酰COA酰基转移酶基因全长cDNA序列为1 495 bp,含有一个1 227 bp的ORF,编码408个氨基酸残基。在氨基酸序列水平上,该基因与胡黄连(P.kurrooa)的乙酰COA酰基转移酶基因的相似性最高,为86%,与稻瘟病菌(M.grisea)的最低,为65%。通过在线预测,油茶乙酰COA酰基转移酶基因编码蛋白的等电点pI为6.19,分子量Mw为41 628.6 Da。本研究为揭示油茶油脂合成规律和油茶的分子育种提供了理论依据和科学基础。
- 张琳谭晓风胡姣姚小华林萍
- 关键词:油茶快速扩增CDNA末端生物信息学分析
- 油桐亲环素基因全长cDNA的克隆及序列分析被引量:2
- 2011年
- 亲环素基因广泛分布于各种生命体中,植物亲环素在植物生物学、胁迫应答、抗病原体免疫等方面起重要作用。根据油桐EST文库中的已知部分亲环素基因序列,通过5’RACE和RT-PCR,得到一个油桐亲环素全长cDNA序列。此基因全长为681 bp,包含一个长为519 bp的完整CDS,编码172个氨基酸,将该基因命名为vf_cyp。生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白质相对分子量18 038.5 Da,理论等电点8.68。通过预测分析表明该蛋白无跨膜结构,不存在信号肽切割位点,二级结构以β折叠和无规卷曲为主,分别占36.05%和52.91%,具有典型的肽脯氨酰顺反异构酶活性区及植物亲环素基因特有的7个氨基酸插入序列KS/MGKPLH,通过亲缘进化分析表明油桐亲环素氨基酸序列与橙、杂柑、毛果杨亲环素基因的氨基酸序列相似性分别达到94%、94%、93%。
- 龙洪旭谭晓风张琳谢禄山陈洪
- 关键词:油桐亲环素RACE全长CDNA
- 油桐种胚再生体系的建立被引量:7
- 2012年
- 为了建立快速有效的油桐再生体系,以"葡萄桐"种胚为试材,研究了贮藏方式、消毒时间、培养基及培养条件对油桐种胚成苗的影响。结果表明:种子沙藏与在自然条件下贮藏对油桐种胚成苗的影响无明显差异;种胚的最佳消毒处理为0.1%的升汞浸泡3 min;将种胚接种在1/2MS+IAA 0.5 mg/L的培养基中成苗率最高,为98%;在培养基中加入6-BA易使种胚产生大量的愈伤组织,不利于油桐胚再生体系的建立;培养基的最适pH值为5.5;与遮光处理相比,光照能缩短种胚再生体系建立的周期。
- 李泽谭晓风张琳龙洪旭袁军范晓明曾艳玲
- 关键词:油桐种胚成苗率