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国家自然科学基金(30600396)

作品数:4 被引量:78H指数:3
相关作者:林忠旭张献龙李武倪薇张艳欣更多>>
相关机构:华中农业大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域:农业科学更多>>

文献类型

  • 4篇中文期刊文章

领域

  • 4篇农业科学

主题

  • 3篇海岛棉
  • 1篇序列标签
  • 1篇遗传连锁图
  • 1篇微卫星
  • 1篇微卫星标记
  • 1篇连锁图
  • 1篇棉花
  • 1篇基因
  • 1篇基因图
  • 1篇基因图谱
  • 1篇基因序列
  • 1篇基因序列分析
  • 1篇简单序列重复
  • 1篇SRAP
  • 1篇SSR
  • 1篇STUDIE...
  • 1篇DERIVE...
  • 1篇EST
  • 1篇EST-SS...
  • 1篇表达序列标签

机构

  • 3篇华中农业大学

作者

  • 3篇张献龙
  • 3篇林忠旭
  • 2篇李武
  • 1篇涂礼莉
  • 1篇余渝
  • 1篇余杨
  • 1篇聂以春
  • 1篇王夏青
  • 1篇张培培
  • 1篇张艳欣
  • 1篇倪薇

传媒

  • 2篇作物学报
  • 1篇科学通报
  • 1篇Scienc...

年份

  • 1篇2009
  • 1篇2008
  • 2篇2007
4 条 记 录,以下是 1-4
排序方式:
首批海岛棉基因组来源的微卫星标记的分离、评价和定位被引量:3
2009年
海岛棉(Gossypium barbadense)是世界上最重要的栽培棉种之一。海岛棉纤维品质优良,是优质棉的重要产源。为了研究海岛棉的遗传多样性,为海岛棉育种提供参考依据,从海岛棉遗传标准系中分离基因组来源的微卫星标记用于海岛棉遗传评价。采用两种方法分离微卫星标记,一是用ISSR(inter simple sequence repeat)引物扩增Pima3-79,克隆测序后从中开发微卫星标记;二是利用简并引物扩增Pima3-79,克隆测序后从中开发微卫星标记。共挑选1 447个克隆,筛选出239个独立克隆。测序后得到214个单一序列,其中包含微卫星并可用于引物设计的序列70个,获得86对引物。86对引物用于扩增56个海岛棉材料和4个陆地棉材料,16对引物没有扩增,43对引物在所有材料中没有多态性;27对引物在海岛棉和陆地棉之间有多态性,19对引物在海岛棉中表现多态性。利用Jaccard相似系数和UPGMA方法进行聚类分析可以明显区分陆地棉和海岛棉,并且将海岛棉分为4类。14对引物在BC1群体中表现多态性,产生14个位点。9个位点整合到BC1连锁图的7个染色体上,4个位于A亚基因组,5个位于D亚基因组。海岛棉微卫星标记扩展了棉花微卫星标记,有助于海岛棉遗传多样性的研究,有利于棉花遗传图谱的进一步丰富。
张培培王夏青余杨余渝林忠旭张献龙
关键词:海岛棉微卫星标记
Studies of new EST-SSRs derived from Gossypium barbadense被引量:8
2007年
Existing cotton EST-SSR markers are mostly derived from Gossypium arboreum and Gossypium hir-sutum, but EST-SSR markers from Gossypium barbadense are scarce. One hundred and nineteen EST-SSRs were developed based on 98 unique ESTs from a cDNA library constructed in our laboratory using developing fibers from G. barbadense cv. Pima3-79. Among the SSRs, trinucleotide AAG appeared at a high frequency of 11.76%. 36 accessions (consisting of 13 diploids of the A genome, 11 diploids of the D genome and 12 allotetraploids of the AD genome) were employed to test new EST-SSRs. 76 EST-SSRs were successfully amplified, and 313 polymorphic fragments were yielded, with an average of 4.11 fragments per primer pair. The PIC ranged from 0.17 to 0.95 with an average of 0.53. Based on Jaccard’s genetic similarity coefficient, these 36 accessions were clustered into three groups. 21 EST-SSRs exhibited polymorphisms in BC1 population ((Emian22 × Pima3-79) × Emian22), 24 polymor- phic loci were generated, while 22 of the 24 polymorphic loci were integrated with our interspecific BC1 backbone genetic linkage map, and anchored in 12 chromosomes. This study effectively proved that EST-SSRs from G. barbadense are valuable for genetic diversity analysis and genetic mapping.
ZHANG YanXin LIN ZhongXu LI Wu TU LiLi NIE YiChun ZHANG XianLong
关键词:棉花基因序列分析基因图谱
海岛棉遗传多样性的SRAP标记分析被引量:46
2008年
利用SRAP标记,选用132对带型清晰的多态性引物,对我国引入海岛棉以来培育的36个国内品种及20个国外品种进行遗传多样性分析。共检测到419个多态性位点,每组合的多态性条带数从2-9不等,平均为3.17。利用NTSYS-pc2.10e软件采用Jaccard’s相似系数和UPGMA方法进行聚类分析。结果表明,大部分具有亲缘关系的品种聚在同类中,说明其结果与系谱具有一定的相符性;56个品种的平均遗传相似系数为0.497,变化范围在0.312-0.876之间,说明我国海岛棉品种在分子水平上存在较大差异;我国3个育种时期育成品种的平均相似系数依次为0.501、0.507和0.548,表明我国现在育成的品种相对于早期品种遗传多样性在逐渐降低。这些结果为我国海岛棉育种提供了有益的参考。
李武倪薇林忠旭张献龙
关键词:海岛棉SRAP
海岛棉EST-SSR引物的开发与应用研究被引量:23
2007年
现有的棉花EST-SSR引物大都开发于中棉和陆地棉,尚没有海岛棉EST-SSR开发研究的报道.本研究从实验室构建的海岛棉纤维发育的cDNA文库中先取98条EST序列设计了119对EST-SSR引物.在这些SSR中,三核苷酸重复基序AAG含量最为丰富,达11.76%.用36份材料(13份A基因组二倍体材料,11份D基因组二倍体材料和12份AD基因组异源四倍体材料)评价新EST-SSR引物,119对引物中有76对成功扩增,共产生313条多态性条带,平均每对引物产生4.11条.这些引物的多态性信息含量(PIC)变化在0.17~0.95之间,平均0.53.根据Jaccard’s遗传相似系数对所用36份材料进行了聚类分析,聚类结果为3大类,分别为A基因组材料、D基因组材料和AD基因组材料.此外,有21对引物在本实验室的种间回交群体((鄂棉22×Pima3-79)×鄂棉22)DNA中表现多态性扩增,产生24个多态性位点,其中22个被锚定于该遗传连锁图的12条染色体.本研究不仅详细地概括了这批新的EST-SSR引物的特征,而且有力地证明了其在遗传多样性分析及遗传连锁图构建方面的应用价值.
张艳欣林忠旭李武涂礼莉聂以春张献龙
关键词:海岛棉遗传连锁图
共1页<1>
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