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广东省医学科学技术研究基金(A2005188)
广东省医学科学技术研究基金(A2005188)
作品数:
1
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相关作者:
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广州4株登革1型病毒E基因的全序列测定和分子进化分析
被引量:3
2008年
目的通过对广州市不同年份分离的4株登革1型病毒(DEN-1)蛋白E基因进行全序列测定及分子进化分析,了解各流行株之间的遗传差异及进化关系,追踪其可能的传染来源。方法应用RT-PCR技术分别扩增各株病毒的蛋白E基因,克隆到pGEM-TEasy载体,转化DH5α宿主菌,经PCR和酶切鉴定后进行序列测定。测序结果与国内外流行株进行同源性比较和毒力位点分析,并绘制基因系统发生树。结果4株DEN-1病毒E基因序列长度均为1485bp,编码495个氨基酸,核苷酸序列同源性为91%~98%,推导的氨基酸序列同源性为96.0%~99.2%。广州1995年流行的DEN-1和2002、2004、2006年流行株的毒力位点氨基酸存在差异。结论通过对登革1型病毒E基因的进化分析,GZ01/95、GZ01/02和GZ01/04这3株同属于基因型Ⅳ,而GZ17/06属于基因型Ⅰ。1995年广州地区流行的DEN-1可能来源于印度尼西亚,而2002和2004年的流行可能与澳大利亚流行株有关。2006年广州又出现的DEN-1可能与泰国2002年的流行株输入有关。
刘晓丽
周俊梅
梁瑜
陶剑平
方丹云
周经姣
江丽芳
关键词:
登革病毒
E基因
分子进化
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