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天津市卫生局科技基金(05KY25)
天津市卫生局科技基金(05KY25)
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1
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天津地区人偏肺病毒G蛋白特性分析
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2010年
目的了解天津地区人偏肺病毒(hMPV)G蛋白特性,为深入研究(hMPV)奠定基础。方法采用RT—PCR方法扩增hMPV的G基因片段,测序后通过生物信息学软件分析核苷酸同源性,绘制种系发生树,并对推导的G蛋白氨基酸序列的糖基化位点、跨膜序列及二级结构进行预测。结果天津地区hMPVG蛋白由217~238个氨基酸组成。种系发生树分析显示,hMPV可分为A2a、A2b和B23个亚型,A2b为优势流行型。A2亚型内的核苷酸同源性在90.1%~99.5%,推导的氨基酸同源性在80.4%~99.1%;A、B亚型之间核苷酸同源性为57.4%~60.3%,推导的氨基酸同源性为30.3%~37.1%。hMPVG蛋白的S和T总含量在30.9%~34.0%之间,A和B型间差异无统计学意义(P〉0.05)。N-糖基化位点在2~6之间。10株A2亚型hMPVG蛋白的跨膜区为N-端33~55位氨基酸,1株B2亚型hMPVG蛋白为N-端27-49位氨基酸。G蛋白氨基酸变异多发生在膜外区。二级结构预测显示,柔性结构占G蛋白氨基酸总数的62.7%~84.1%,其中以无规则卷曲为主,占60.8%~84.1%。该区域也多集中在膜外区,成为抗原表位的可能性较大。结论天津地区hMPV的优势流行型为A2b,其G蛋白特性有地区流行特点。
李晓燕
陈锦英
孔梅
苏旭
赵煜
谢艺
易艳萍
邹明
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人偏肺病毒
G蛋白
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