国家科技支撑计划(2011BAI09B02)
- 作品数：6 被引量：54H指数：5
- 相关作者：刘美娜张秋菊王笑峰金力张桥更多>>
- 相关机构：哈尔滨医科大学复旦大学宁波市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划国家自然科学基金黑龙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- PLS-DA模型四种诊断统计量在代谢组学应用中的比较被引量：7
- 2014年
- 目的比较PLS-DA模型四种诊断统计量在代谢组学数据分析中的检验效能和稳定性。方法采用双重交叉验证和置换检验的PLS-DA模型验证策略,并分别使用四种诊断统计量对模拟数据和实际数据进行分析。结果AUC统计量较误判数(率)、Q2和DQ2统计量具有更高的检验效能;同时,AUC统计量与其他三种诊断统计量相比较,具有更高的稳定性。结论 AUC统计量是PLS-DA模型验证过程中一种稳定有效的诊断统计量,推荐作为代谢组学研究中进行PLS-DA分析时的首选诊断统计量。
- 柯朝甫武晓岩李康
- 关键词：代谢组学
- 回归校准法对线性回归中信息偏倚校正的模拟研究被引量：5
- 2013年
- 目的探讨回归校准法对简单线性回归中,符合正态分布或均匀分布的信息偏倚校正效果。方法通过SAS软件模拟产生有信息偏倚的数据集,用回归校准法对信息偏倚进行校正,然后对比设定的真实β值和校正后的β*值之间的差别,来评价校正效果。结果无论信息偏倚符合正态分布还是均匀分布,回归校准法都能达到较好的校正效果;在固定信息偏倚大小和验证数据集样本量,但不同β值的情况下,信息偏倚校正效果均较好;未校正时的β值都小于设定的真实β值,且信息偏倚越大,β值越小;随着验证数据集样本量的增加,回归校准法对信息偏倚的校正效果越好。结论可以使用回归校准法对线性回归中符合正态分布或均匀分布的信息偏倚进行校正;在校正时要根据信息偏倚的大小来确定合适的验证数据集样本量,以最少验证数据集样本量达到最佳校正效果;在有信息偏倚存在的线性回归分析中,一定要对回归系数进行校正。
- 张桥张秋菊陈霞李慧婷陈永杰杨建飞刘美娜
- 大型人群队列研究被引量：28
- 2016年
- 在精准医学和大数据时代的今天,大型人群队列研究成为流行病学研究的主旋律之一.人群队列研究由传统小样本队列发展到了当前的大型队列,而构建大型人群队列的模式也在不断地演化.各组学、大数据科学、分子影像等新技术不断被纳入到人群队列研究中以回答不断产生的广泛科学问题,服务于疾病精准的预防、诊断和治疗.本文将重点讨论大型人群队列建设的时代背景、必要性、建设现状和新模式、数据分析等,并提出我国建设大型队列所面临的挑战和机遇.
- 王笑峰金力
- 任意缺失模式缺失数据不同填补方法效果比较被引量：7
- 2013年
- 目的探讨任意缺失模式下缺失数据的填补方法,并对不同方法填补效果进行比较和评价。方法结合我国北方绝经期妇女钙需要和膳食评估应用研究课题的数据,调用SAS软件中IML模块产生任意缺失模式模拟数据,通过MI和MIANALYZE过程实现缺失数据的填补,同时应用准确度和稳定度两个评价指标来评价各方法填补的效果。结果PS方法填补3次在本文模拟的任意缺失模式的缺失数据中填补效果最佳,MCMC方法填补效果并不理想。结论在填补任意缺失模式的缺失数据时,MCMC并不是唯一的多重填补方法,通过多重填补的PS方法、PMM方法和REG方法把数据填补成单调缺失后,再用相同方法进行一次填补也是一种可选择的填补方法。
- 张桥李宁张秋菊刘美娜
- 关键词：缺失数据
- 基于色谱-质谱平台的代谢组学数据预处理方法被引量：6
- 2017年
- 代谢组学的概念自20世纪90年代被正式提出,已被广泛应用于医学研究领域,其一般研究流程包括样本采集、样本检测、数据预处理、数据分析和生物学解释等。常用的样本检测技术有核磁共振（nuclear magnetic resonance,NMR）和高分辨率色谱-质谱联用技术，本文所述方法针对后者。
- 孙琳张秋菊王文佶曲思杨谢彪高兵刘美娜
- 关键词：代谢组学数据预处理方法色谱-质谱高分辨率噪声强度缺失数据
- 基于三元泛函主成分分析和聚类分析的MRI图像分类研究被引量：1
- 2017年
- 一元泛函主成分分析(FPCA)已经在fMRI上成功进行了应用,但是目前很少有研究运用多元FPCA对MRI进行探索.本研究将一元FPCA推广到三元并应用于MRI的图像特征提取,并对提取的特征进行了后续研究,提出了一整套MRI病理及正常图像的分析方法.该方法的主要流程是先对MRI图像进行预处理(图像配准和图像分割),得到脑脊液图像,然后运用三元FPCA对脑脊液进行特征提取,再对提取的特征进行选择,随后利用k-means聚类算法对特征进行聚类,来判断图像所属的类别(正常或异常),从而达到颅脑MRI图像病变筛查的目的.将该方法应用于颅脑MRI快速自旋回波T2加权像中,结果发现,相比于传统PCA,三元FPCA展现出更好的特征提取能力,可以有效提高图像分类的准确率.
- 张嘉茗林楠张梦翰张亮李淑元熊墨淼王笑峰金力
- 关键词：主成分分析颅脑MRI聚类分析
