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云南省应用基础研究基金(2013FZl36)

作品数:1 被引量:10H指数:1
相关作者:赵卫中马忠飞张云昆朱艳菊吉玛更多>>
相关机构:中国医学科学院北京协和医学院更多>>
发文基金:云南省应用基础研究基金更多>>
相关领域:医药卫生更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇医药卫生

主题

  • 1篇全基因
  • 1篇全基因序列
  • 1篇全基因序列分...
  • 1篇全基因组
  • 1篇基因
  • 1篇基因序列
  • 1篇基因序列分析
  • 1篇基因组
  • 1篇分离株
  • 1篇KM

机构

  • 1篇中国医学科学...

作者

  • 1篇邵聪文
  • 1篇刘建生
  • 1篇马绍辉
  • 1篇吉玛
  • 1篇朱艳菊
  • 1篇张云昆
  • 1篇马忠飞
  • 1篇赵卫中

传媒

  • 1篇中华流行病学...

年份

  • 1篇2014
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
2009年云南省柯萨奇病毒B5:分离株A210/KM/09全基因序列分析被引量:10
2014年
目的分析柯萨奇病毒B5(CVB5)云南分离株A210/K2~I/09全基因序列及其遗传特性。方法设计针对CVB5引物,提取病毒RNA,RT-PCR扩增和产物直接测序获得序列,利用Mega4.1、RDP3和SimPlot3.5.1软件分析全基因序列。结果CVB5A210/KM/09全基因组核苷酸序列长度为7372bp,编码含2185个氨基酸残基的多聚蛋白;A210/KM/09全基因组核苷酸及所推导的氨基酸与CVB5/CCl0/10同源性最高,其同源性分别为92.5%和97.3%;而与其他CVB5毒株如17Y、19CSF、20CSF、1954/85/US、2000/CSF/KOR、03001N、CoxB5/Henard2010、CVB5/SD/09和Faulkner核苷酸和氨基酸同源性分别为80.1%~92.5%和95.0%~97.3%;A210/KM/09与其他CVB5毒株的各区段核苷酸和氨基酸同源性分别为75.3%~96.3%和85.3%~100.O%,其中与VP3、3D区段核苷酸的同源性最低。基于CVB5全长VPl基因序:列进行种系进化分析,可将CVB5分为A、B、C和D4个基因型,其中C基因型可再分为C1~C4基因亚型,D基因型可再分为D1~D4基因亚型。中国CVB5流行株主要聚集在C4基因亚型,国外流行株主要聚集在D1、C2亚型。结论A210/KM/09分离株为C4基因型。
刘建生邵聪文赵卫中张云昆吉玛朱艳菊马忠飞马绍辉
关键词:全基因组
共1页<1>
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