湖南省教育厅重点项目(08A007)
- 作品数：6 被引量：19H指数：2
- 相关作者：刘臻鲁双庆张建社熊钢张学文更多>>
- 相关机构：长沙学院湖南农业大学长沙大学更多>>
- 发文基金：湖南省教育厅重点项目湖南省自然科学基金湖南省教育厅优秀青年基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 鳜原种群体和养殖群体遗传多样性的微卫星分析被引量：10
- 2010年
- 本研究利用20对微卫星引物对鳜(Siniperca chuatsi)原种群体和养殖群体进行遗传多样性分析。结果表明,在鳜原种群体中检测到多态性位点14个,养殖群体11个。在两个群体中共检测到等位基因数96个,其中原种群体检测到等位基因数53个,每个位点的等位基因数在1～7之间,平均有效等位基因数为2.7390;养殖群体检测到等位基因数43个,每个位点的等位基因数在1～6之间,平均有效等位基因数为2.1284。原种群体的平均观察杂合度0.5708,Nei氏期望杂合度0.5295,平均多态信息含量PIC0.5353;养殖群体的平均观察杂合度0.3839,Nei氏期望杂合度0.4011,平均多态信息含量PIC0.5043。因此,与养殖群体相比,鳜原种群体仍有丰富的遗传多样性。本研究可为鳜种质资源的保护、监测和遗传育种提供分子水平上的数据。
- 梅秋兰刘臻张学文谢帝芝张建社曾国清鲁双庆
- 关键词：微卫星标记
- 黄鳝微卫星标记筛选及其在不同性别表型群体中的遗传多态性被引量：5
- 2009年
- 采用FIASCO（Fastisolation by AFLP sequences containing repeats）法进行黄鳝微卫星标记筛选并将其应用于黄鳝性别差异群体的遗传变异分析。黄鳝基因组DNA经酶切、微卫星核心序列探针杂交、T载体连接并转化至DH5a中，构建黄鳝基因组微卫星富集文库。随机挑选75个阳性克隆测序，结果发现其中20个含有微卫星序列，利用软件成功设计了15对微卫星引物，经过黄鳝基因组DNA的PCR扩增及电泳检测，筛选8对多态性微卫星引物并对黄鳝3种不同性别表型群体的基因组DNA进行PCR扫描，结果显示：在8个微卫星座位中，共检测到51个等位基因，平均每个座位的等位基因数为6．375个，等位基因频率分布为0．0012～0．6033；黄鳝雌性表型群体、间性表型群体、雄性表型群体的平均遗传杂合度分别为0．6371、0．6969、0．7345；平均多态信息含量分别为0．5656、0．6416、0．6858，表明这些微卫星标记在黄鳝不同性别表型群体的遗传多态性发生了改变，它们可作为黄鳝遗传背景分析的分子标记。
- 刘臻罗小华鲁双庆匡刚桥张建社
- 关键词：FIASCO微卫星DNA遗传多态性
- 微卫星标记及其在鱼类原种检测中的应用被引量：2
- 2010年
- 梅秋兰刘臻曾国清张学文鲁双庆
- 关键词：微卫星标记鱼类
- 鳜属3物种IRF_2基因微卫星标记筛选及遗传变异研究被引量：2
- 2009年
- 利用微卫星分析技术筛选翘嘴鳜、斑鳜和大眼鳜的IRF2基因微卫星标记,分析IRF2基因微卫星在3物种中的遗传变异.结果筛选出了4个微卫星标记,其中I3、I4标记可用于斑鳜的分子鉴定;检测到26个等位基因,平均每个位点6.5个,等位基因频率0.0667～0.7143;3物种IRF2基因遗传变异程度由高到低依次为大眼鳜(H为0.6717;PIC为0.6241),翘嘴鳜(H为0.5376;PIC为0.4462),斑鳜(H为0.3000;PIC为0.2656),这说明IRF2基因微卫星在3物种中遗传变异程度高.
- 刘臻钟敬赵琼鲁双庆熊钢张建社
- 关键词：鳜属微卫星
- 鳜干扰素刺激基因Viperin微卫星标记筛选及遗传变异分析被引量：1
- 2008年
- 研究采用生物信息学技术在鳜干扰素刺激基因Viperin(Virus inhibitory protein,endoplasmic reticulum-associated,in-terferon-inducible)序列中发现了2个微卫星序列,通过设计2对微卫星引物,对翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)、斑鳜(Siniperca scherz-eri)和大眼鳜(Siniperca kneri)基因组进行PCR扩增分析其多态性.结果表明:Viperin基因微卫星多态性在3物种高低顺序依次为斑鳜,翘嘴鳜和大眼鳜,多态信息含量(PIC)在0.2394 0.8043之间,平均多态信息含量为0.5247,属于高度多态性位点.因此,本研究的2对引物可作为鳜3物种遗传分析的微卫星标记.
- 刘臻熊钢钟敬褚武英鲁双庆
- 关键词：微卫星
- 草鱼RBM cDNA克隆及序列分析
- 2009年
- 目的:克隆草鱼RNA剪切蛋白(RNAbinding motif protein-RBM)基因。方法:采用RT—PCR技术从草鱼性腺总RNA中克隆RBM基因,将其插入pBS-T载体上,经菌液PCR鉴定后进行测序并对测序结果进行生物信息分析。结果:获得草鱼RBM cDNA部分序列,大小为384bp,预测编码127个氨基酸残基;RBM基因进化与物种形态进化类似;不同物种间RBM基因一级结构保守性不高,但氨基酸序列保守性较高,且存在高度保守的氨基酸位点。结论:成功地克隆了草鱼RBM cDNA部分序列,为获RBM cDNA全长序列及后续研究提供理论基础。
- 熊钢刘臻王晓清鲁双庆刘小青罗小华
- 关键词：草鱼基因克隆
