国家自然科学基金(81102170)
- 作品数:3 被引量:37H指数:2
- 相关作者:许文波崔爱利邱琪许松涛王慧玲更多>>
- 相关机构:中国疾病预防控制中心更多>>
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- F基因型腮腺炎病毒全基因组基因特征分析被引量:12
- 2013年
- 为了解我国现流行的F基因型腮腺炎病毒全基因组的基因特征,本研究选择对腮腺炎病毒F基因型参考株Muvi/shand。ng.CHN/4.05IF]进行全基因组测序,结合其它来自于GenBank的腮腺炎病毒全基因组序列,共同分析我国流行的F基因型腮腺炎病毒的全基因组特征及其与现有疫苗株的遗传差异及抗原位点变异情况。通过研究发现,和腮腺炎病毒其它基因型相比,腮腺炎毒株MuVi/shandong.CHN/4.05Er]全基因组核苷酸差异在3.8%~6.5%之间,其中与A基因型(疫苗株)差异最大,与B和N基因型差异最小。腮腺炎毒株MuVi/Shan—dong.CHN/4.os[F]和疫苗株在全基因组序列上分别存在26个和25个N糖基化位点,和疫苗株相比,腮腺炎毒株MuVi/Shandong.CHN/4.05[x]在HN蛋白上第464~466氨基酸位点上增加了一个N一糖基化位点,而其它基因型的腮腺炎病毒在这个位点上也均为N_糖基化位点。另外,腮腺炎毒株MuVi/Shandong.CHN/4.os[E]和疫苗株在其它已知的抗原相关位点上也存在着氨基酸变异。我国现流行的腮腺炎流行株与腮腺炎病毒其它基因型及疫苗株之间在全基因组上已存在较大的差异,提示需进一步加强对国内现有腮腺炎流行株与疫苗株之间的遗传变异分析,系统评价当前疫苗的免疫保护效果。
- 崔爱利金俐许文波
- 关键词:腮腺炎病毒全基因组基因特征
- 构建一种新型腮腺炎病毒核酸检测阳性对照品被引量:2
- 2013年
- 为快速鉴定腮腺炎病毒核酸检测中由阳性对照引起的交叉污染问题,本研究建立了一种新型腮腺炎病毒核酸检测阳性对照。该阳性对照为合成的RNA转录产物,在使用相同的引物和反应条件下,该阳性对照在RT-PCR和巢式PCR试验中产生的PCR产物和正常腮腺炎病毒核酸阳性标本的PCR产物片段长度不同,通过比较PCR产物的大小可快速鉴定由阳性对照引起实验室交叉污染。这种新型腮腺炎病毒RNA阳性对照可广泛应用于腮腺炎病毒实验室诊断和基因定型中,对腮腺炎病毒核酸检测可进行良好的实验室质量控制。
- 崔爱利金俐许文波
- 关键词:腮腺炎病毒
- 2001-2017年中国流行性腮腺炎病毒学监测及基因特征分析被引量:24
- 2018年
- 目的阐明中国大陆地区流行性腮腺炎(流腮)病毒学监测进展及腮腺炎病毒(MuV)基因特征。方法依托全国麻疹/风疹实验室网络,自2001年起在全国范围内开展流腮病毒学监测。通过病毒分离、Real-time RT-PCR和RT-PCR等方法对MuV进行实验室检测和病毒基因型别鉴定;依据SH靶基因316个核苷酸序列,分析中国大陆地区MuV基因型别及其分布特征。结果 2001-2017年从中国22个省份共获得MuV SH基因序列451条,通过MuV基因型鉴定,439条(97.33%)为F基因型,12条(2.67%)为G基因型;2001-2017年有多个MuV F基因型分支共循环;G基因型于2011-2016年在局部地区流行。结论中国大陆地区MuV优势流行株为F基因型,G基因型呈局部流行;需加强流腮的持续性病毒学监测。
- 崔爱利朱贞张燕邱琪毛乃颖许松涛姬奕昕王慧玲许文波
- 关键词:腮腺炎病毒病毒学监测基因型