国家自然科学基金(30370029)
- 作品数:10 被引量:54H指数:6
- 相关作者:吴敏周旭华吴月红徐晓红孟凡旭更多>>
- 相关机构:浙江大学新疆师范大学长治职业技术学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 舟山地区26株嗜盐菌的系统发育分析被引量:2
- 2009年
- 初步确定26株嗜盐菌的种属关系。从舟山地区近海和盐田的样品中提取DNA,对其16SrDNA序列PCR扩增和测序,并对其进行系统发育分析。系统发育分析结果表明,26个菌株分布在10个属。26株供试菌中,来自海水的分离株主要是Halomonas属中的成员,而来自盐田的分离株主要是Halobacillus中的成员。
- 周旭华吴敏
- 关键词:16SRDNA序列嗜盐菌系统发育
- 嗜盐古生菌br基因的遗传分析被引量:1
- 2007年
- 从新疆阿尔金山地区阿乌拉仔盐湖分离纯化到几株极端嗜盐古生菌AJ11,AJ12和AJ13,采用PCR技术分别扩增了其16S rRNA基因(16S rDNA)和编码螺旋C至螺旋G的细菌视紫红质(bacteriorhodopsin,BR)蛋白基因片段,测定了基因的核苷酸序列。基于16S rDNA序列的同源性比较以及系统发育学研究表明,分离到的菌株是Natrinema属中成员,并构成一个独立的微生物种群。随后的遗传分析,包括GC含量、转换与颠换的比率、同义突变率分析,表明br基因间具有较高的遗传分歧程度,并面临着净化选择和偏倚突变压的双重抑制。研究为物种资源及BR蛋白资源的进一步利用打下基础。
- 徐晓红吴敏张会斌刘志虎
- 关键词:嗜盐古生菌RDNA系统发育细菌视紫红质
- 舟山地区嗜盐菌的分离和产胞外多糖菌株的筛选被引量:12
- 2007年
- 对浙江舟山地区近海和盐田的样品进行分离检测.从11份泥样和16份水样中共分离纯化120株嗜盐菌,其中多数为中度嗜盐菌或耐盐菌,颜色以白色为主,其次是红色和黄色,细胞形态多为杆状或球状,革兰氏阴性菌株占81.6%.研究表明,嗜盐菌在该地区具有广泛的分布和一定的多样性.以分离菌株为材料筛选产胞外多糖的菌株,发现19株能产生胞外多糖,其中菌株HS239产量较高.
- 周旭华王勇吴敏
- 关键词:嗜盐菌胞外多糖海洋微生物
- 嗜盐菌AB3中细菌视紫红质和系统发育研究被引量:8
- 2005年
- 为了研究分析嗜盐古生菌物种与细菌视紫红质(BR)蛋白基因资源,分离纯化得到极端嗜盐古生菌AB3. 采用聚合酶链式反应(PCR)方法对其编码螺旋C至螺旋 G的蛋白基因片断和 16S rRNA基因进行了扩增,并测定了基因的核苷酸序列. 翻译出的氨基酸序列与已报道的相应片断进行对比,AB3 中的螺旋 C至螺旋 G蛋白与其他菌株差异显著.基于BR蛋白和16S rDNA序列的同源性比较以及系统发育学研究表明,AB3 是 Natrinema属中的新成员. 菌株AB3的16S rDNA序列已被GenBank数据库收录,其序列号为AY277583.
- 俞晓伟迪丽拜尔.托乎提吴月红吴敏
- 关键词:嗜盐古生菌细菌视紫红质RDNA系统发育
- 一个新的Br蛋白基因部分序列测定及分析被引量:10
- 2004年
- 从新疆北部艾比湖分离纯化到极端嗜盐古生菌AB1,采用PCR方法扩增了其165 rRNA基因(16S rDNA)和编码螺旋C至螺旋G的细菌视紫红质(bacteriorhodopsin,Br)蛋白基因片段,并测定了基因的核苷酸序列。基于16S rDNA序列的同源性比较及系统发育学研究表明,AB1是Natronococcus属中新成员。通过对菌株AB1的Br蛋白亲水性分析表明,AB1的Br蛋白与已报道Br蛋白有类似的超二级结构,进一步的蛋白质序列聚合比对结果表明,AB1中Br蛋白螺旋C至螺旋G的氨基酸序列与其他菌株差异明显。研究结果表明菌株AB1的Br蛋白是一种新的Br蛋白。
- 许学伟吴敏阮红黄伟达迪丽拜尔.托乎提
- 关键词:嗜盐古生菌细菌视紫红质RDNA
- 新疆伊吾湖嗜盐菌bop基因多样性被引量:1
- 2007年
- 为了研究新疆中部地区伊吾湖嗜盐微生物和细菌视蛋白基因(bop)资源,分离纯化了95株嗜盐和耐盐菌.并从中挑选了10株红色的菌株,采用PCR和TA克隆的方法,扩增出bop基因螺旋C到螺旋G的核心序列,测定了基因的核苷酸序列.基于bop基因序列的同源性比较和系统发育学分析,发现9个序列分布在同一分支下,表明伊吾湖嗜盐菌bop基因具有一定的多样性和明显的自身地域性.
- 古丽巴哈尔.阿巴拜克利吴敏吴月红邵娇芳
- 关键词:嗜盐菌多样性
- 嗜盐古生菌AJ6的分离及系统发育分析被引量:8
- 2005年
- 从新疆阿尔金山国家自然保护区阿牙克库木湖分离纯化得到嗜盐古生菌AJ6,革兰氏染色呈阴性、杆状、少数球形、菌体大小为0.2~0.6μm×1.6~4.2μm,最适NaCl和Mg2+质量浓度分别为15%和0.6%,在pH为6.0~7.0条件下生长良好.在此基础上,进一步通过PCR方法扩增了菌株AJ6的16SrRNA基因(16SrDNA),测定了该基因的核苷酸序列,并利用"Clustalw"软件和"PHYLIP"软件包分析16SrDNA序列,对其进行同源性比较和系统发育学分析,建立了嗜盐古细菌的系统发育树.结果表明菌株AJ6与Nnm.pallidum、Nnm.pellirubrum和Nnm.versiforme分在同一类群中,16SrDNA序列同源性分别为97.47%,96.44%和98.12%,菌株AJ6是Natrinema属中的一个新成员,命名为Natrinemaaltuensis.菌株AJ6的16SrDNA序列已登陆到GenBank,其序列号为AY277584.
- 徐晓红吴敏曹轶吴月红张婷
- 关键词:嗜盐古生菌RDNA系统发育
- 细菌视紫红质蛋白的光谱分析与光电特性应用被引量:7
- 2004年
- 细菌视紫红质是一种具有光驱动质子泵功能的跨膜蛋白 ,迄今为止已被当作光合作用、质子泵和七螺旋跨膜的受体模型进行研究 .现代生物物理学的发展为研究细菌视紫红质的结构和功能提供了多种有效的方法和手段 ,目前已采用了傅立叶红外光谱、共振拉曼光谱、核磁共振与实时振动光谱等多种分析方法来研究它的光电特性 .细菌视紫红质具有较强的光敏感性 ,能产生光电信号 ,可进行快速的光化学反应等性质 ,这些特性已在众多科学领域得到应用并取得了突破性进展 .另外 ,细菌视紫红质在光致色变。
- 徐晓红吴敏
- 关键词:细菌视紫红质光谱分析光电特性
- 舟山地区抗Mn^(2+)、Cr^(6+)和产功能酶嗜盐菌的筛选被引量:4
- 2010年
- 以浙江舟山地区近海和盐田样品中分离纯化的120株嗜盐菌为材料,筛选产功能酶的菌株,发现其中淀粉酶产生菌有8株,蛋白酶产生菌有5株,脂肪酶产生菌有23株,其中HS238和HS225产量较高,在分离菌株中未检测到纤维素酶活性.选取其中13株进行金属敏感性实验,结果显示菌株HS223,HS239,HS254可以抗2mg·mL-1Mn2+,所有菌株都耐受培养基中10μg·mL-1Cr6+,但没有筛选到产表面活性剂的菌株.
- 周旭华吴敏孟凡旭
- 关键词:嗜盐菌重金属
- 阿牙克库木湖嗜盐菌的分离及功能酶的筛选被引量:14
- 2006年
- 从新疆阿尔金山国家自然保护区阿牙克库木湖采集的泥样和水样中,分离培养了90株嗜盐菌,其中多数为中度和极端嗜盐菌,颜色以红色和白色为主,细胞形态多为杆状、球状,97%呈革兰氏阴性,研究结果表明该湖有着丰富的嗜盐微生物资源.对分离菌株进行了几种重要工业用酶的筛选,发现其中淀粉酶产生菌有4株,菌株AJ225和AJ243淀粉酶活性较高;蛋白酶产生菌有7株;脂肪酶生产菌有13株,菌株AJ238和AJ265具有较高的酶产量;在分离菌株中未检测到纤维素酶和木聚糖酶活性.
- 孟凡旭吴敏张会斌童浩萱殷佳慧
- 关键词:嗜盐菌