浙江省自然科学基金(Y305047)
- 作品数：6 被引量：41H指数：4
- 相关作者：刘光清张玉颖云涛倪征盛祖恬更多>>
- 相关机构：浙江省农业科学院西北农林科技大学甘肃农业大学更多>>
- 发文基金：浙江省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 兔出血症病毒浙江分离株核衣壳蛋白基因的克隆及遗传变异分析被引量：4
- 2008年
- 【目的】探讨兔出血症病毒的遗传变异情况，为兔病毒性出血症的防治提供理论资料。【方法】对1989～2006年7株兔病毒性出血症病毒（RHDV）浙江分离株的核衣壳蛋白基因（VP60）进行了克隆与测序，同时利用分子生物学软件将其与国内外RHDV的基因组序列进行了比对和分析，并绘制了系统发生树。【结果】此7株RHDV的VP60基因均由1740个核苷酸组成，编码580个氨基酸，其与参考序列之间的氨基酸同源性为94．0％～99．8％；系统发生树分析显示，所选的RHDV分离株可分为2个基因群，每个基因群又可分为两个亚群，其中中国分离株主要位于C亚群，与欧洲分离株的遗传距离较近，基因群之间的遗传距离有逐渐加大的趋势。【结论】RHDV在长期流行与演化过程中存在一定的遗传变异趋势。
- 朱金梅刘光清倪征云涛余斌张淼涛
- 关键词：兔病毒性出血症病毒衣壳蛋白基因系统发生树
- 兔出血症病毒分子生物学研究进展被引量：12
- 2006年
- 兔出血症是由兔出血症病毒引起的一种急性、高度致死性传染病,病死率可高达100%,给养兔业带来了巨大的经济损失。近年来,随着对其研究的不断深入,在病毒分子生物学方面取得了很大的进展。文章主要从基因组结构及功能、编码的结构蛋白与非结构蛋白、基因疫苗等方面系统阐述了兔出血症病毒分子生物学方面的研究进展,同时,提出了存在的问题和展望。为进一步研制兔出血症病毒基因工程疫苗及诊断试剂提供理论基础,以期能更有效地防治此病。
- 张玉颖刘光清吴润
- 关键词：兔出血症病毒分子生物学
- 兔病毒性出血症病毒基因组3′端非编码区的分子克隆及生物信息学分析被引量：15
- 2006年
- 采用3′RACE方法对兔病毒性出血症病毒(RHDV)JX／CHA／97株基因组3′端全序列进行了扩增、克隆和测序,并利用ONAstar和DNAman软件分析了RHDV JX／CHA／97株与各参比毒株3′NCR的序列同源性,用RNA structure软件对3′NCR的二级结构进行了预测和分析。结果表明,所扩增的目的基因片段长1500 bp,包括部分VP60基因序列、ORF2基因、3′端非编码区(3′Non Coding Region,3′NCR)和poly(A)尾巴,其中 3′NCR位于ORF2终止密码子TAG之后,长59 bp,poly(A)至少含有27个A;3′NCR序列具有较高的同源性 (93．5％-100％);3′NCR二级结构可以形成2个潜在的茎-环结构(SL1和SL2),其中SL2具有一定的保守性,其形状和形成位置与poly(A)尾巴的长度关系不大,但是SL1的结构和形成位置与poly(A)尾巴的存在与否密切相关,提示poly(A)尾巴与3′NCR高级结构的稳定性以及基因组复制有一定关系。
- 刘光清张玉颖云涛倪征张淼涛梁华丽华炯刚李双茂杜青云盛祖恬
- 关键词：兔病毒性出血症病毒POLY(A)
- 利用反向遗传学技术获得适应RK13细胞的兔出血症病毒被引量：7
- 2006年
- 在前期构建的兔出血症病毒(rabbithemorrhagicdiseasevirus,RHDV)全长cDNA分子的基础上,利用SP6RNA聚合酶系统,在体外转录合成了病毒RNA.用转染试剂将病毒RNA导入RK13细胞,12h后可见明显致细胞病变(CPE),用间接免疫荧光方法在RK13细胞中检测到了病毒抗原的产生.将收获的细胞培养物再次接种RK13细胞,仍然能产生明显病变.大量收取细胞培养物,经差速离心法纯化病毒后,在电子显微镜下可观察到RHD病毒粒子.结果表明,利用反向遗传学技术获得了可适应于RK13培养的RHDV,为将来研究RHDV的分子致病机理和新型疫苗等提供了有利的工具.
- 刘光清倪征云涛张玉颖杜青云盛祖恬梁华丽华炯刚李双茂陈剑平
- 关键词：兔出血症病毒反向遗传学全长CDNA
- 兔病毒性出血症病毒基因组结构与功能研究进展被引量：5
- 2006年
- 刘光清云涛倪征张玉颖
- 关键词：兔病毒性出血症病毒基因组
- 兔病毒性出血症病毒中国株(JX/CHA/97)全基因组分子克隆及序列分析被引量：1
- 2006年
- 本研究首次完成了兔病毒性出血症病毒(Rabbit hemorrhagic disease virus,RHDV)中国分离株JX/CHA/97全基因组序列的测定与分析。研究结果表明,JX/CHA/97株的全基因组由7437个核苷酸组成,其基因组构成为：5′端有一个长度仅为9nt的非编码区,随后有2个阅读框架(ORFs),分别编码一个聚合蛋白和一个结构蛋白。在基因组的3′端也有一个非编码区,长度为59nt。另外,采用RACE方法获得了RHDV的poly (A)尾序,证明该结构至少含有27个A。根据RHDV衣壳蛋白的基因序列,将JX/CHA/97株与来自世界各地的22株RHDV分离株的基因组序列进行了比较与分析,并绘制了系统发生树。结果表明,RHDV各分离株之间存在较高的序列同源性,可以将它们至少分为6个拓朴群,提示RHDV有朝不同方向发生进化的趋势。
- 倪征方维焕张玉颖云涛陈锦清刘光清
- 关键词：兔病毒性出血症病毒克隆
