浙江省自然科学基金(Y305105)
- 作品数:2 被引量:104H指数:2
- 相关作者:刘振陈亮王新超姚明哲许玫更多>>
- 相关机构:中国农业科学院茶叶研究所云南省农业科学院浙江大学更多>>
- 发文基金:浙江省自然科学基金国家高技术研究发展计划浙江省“钱江人才”计划项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 基于EST-SSR的西南茶区茶树资源遗传多样性和亲缘关系分析被引量:87
- 2008年
- 利用本实验室cDNA文库测序所获得的茶树EST序列为主自行开发的24对和他人7对共31对EST-SSR引物,对60份西南茶区茶树资源进行了遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明,西南茶区茶树资源的遗传多样性非常丰富。31对引物共检测到等位位点137个,每个引物为2 ̄8个之间,平均4.42个。遗传多态性信息含量(PIC)在0.09 ̄0.85之间,平均达0.63。观测杂合度(Ho)在0.07 ̄0.94之间,平均值为0.53。UPGMA聚类表明,按相似系数为0.39可将参试的60份种质资源分为五大类。聚类结果在分子水平上显示了我国西南茶区种质资源间的亲缘关系,为以后种质资源保存和新品种选育提供一定的启示。
- 刘振王新超赵丽萍姚明哲王平盛许玫唐一春陈亮
- 关键词:茶树亲缘关系
- 基于表达序列标签(EST)策略的茶树分子生物学研究
- <正>表达序列标签是在人类基因组计划实施过程中,由美国国立卫生研究院生物学家 Venter 提出的发现基因的新战略。EST 技术已被广泛应用于新基因的克隆、组织特异性基因表达谱分析以及基因组序列的功能注释等许多研究领域,...
- 陈亮赵丽萍马春雷张亚丽
- 关键词:茶树表达序列标签基因表达谱RACE
- 文献传递
- 利用EST-SSR分析江北茶区茶树资源的遗传多样性和遗传结构被引量:37
- 2009年
- 利用25对EST-SSR引物对江北茶区的45份茶树初级核心种质的遗传多样性、遗传结构和亲缘关系进行了分析。25对引物共检测到83个等位位点,平均每对引物可检测到等位位点3.3个,可鉴定的基因型为6个。引物的PIC值平均为0.61,扩增位点的观测杂合度高于期望杂合度。45份供试种质中可观测的等位位点平均为4.2个,有效等位位点为2.8个。等位位点观测杂合度平均为0.73,基因多样性指数为0.61,Shannon信息指数为1.11。江北茶区主要省份间茶树种质的遗传分化程度较低(Gst=0.2),而基因流(Nm=3.9)较高。AMOVA分析显示,95.97%的变异发生于居群内。45份供试种质间的遗传相似系数在0.32~0.89之间,聚类分析表明供试资源在亲缘关系上未表现出明显的地区分化。湖北、安徽和陕西三个主要省份茶树种质间的遗传距离平均为0.048,其中陕西资源在亲缘关系上略远于湖北和安徽。
- 姚明哲刘振陈亮王新超马春雷梁月荣
- 关键词:茶树EST-SSR