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广西壮族自治区科技攻关计划(10124001A-47)
广西壮族自治区科技攻关计划(10124001A-47)
- 作品数:2 被引量:7H指数:2
- 相关作者:陈铭伍何文武冼磊胡松黄国雄更多>>
- 相关机构:广西医科大学第一附属医院更多>>
- 发文基金:广西壮族自治区科技攻关计划更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 基因富集及meta分析筛选非小细胞肺癌发生发展关键基因的研究被引量:3
- 2012年
- 背景与目的非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)是全球最常见的恶性肿瘤之一,其发病遗传机制仍不清楚。本研究旨在筛选影响NSCLC发生发展的关键基因和通路,为NSCLC发病遗传机制及靶向治疗的研究奠定科学基础。方法运用基因组富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)以及对单套数据集单个基因元分析(meta-analysis,meta)的方法,筛选出在转录水平上影响NSCLC发生发展的关键通路和基因。结果通过GSEA和meta两种分析方法得出的通路中,重叠性较高的主要为粘着斑通路和细胞骨架肌动蛋白调控通路。在粘着斑通路中31个基因具有统计学意义(P<0.05);细胞骨架肌动蛋白调控通路中32个基因具有统计学意义(P<0.05)。结论粘着斑通路和细胞骨架肌动蛋白调控通路可能与NSCLC的发生发展有重要的联系,后续本研究小组将对这两条通路中的具有统计学意义的基因进行生物功能学上的验证。
- 何文武冼磊王永勇胡艳玲陈铭伍
- 关键词:肺肿瘤META分析通路关键基因
- 非小细胞肺癌PITX1与hTERT mRNA表达相关性分析被引量:4
- 2013年
- 目的:探讨配对同源结构域基因1(PITX1)和人端粒酶逆转录酶(hTERT)基因mRNA在非小细胞肺癌(NSCLC)组织中的表达水平与临床病理因素的关系及其相关性。方法:两步法RT-PCR技术检测91例NSCLC组织和21例支气管扩张或肺大疱等手术切除的良性肺组织中PITX1和hTERT基因mRNA的表达水平。结果:NSCLC组织PITX1基因阳性表达率为24.18%(22/91),明显低于良性肺组织的66.67%(14/21),差异有统计学意义,χ2=14.12,P=0.000。91例NSCLC组织中,hTERT基因过表达72例(79.12%),明显高于其在良性肺组织中的正常表达,χ2=46.52,P=0.000。NSCLC组织PITX1基因mRNA表达与淋巴结有无转移及分化程度(高、中分化与低分化)有关,P值分别为0.004和0.030。hTERT基因mRNA的过表达在不同病理类型中差异有统计学意义,P=0.003。PITX1与hTERT基因的mRNA表达存在相关性,P=0.000。结论:PITX1基因的表达可能对hTERT基因的过表达具有重要的抑制作用;PITX1和hTERT基因mRNA表达状况可能与NSCLC的发生与发展有关。
- 何文武黄国雄胡松冼磊陈铭伍
- 关键词:非小细胞型肺癌HTERT