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中国主要家鹅品种的遗传分化研究被引量：29: 2005年; 利用PCR和DNA测序技术扩增了15个中国家鹅品种线粒体DNA控制区部分序列(1042 bp).研究结果表明:伊犁鹅与14个品种间的核苷酸分歧度最高,为3.805%～4.067%;不同品种内核苷酸多样度表现出较大的差异,为0～0.116%.除伊犁鹅外的14个家鹅品种中,豁眼鹅与其他品种间的核苷酸分歧度为0.211%～0.272%,明显高于其他品种间的0～0.094%.中国家鹅品种的遗传分化格局与地理分布有关,豁眼鹅的分歧时间较早,遗传漂变是导致豁眼鹅遗传分化的主要因素(Nm=0.02～0.54),基因流则是另外13个家鹅品种间遗传分化不明显的主要因素(Nm=12.0～65.33).; 王继文邱祥聘曾凡同史宪伟张亚平; 关键词：线粒体DNA 控制区遗传分化

家鹅线粒体细胞色素b跨膜螺旋结构分析被引量：2: 2006年; 采用PCR和DNA测序技术测定了6个中国家鹅品种和2个欧洲鹅品种25个个体线粒体DNA（mitochondrial DNA，mtDNA）的部分序列，经测序分析表明该序列（1401bp）包括了细胞色素b（cytochrome b，Cytb）基因的完整序列（1143bp）。通过对家鹅线粒体基因组的研究，首次报道了家鹅线粒体Cytb的跨膜螺旋结构，并对家鹅Cytb跨膜螺旋结构及各区域序列的变异特征进行了分析。结果表明：鸿雁、灰雁和白额雁的Cytb具有完整而且完全相同的跨膜螺旋结构；家鹅Cytb基因的核苷酸序列在膜内、膜间和膜外的变异位点数分别为12、9和10，膜内、膜间的变异均属同义替换，而膜外有2个位点发生了非同义替换，表明跨膜螺旋的膜外区域变异程度高于膜间和膜内。研究的结果将为进一步探讨家鹅细胞色索b结构与功能的关系奠定基础。所测定的基因序列已登录国际GenBank数据库，序列号为AY427800-AY427805和AY427812-AY427814。; 刘安芳王继文朱庆; 关键词：MTDNA CYT

家鹅细胞色素b基因系统发育研究: 2005年; 本研究测定了中国家鹅15个品种、欧洲鹅2个品种共44个个体的细胞色素b基因全序列(1143 bp),与Genbank库中白额雁细胞色素b基因序列合并进行比对分析,结果表明:各序列同义替换速率(dS)和非同义替换速率(dN)分别为0．0787和0．0011,dS与dN值间的差异极显著(Z=4．713,P<0.01),dS<0．5,可使用dS值来构建分子系统发育关系树,构建的最大简约树与邻接树拓扑结构一致,支持中国家鹅的双起源学说,即除伊犁鹅外的其它中国鹅品种起源于鸿雁,伊犁鹅和欧洲的郎德鹅、莱茵鹅起源于灰雁。; 陈艳荣王继文; 关键词：细胞色素B 系统发育

家鹅线粒体细胞色素b的同源建模与结构分析: 2014年; 为了解家鹅(Anser domestica)线粒体细胞色素b在电子传递链中的复杂功能,通过测得15个中国家鹅(Anser cygnoides Linn)品种和2个欧洲鹅(Anser anser Linn)品种的细胞色素b基因全序列,利用序列分析软件推导出相应的氨基酸序列;使用同源建模法构建了细胞色素b蛋白高级结构,并对该结构进行分析。结果表明:预测结构包含8个较大的跨膜α螺旋,它们被4个长的松散结构和3个短的易变区连接在一起,另外还有4个较小的螺旋,2个小的β-折叠片层;该结构表面静电势比内部高,分子表面存在2个洞穴,一大一小;经过保守区的查找,发现此结构存在2个结构域,分别为Cyt B_N,CytB_C,bL结合部位、bH结合部位、Qi结合部位和Qo结合部位等4处活性位点被初步定位。; 陈艳荣王继文; 关键词：细胞色素B 同源建模活性位点

家鹅细胞色素b基因序列进化研究被引量：6: 2006年; 测定了中国家鹅15个品种、欧洲鹅2个品种共44个个体的细胞色素b基因全序列(1 143 bp),与Gen-Bank中白额雁细胞色素b基因序列合并在一起比对分析,结果表明:全序列中没有缺失、插入或移码突变,转换数(Ts)明显高于颠换数(Tv),密码子第3位点呈现了相当强烈的转换偏倚性;密码子第1位点的替换速率变异最大;同义密码子表现出一定程度的使用偏倚性;dS与dN值间的差异极显著(Z=4.713,P<0.01),而ω(dS/dN)=0.028 4,明显小于0.3,表明雁属鹅细胞色素b基因序列经历了中度净化选择作用;单步非同义替换分布模式与Grantharm’距离之间的关系说明密码子的3个位点所受的净化选择强度不同,第2位点的净化选择作用强度最大(Granthem距离为204)。; 陈艳荣王继文; 关键词：细胞色素B 分子进化

家鹅品种细胞色素b基因序列分析及其系统发育关系被引量：11: 2005年; 测定了15个中国家鹅和2个欧洲家鹅品种44个个体线粒体细胞色素b基因全序列(1143 bp),并结合GenBank中的野生种白额雁序列比较分析表明,检测到31个可变位点和4种单倍型,没有发现缺失或插入,核苷酸多样度和单倍型多样度分别为0.00648和0.45,密码子第三位点G碱基的含量较低(14.2%),A、T和C的含量极相似,第一二位点的偏倚度(0.057和0.223)低于第三位点(0.492),转换数明显高于颠换数(Ts/Tv=9.5～19),密码子第三位点的转换数最高.系统发育分析结果支持中国家鹅的两个不同起源学说.; 王继文刘安芳陈艳荣瞿浩; 关键词：线粒体细胞色素B 系统发育

家鹅线粒体DNA tRNA^(pro)和tRNA^(thr)基因序列与结构分析被引量：2: 2006年; 采用PCR和DNA测序技术测定了6个中国家鹅品种和2个欧洲鹅品种25个个体线粒体tRNApro(69 bp)和tRNAthr(68 bp)基因的完整序列,通过对家鹅线粒体基因组的研究,首次报道了家鹅线粒体tRNApro和tRNAthr基因的结构,对鸿雁、灰雁、白额雁(Anser albifrons,序列号为AF363031)雁属种间tRNApro和tRNAthr基因的二级结构及序列的变异特征进行了分析,并通过家鸡(Gallus gallus domesticus,序列号为NC001323)与鸿雁家鹅间tRNApro和tR-NAthr基因二级结构的比较,初步进行了鸡形目与雁形目两个目间tRNApro和tRNAthr基因二级结构及序列变异的分析。结果表明:家鹅tRNApro和tRNAthr基因均可折叠成标准的三叶草形二级结构;2个tRNA基因三叶草结构的氨基酸臂、反密码子环在鸿雁、灰雁和白额雁种间以及鸡形目与雁形目两个目间没有变异,具有高度的保守性。本研究的结果将为进一步探讨家鹅线粒体DNA tRNApro和tRNAthr基因序列与结构、功能的关系奠定基础。所测的序列已登录GenBank数据库,序列号为AY427800~AY427805和AY427812~AY427814。; 刘安芳王继文朱庆; 关键词：线粒体DNA

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