教育部科学技术研究重点项目(109126)
- 作品数：7 被引量：7H指数：2
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- 环境-致癌过程相关基因启动子区多态性及其单体型的功能分析
- 背景:目的基因非编码区存在的遗传变异(genovariants)可通过影响转录因子或与靶向序列的结合,对目的基因的转录和表达起调控作用,特别是调控区基因多态性(regulatory polymorphisms)的功能学作...
- 林忠宁
- 关键词：基因多态性单体型功能分析致癌作用
- 文献传递
- 75例广东籍汉族人蛋白磷酸酶2A-B56γ亚基基因5’-侧翼区多态性分析被引量：1
- 2011年
- 目的探讨蛋白磷酸酶2A(PP2A)-B56γ亚基基因(PPP2R5C)启动子区的多态性和人群分布。方法随机选取广东汉族健康人群的全基因组DNA,聚合酶链反应(PCR)获得PPP2R5C基因5’-侧翼区的目的片段产物直接再测序,序列比对并确证遗传变异位点,采用HaploV iew软件进行等位基因型人群分布的分析、并与国际单体型图谱计划(Hap-Map)数据进行比较。结果成功测序75例健康人(150条染色体)PPP2R5C基因-1933nt^+241nt的目的片段,发现该人群中存在5个遗传变异位点且各等位基因型在年龄组和性别之间分布差异无统计学意义(P>0.05),最小等位基因频率(MAF)分别为-1447C>T(0.67%)、-1430G>A(19.33%)、-1274T>C(19.33%)、-563G>C(19.33%)和-526T>C(0.67%);与HapMap的中国北京人群和其他国外人群MAF和分布数据略为不同,但差异无统计学意义(P>0.05)。结论筛查出和首次报道PPP2R5C基因5’-侧翼区在中国南方广东汉族健康人群中的多态性位点及其等位基因型的分布。
- 林育纯陈慧峰陈宇曦林丽娜罗洁李文张树江赖关朝吴邦华唐小江陈雯林忠宁
- 关键词：多态性
- 锌影响镉对人未成熟树突状细胞毒性作用被引量：1
- 2011年
- 目的探讨锌对镉诱导的人未成熟树突状细胞(iDC)毒性的影响。方法分离人周围血单核细胞(PBMC)并诱导为iDC后,分组给予生理氯化钠溶液(对照组)、氯化镉(CdCl2组)、硫酸锌(ZnSO4组)、锌预处理后加氯化镉(Zn+Cd组)、锌离子特异性螯合剂(TPEN)预处理后加氯化镉(TPEN+Cd组)处理。噻唑蓝(MTT)颜色反应法检测细胞活力;单细胞凝胶电泳(SCGE)检测DNA链断裂损伤;吖啶橙(AO)与碘化丙啶(PI)核双染观察细胞凋亡并通过流式细胞仪检测凋亡细胞中染色体断裂的亚二倍体(SubG1)。结果 CdCl2组iDC活力抑制率随CdCl2呈剂量依赖性显著增高(P<0.05);与ZnSO4组或CdCl2组相比,Zn+Cd组和TPEN+Cd组细胞活力抑制率明显升高(P<0.05);相同CdCl2剂量(20μmol/L)时,Zn+Cd组和TPEN+Cd组细胞的彗星尾长和尾矩明显增大(P<0.05);各处理组出现凋亡细胞核染色和SubG1阳性细胞比例明显增加。结论镉化合物暴露导致iDC活力降低,其诱导的细胞毒性明显高于锌;细胞内锌稳态干预可增加镉介导的iDC内DNA损伤相关的毒作用敏感性。
- 李文林育纯陈慧峰罗洁李晓杰林丽娜胡耀明张树江陈雯林忠宁
- 关键词：未成熟树突状细胞镉锌免疫毒性DNA损伤
- 核因子I-B高表达对肝L02细胞中蛋白磷酸酶2A-B55δ靶向调控研究
- 2013年
- 目的构建核因子I-B基因(NFIB)真核表达重组质粒,应用于其高表达调控肝细胞中蛋白磷酸酶2A(PP2A)的B亚基基因转录的功能学验证。方法逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)获得人NFIB mRNA片段,克隆入真核绿色荧光蛋白表达载体(pEGFP-N1),构建pEGFP-NFIB重组质粒后,分别给予250、500、1 000 ng转染永生化人正常肝L02细胞建立NFIB高表达细胞模型(相应设为250、500和1 000 ng剂量组),对照组为250 ng pEGFP-N1转染的L02细胞,荧光定量聚合酶链反应检测NFIB mRNA,激光共聚焦和免疫印迹法(WB)检测核因子-1(NF-1)蛋白水平。电泳迁移率实验分析与NF-1相结合的DNA序列的特异性,荧光素酶报告基因检测PP2A-B55δ亚基基因(PPP2R2D)启动子区的转录活力,RT-PCR和WB检测细胞内PPP2R2D mRNA和PP2A-B55δ蛋白水平。结果双向测序证实pEGFP-NFIB重组表达质粒构建成功。与对照组比较,各剂量组L02细胞中NFIB mRNA相对水平增高(P<0.01),增强型绿色荧光蛋白、NFI-B蛋白表达水平均升高(P<0.05)。NF-1可与PPP2R2D基因启动子区(2R2Dp)-462G>A不同多态性序列结合,NFIB高表达使L02细胞中2R2Dp-462G启动子活力下降(P<0.05),PPP2R2D mRNA和PP2A-B55δ蛋白水平均升高(P<0.05)。结论成功构建人NFIB真核表达重组质粒,应用于人肝细胞中证实NF-1靶向PPP2R2D的功能学调控作用。
- 麦剑荣林育纯陈慧峰陈宇曦夏斌廖昆张玉静高艳芳林忠宁
- 关键词：蛋白磷酸酶2A
- 广东人群PP2A-B亚基基因5′-侧翼区多态性连锁不平衡和单体型分析被引量：2
- 2011年
- 目的探讨蛋白磷酸酶2A（PP2A）的调节B／PR558亚基基因5’-侧翼区多态性的连锁不平衡和人群单体型分布特征。方法选取经体检排除急慢性疾病的50例广东汉族健康人群为调查对象，以人胱舵D基因5’-侧翼区中-1684A〉G（rslll46169）、-1196C〉T（rs9419202）、-462G〉A（rs7074421）和-1610A〉T为4个纳入的多态性位点，采用HaploView软件分析遗传特征、连锁不平衡（LD）和单体型分布，进行人群分布的x2检验。结果50例广东汉族人群中各多态性位点基因型频率均符合Hardy—Weinberg平衡（P〉0．05）；杂合度（π）分别为-1684A〉G（0．020）、-1610A〉T（0．132）、-1196C〉T（0．059）和-462G〉A（0．059），且均不存在变异纯合型，其中在-1196C〉T和-462G〉A位点明显低于HapMap人群（P〈0．05）；-1196C〉T和-462G〉A位点之间呈完全LD，但其他位点间未见LD关系；构建了该人群的3种单体型（HI～H3），频率分布主要是野生单体型（H1，89．0％），其余2种变异单体型分别为H2（7．0％）和H3（3．0％）；筛选出的3个标签SNP为-1684A〉G、-1610A〉T和-462G〉A。结论确定并报道中国南方广东汉族人群PPP2R2D基因5’-侧翼区中相对保守的标签SNP和单体型分布，为进行该基因启动子区的功能分析提供依据。
- 张树江林育纯陈慧峰万建新林丽娜罗洁李文陈雯林忠宁
- 关键词：蛋白磷酸酶2A单体型
- 镉对PP2A-B56γ高表达的人肝L02细胞中基因转录和细胞毒性的影响
- 目的探讨人正常肝细胞内蛋白磷酸酶2A（PP2A）-B56γ亚基（PPP2R5C）高表达对镉诱导相关基因转录水平和细胞毒性的影响,及其去磷酸化的作用机制。材料和方法构建B56γ高表达L02-2R5Cc细胞株和空白载体L02...
- 罗洁林育纯陈慧峰李文李晓杰张树江林丽娜胡耀明陈雯林忠宁
- 关键词：镉肝细胞毒性基因转录调控
- 文献传递
- 广东汉族人群PP2A-Aα亚基基因5'-侧翼区多态性的单体型分析
- 目的探讨中国广东汉族人群蛋白磷酸酶2A(PP2A)-Aα亚基PPP21A基因5'-侧翼区多态性的连锁不平衡(LD)和人群单体型分布特征。材料与方法采用Haploview软件分析筛查到的PPP2R1A基因5'-侧翼区中7个...
- 陈慧峰林育纯林丽娜李文罗洁张树江万建新陈雯林忠宁
- 文献传递
- 广东人群PP2A-Aα亚基基因5′-侧翼区单体型分析被引量：3
- 2011年
- 目的探讨蛋白磷酸酶2A(PP2A)-Aα亚基基因启动子区多态性的人群单体型分布特征。方法采用Haploview软件分析部分广东汉族人群PPP2R1A基因5′-侧翼区筛查到的7个多态性位点的遗传学特征、连锁不平衡(LD)、标签(tag)SNP和单体型(域)分布。结果各多态性位点基因型频率均符合H-W平衡(P>0.05);各位点在该人群的杂合度(π)不同,且在-568G>A和+87T>C与HapMap中的不同人群存在明显差异(P<0.05);-1039G>T(+Ins)与+87T>C和+108A>G、-568G>A与-241-/G位点之间呈强LD,+87T>C与+108A>G之间为完全LD;构建该人群中的5种单体型(H1～H5),频率分布为野生单体型(H1)53%、其余4种变异单体型(H2～H5)为44%;得到两个单体型域,筛选出-1039G>T(+Ins)、-512G>A、-241-/G、+107-/C为4个tag SNP,并确定了2个单体型域内标签SNPs(htSNP)及其分别代表的单体型。结论首次确定并报道中国广东汉族健康人群PPP2R1A基因5′-侧翼区的标签SNP和单体型(域)分布。
- 陈慧峰林丽娜李文罗洁张树江万建新林忠宁陈雯林育纯
- 广东汉族人群蛋白磷酸酶2A-B55α亚基基因(PPP2R2A)5'侧翼区多态性的分析
- 目的探讨蛋白磷酸酶2A(PP2A)-B55α亚基基因PPP2R2A启动子区的多态性及其在特定人群中分布规律。方法随机选取广东健康汉族人群的全基因组DNA样本,PCR获得PPP2R2A基因5'-侧翼区-1707nt～+30...
- 林育纯林丽娜张骁陈慧峰万建新罗洁李晓杰陈宇曦李文张树江胡耀明林忠宁陈雯
- 关键词：多态性
- 文献传递
- 锌影响镉对体外诱导未成熟人树突状细胞的毒性作用
- 目的探讨锌对镉化合物诱导人未成熟树突状细胞（iDC）毒性作用的影响。方法分离人外周血单核细胞,体外诱导获得iDC;分别给予生理盐水（对照组）,氯化镉（CdCl组）;硫酸锌（ZnSO组）;硫酸锌预处理后给予氯化镉（Zn+C...
- 李文林育纯陈慧峰罗洁李晓杰林丽娜胡耀明张树江陈雯林忠宁
- 关键词：树突状细胞镉免疫毒性锌
- 文献传递
