国家重点实验室开放基金(20050012)
- 作品数：1 被引量：3H指数：1
- 相关作者：李军陈刚杨艳陈国华李波更多>>
- 相关机构：湖南大学重庆大学更多>>
- 发文基金：重庆市应用基础研究项目教育部“春晖计划”霍英东基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 支持向量机和线性判别分析用于禽流感病毒编码蛋白识别被引量：3
- 2007年
- 以支持向量机(SVM)和线性判别分析(LDA)对200条禽流感病毒、100条B型流感和100条C型流感病毒蛋白共400条为训练集样本,从表征序列的200个整体与局部变量中以逐步(stepwise)方法选取24个变量作为LDA模型的输入建立线性识别模型,病毒蛋白总识别率达99.8%,留一法交互检验总识别率为99.4%.从原始200变量中经主成分分析得16个主成分作为SVM的输入,以径向基核函数(RBF)SVM建立非线性识别模型,病毒蛋白总识别率为99.8%,留一法交互检验总识别率为99.2%.以100条禽流感、50条B型流感和50条C型流感病毒编码蛋白质共200条为测试集样本,得LDA模型,对其总识别正确率为95.4%,SVM模型对其总识别正确率为96.5%.识别结果表明,两个模型都可较好识别禽流感病毒蛋白,并且SVM对禽流感病毒蛋白的识别结果优于LDA.
- 梁桂兆陈泽聪杨善彬梅虎周原舒茂杨力杨胜喜郑小林陈国华周鹏田菲菲廖春阳吴世容李根容李德静何留甘孟瑜高剑坤陈国平王贵学龙莎景举华曾晖张巧霞张梦军杨娟仝建波王娇娜刘永红李波仇亮�
- 关键词：禽流感病毒
