国家质检公益性行业科研专项(200910188-3)
- 作品数:2 被引量:7H指数:2
- 相关作者:王斌杨晓农严玉宝余华刘群更多>>
- 相关机构:西南民族大学四川出入境检验检疫局更多>>
- 发文基金:国家质检公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 成都地区犬细小病毒VP2基因克隆分析及基因型鉴定被引量:5
- 2011年
- 根据GenBank中犬细小病毒(canine parvovirus,CPV)VP2基因序列设计合成两对特异性引物1F/1R和2F/2R,从疑似CPV感染病犬的粪便病料中提取DNA作为模板,分段扩增涵盖VP2基因的两个片段,大小分别为1325和758bp,并进行克隆、测序,通过拼接得到11条长度为1755bp的VP2基因完整序列。核苷酸同源性分析表明,扩增得到的11个完整VP2基因序列与GenBank中发布的21株国内外参考毒株比较,核苷酸同源性为96.2%~99.8%。采用DNAStar软件分析,预测VP2蛋白可能成为B细胞表位的区段位于Met1-Val38、Met73-Val82、Met96-Ala103、Lys151-Thr170、Gly235-Phe243、Leu294-Phe303、Ala359-Thr399、Ile469-His483、Ala503-Arg520、Lys570-Tyr584。将扩增获得的VP2基因编码的氨基酸序列与CPV参考毒株进行比较,第426位和第555位氨基酸残基分别为Asp和Val,鉴定出本试验得到的CPV基因型均为2a型,初步证实成都地区仍以CPV-2a为主要流行毒株。
- 杨晓农张焕容杨发龙于学辉龙虎刘群陈世界严玉宝余华王成东项振义王斌
- 关键词:VP2基因克隆基因型
- 犬细小病毒病的PCR诊断被引量:2
- 2011年
- 根据GenBank中收录的犬细小病毒(CPV)AY787930.1株设计一对特异性引物,建立了一种快速、准确的诊断CPV的PCR方法.从12份疑似犬细小病毒病的粪便中提取DNA,并以此DNA为模板,进行PCR扩增和克隆及测序.应用该方法对12份临床病料进行PCR扩增,有11份为阳性,1份为阴性;对11份阳性片段的克隆、测序结果与AY787930.1株的相应片段相比,同源性为99.9%.该方法适用于所有易感动物的犬细小病毒的临床诊断,与胶体金试纸相比具有快速、准确和特异性好的优点.
- 王斌刘倩杨晓农陈娟
- 关键词:PCR