艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项(2013ZX10003006-002)
- 作品数：4 被引量：3H指数：1
- 相关作者：陈晨张雯张媛媛王斌邓建平更多>>
- 相关机构：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室自贡市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 四川省川南地区结核分枝杆菌Spoligotyping分型研究被引量：1
- 2015年
- 目的了解四川省川南地区结核分枝杆菌基因型构成情况,为结核病防控提供分子流行病学依据。方法采用间隔区寡核苷酸分型(Spacer Oligonucletide typing,Spoligotyping)方法对四川省川南地区267株临床分离菌株进行基因分型,结果采用BioNumerics(Version 5.10)软件进行分析,并将Spoligotyping分型结果与SpolDB4.0数据库中的菌株进行比对分析。结果 267株结核分枝杆菌表现出66种基因型,其中51株表现为独特基因型,其余216株可聚为10个基因簇。与SpolDB4数据库比对分析发现,267株结核分枝杆菌中,144株为北京家族菌株(53.93%),79株为T家族菌株(29.59%),9株为H家族菌株,3株为U家族菌株,2株为MANU家族菌株,其余30株表现的基因型为数据库中不存在的基因型。结论四川省川南地区结核分枝杆菌存在较高的基因多态性,北京家族菌株和T家族菌株为主要的流行菌株,应加强对这两类菌株的流行趋势的监测及生物学特性研究。
- 邓建平刘海灿王斌董海燕张正东赵秀芹李群万康林
- 关键词：结核分枝杆菌间隔区寡核苷酸分型北京家族
- 肠杆菌科菌株基因组水平上的遗传差异(ANI)及其在菌种鉴定上的应用
- 2013年
- 本研究探讨了高通量测序方法在肠杆菌科菌种鉴定中直接应用的可能性,第一次提出并验证了基因组平均遗传相似度(ANI)指标在肠杆菌科鉴定中的有效性,为该技术的进一步发展提供了数据积累。
- 张雯杜鹏程王海印于伟文张媛媛陈晨
- 关键词：肠杆菌基因组菌种鉴定
- 卡介苗各亚株间Rv1985c和Rv1986基因缺失的研究被引量：2
- 2013年
- 目的明确卡介苗群体内在Rv1985c和Rv1986两个位点上的遗传差异。方法基于结核分枝杆菌设计引物,针对21株卡介苗标准株和临床株进行Rv1985c和Rv1986两个位点的PCR鉴定,鉴定基因的缺失情况。结果 21株卡介苗中10株缺失Rv1985c基因,11株缺失Rv1986基因。结论卡介苗中部分菌株中两个基因位点的缺失,为今后的疫苗改造提供了备选位点,同时本研究中所建立的PCR方法也可以在临床上用于部分卡介苗菌株与结核分枝杆菌的快速鉴别。
- 张雯张媛媛陈晨
- 关键词：结核卡介苗
- 结核病阳性血清特异结合蛋白的筛选与鉴定
- 2019年
- [目的]从T7噬菌体展示的结核分枝杆菌基因组DNA文库中筛选结核病阳性血清特异结合蛋白。[方法]以饱和硫酸铵法初步纯化的结核病阳性血清为靶分子,对结核分枝杆菌基因组DNA文库进行3轮生物淘选;PCR扩增阳性噬菌体的外源DNA片段,测序后进行BLAST分析;间接ELISA和斑点免疫印迹试验检测阳性噬菌体与结核病阳性血清能否特异结合。[结果]经过3轮生物淘选,与结核病阳性血清特异结合的噬菌体得到明显富集;BLAST结果表明随机挑取的19个阳性噬菌体包括4种不同的序列,其中编码核糖激酶的序列出现次数最多;这些代表性噬菌体均能与结核病阳性血清特异结合。[结论]成功筛选到能与结核病阳性血清特异结合的4种蛋白,其中核糖激酶可能为与结核病阳性血清特异结合的优势抗原。
- 易小妹王丽罗丹王忠刚李玲玲廖雅婷曾焱华
- 关键词：结核分枝杆菌
