中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2012hzs1J003-1)
- 作品数：5 被引量：19H指数：3
- 相关作者：黄俊生杨腊英郭立佳刘磊王国芬更多>>
- 相关机构：中国热带农业科学院海南大学更多>>
- 发文基金：公益性行业(农业)科研专项中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 香蕉枯萎病菌SNF1基因的克隆及生物信息学分析被引量：2
- 2012年
- 为了解SNF1基因在香蕉枯萎病菌致病过程中的作用以及FOC1和FOC4两个生理小种之间的致病力差异关系,采用了PCR、RT-PCR的方法扩增了2个生理小种的SNF1基因,测序并采用生物信息学软件对相似序列进行搜索、比对,并对该基因编码的预测蛋白进行氨基酸序列比对和分析。研究结果显示,2个生理小种的SNF1基因的ORF分别为2 136、2 130 bp,二者相差6个碱基,同源性为99.5%。FOC1和FOC4的SNF1基因分别编码711、709个氨基酸,相差两个氨基酸,为丝氨酸(FOC1)和谷氨酰胺(FOC1)。生物信息学软件预测结果表明该蛋白N端不存在信号肽,但具有两个相同的功能结构域位点,分子量约为79 ku,pI为6.80。
- 刘一贤周端咏毛超汪军黄俊生
- 关键词：香蕉枯萎病菌生理小种细胞壁降解酶
- 香蕉枯萎病病原菌Six同源基因的鉴定被引量：6
- 2013年
- 为鉴定香蕉枯萎病病原菌Six同源基因,通过BLASTP分析从香蕉枯萎病病原菌1号生理小种菌株N2基因组中鉴定了Six1和Six6同源基因,从4号生理小种B2菌株基因组中鉴定了Six1、Six2、Six6和Six8同源基因。采用PCR扩增从亚热带4号生理小种菌株基因组DNA中扩增到Six7同源基因,并从其它一些1号和4号生理小种菌株基因组DNA中也扩增到了Six2和Six8同源基因。上述结果表明,不同古巴专化型菌株Six基因组成可能不同。该研究结果为进一步研究香蕉枯萎病病原菌Six基因的功能奠定了基础。
- 郭立佳杨腊英彭军王国芬梁昌聪刘磊黄俊生
- 关键词：枯萎病专化型尖孢镰刀菌
- FoAP1基因在香蕉枯萎病菌致病过程中的功能分析被引量：3
- 2013年
- 为了探究AP1转录因子在尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种(Foc4)中是否参与香蕉枯萎病的致病过程,借助尖孢镰刀菌Fo5176菌株(GenBank序列号:AFQF01001482.1)全基因组序列,通过PCR和RT-PCR技术克隆获得了Foc4中AP1转录因子的基因组DNA和cDNA编码序列。利用PEG介导的原生质体转化法获得AP1基因敲除转化子。利用qRTPCR分析AP1可能调控的下游基因表达。利用灌根法(直接在根部浇菌)检测了AP1缺失突变体的致病能力。结果表明Foc4的AP1转录因子cDNA编码序列长1 770 bp,编码63.9 kDa(589 aa)蛋白,是一个典型的bZIP型转录因子,命名为FoAP1;FoAP1缺失突变体的气生菌丝大量减少,菌丝的入侵生长受到严重限制。对外源氧化胁迫不敏感,但致病能力减弱。
- 齐兴柱杨腊英郭立佳黄俊生
- 关键词：尖孢镰刀菌古巴专化型香蕉枯萎病
- 香蕉枯萎病菌1号和4号生理小种菌株侵染和定殖巴西蕉和粉蕉根系的观察被引量：9
- 2013年
- 尖孢镰刀菌古巴专化型1号和4号生理小种菌株对巴西蕉和粉蕉的致病性不同,其在巴西蕉和粉蕉根系的侵染和定殖过程是否不同仍未阐明。笔者将绿色荧光蛋白标记的1号(T320)和4号(B2-63)生理小种菌株分别接种巴西蕉和粉蕉,借助激光共聚焦显微镜观察侵染过程。发现这2个生理小种菌株菌丝均可沿巴西蕉和粉蕉根系表层细胞之间的凹槽生长,并进一步侵入维管束;而且B2-63侵入粉蕉根系维管束快于其侵入巴西蕉根系维管束。在接种T320菌株15 d后,在轻微褐变的巴西蕉球茎组织中未观察到其菌丝体,而在褐变粉蕉球茎中可观察到。推测T320在粉蕉根系维管束中的扩展较其在巴西蕉根系维管束中的扩展容易。结果为进一步研究尖孢镰刀菌古巴专化型生理小种与不同基因型香蕉的互作奠定基础。
- 郭立佳梁昌聪张建华杨腊英王国芬刘磊黄俊生
- 关键词：尖孢镰刀菌古巴专化型绿色荧光蛋白标记侵染定殖
- 香蕉枯萎病菌fow2基因的克隆及其序列分析
- 2013年
- 为了解fow2基因在尖镰刀菌古巴专化型(Fusarium oxysporum f.sp.Cubense,Foc)侵染香蕉过程中的作用,同时比较Foc的1号和4号生理小种中fow2基因的差异,采用PCR和RT-PCR方法,分别扩增了这2个生理小种的fow2基因,并对测序结果进行生物信息学分析。测序结果显示,以Foc1、Foc4的gDNA为模板,这两个生理小种的PCR扩增产物大小分别为2 439、2 440 bp;而以cDNA为模板,PCR扩增产物大小分别为1 992、1 986 bp。分析结果表明,两个基因都含有6个外显子和5个内含子;没有信号肽,也没有跨膜结构;但根据PROSITE蛋白位点分析,2个生理小种的fow2基因存在一些差异。
- 杜和禾黄俊生
- 关键词：香蕉枯萎病生物信息学分析
