国家自然科学基金(81373050) 作品数:11 被引量:55 H指数:4 相关作者: 陆家海 景钦隆 郭中敏 郭小芹 杨智聪 更多>> 相关机构: 中山大学 广州市疾病预防控制中心 中山大学附属第三医院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广东省自然科学基金 广州市卫生局医药卫生科技项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
中东呼吸综合征流行现状与防控新理念 被引量:3 2015年 中东呼吸综合征(Middle East respiratory syndrome,MERS)是由一种新型冠状病毒引起的呼吸系统疾病,2012年首次报道,病死率较高,且近年来发病例数明显上升,范围也逐步扩大,引起了广泛的关注。2015年5月26日,中国出现了首例输入性MERS病例,建立相应的防控体系刻不容缓。作者对目前MERS的流行现状进行概述,结合"One Heal"理念,阐述针对MERS等人兽共患病的防控策略,为新发传染病的防控提供新的思路。 黄嘉炜 郭小芹 陆家海2014年西非埃博拉出血热流行状况与防控研究 被引量:14 2014年 自1976年首次发现埃博拉病毒以来,埃博拉疫情在非洲时有报道,而2013年年底开始至今的西非埃博拉疫情正以前所未有的肆虐之势蔓延.截至2014年8月31日,本次疫情共发现病例3 707例,其中死亡1 848例,规模已超过既往各年疫情的总和.针对该病,目前仍无正式上市的特效药物和疫苗,但WHO已允许临床试验药物和疫苗在西非疫情中的干预研究.鉴于此,需要在优化卫生资源配置的基础上,针对传染病传播的3个基本环节进行全面防控,同时在"惟一健康(One Health)"的框架下,通过公共卫生与兽医领域的专家的共同合作,从源头上控制疫情的发生和发展. 张应涛 刘康康 陆家海关键词:埃博拉出血热 1953-2016年基孔肯雅病毒的系统进化及蛋白质多样性分析 被引量:2 2017年 目的对1953-2016年基孔肯雅病毒的主要流行株进行分子进化特征和氨基酸位点变异情况分析,为防控基孔肯雅病毒的流行提供理论依据。方法在NCBI数据库检索1953-2016年基孔肯雅流行株,按照暴发情况筛选代表性毒株35株,使用Scan Prosite软件对基孔肯雅病毒蛋白的功能区域进行预测,用Clustal X和Mega 6.06生物软件对于筛选的35株代表株的核苷酸和氨基酸序列进行分析,构建种系进化树并分析氨基酸变异情况析。结果进化树显示35株基孔肯雅病毒对应其3个基因型分支为3簇,分别对应基孔肯雅病毒的3个基因型:东/中/南非型(19株)、亚洲型(13株)和西非型(3株),各蛋白同源计分比值均为0.96以上。E2关键抗原表位(共19个氨基酸)也有变异,其中19株东/中/南非型毒株序列有1处位点(H18Q)发生替换,西非型毒株未发生变化,13株亚洲型毒株也显示有1处位点(N5H)变化。结论基孔肯雅病毒进化较为保守,但在其重要功能区域出现一些位点的突变,关注其进化情况对于基孔肯雅防控工作有积极意义。 聂恩琼 郭小芹 张应涛 陆家海关键词:基孔肯雅病毒 血小板计数、白细胞总数与登革热临床类型的相关性 被引量:5 2016年 目的探讨血小板计数、白细胞总数与登革热临床类型之间的相关性。方法在2014年广州市白云区确诊的登革热病例中随机抽取典型登革热病例308例、登革出血热或登革休克综合征病例79例。回顾性收集其人口学信息及临床资料,分别应用单因素和多因素Logistic回归进行分析。结果相对于血小板计数正常组,血小板计数中度减少组和重度减少组发生登革出血热/登革休克综合征的风险均更大,调整后OR值分别为5.02(95%CI:2.01~12.79)和13.45(95%CI:1.50~304.60);而血小板轻度减少组与正常组差异无统计学意义,调整后OR值为1.23(95%CI:0.61~2.60)。相对于白细胞总数正常组,白细胞总数轻度减少组或重度减少组发生登革出血热/登革休克综合征的风险也更大,调整后OR值分别为4.39(95%CI:1.22~28.13)和7.20(95%CI:1.97~46.65)。结论登革热患者血小板计数和白细胞总数减少程度越大,出现登革出血热/登革休克综合征的风险越高。 陈英安 景钦隆 杨勤华 张应涛 杨智聪 陆家海关键词:登革热 血小板计数 白细胞总数 登革出血热 登革休克综合征 寨卡和登革病毒流行病学相似性分析 被引量:4 2019年 寨卡病毒(ZIKV)和登革病毒(DENV)在分子结构和流行特征方面具有很多相似性,登革热疫情现在已经作为很多模型预测寨卡流行的参考。全面综合和对比ZIKV和DENV在宿主、传播途径、易感人群方面的异同,对了解2者的关系有重要意义。同时结合广东省登革热疫情、寨卡疫情,分析2者在广东省的流行情况,为防控提供参考意见。 刘荣飞 陈盈 陆家海Rogerson空间模式监测在登革热疫情早期预警中的应用价值 被引量:1 2015年 目的探讨Rogerson空间模式监测方法在登革热病例聚集早期预警中的应用价值。方法利用Rogerson空间模式监测方法对广东省2005-2011年登革热疫情数据进行回顾性分析,得出最佳监测参数组合。用该组合分析登革热高发年份2006年和低发年份2009年,比较预警结果与实际发病的拟合情况。本研究同时采用Kulldorff时空扫描统计量方法分析上述数据,比较两种方法的优劣。结果 Rogerson空间模式监测方法可早期及时发现登革热病例聚集,在登革热早期预警中具有一定应用价值。与Kulldorff时空扫描统计量方法相比,Rogerson空间模式监测可更精确地探测登革热病例聚集,提供更为详细的预警时间,并可提供所有监测区域的聚集信息,但聚集区域判断方面较为繁琐,不够直观。Kullforff则可直接报告聚集区域,但其所提供的聚集时间不如前者精确详细,且不能报告所有监测地区的聚集情况。结论两种方法各有优缺点,应结合使用,发挥最大功效。 夏尧 景钦隆 刘康康 陆家海关键词:登革热 寨卡病毒的分子流行病学进展及流行风险预测 被引量:3 2017年 寨卡作为新发传染病在2015年引起了广泛重视,了解其分子结构、系统发生以及流行历史,有助于理解寨卡病毒(ZIKV)暴发的原因。寨卡病毒和登革病毒(DENV)在流行病学上有诸多的相似性,登革热疫情对预测寨卡病毒的流行风险具有重要的参考价值。因此,本文对寨卡病毒的分子流行病学研究进展和风险预测做一综述。 刘荣飞 肖琴 郭中敏 陆家海关键词:登革病毒 寨卡病毒全基因组多序列比对及遗传进化分析 被引量:3 2017年 目的分析寨卡病毒不同毒株分离的时间、地区以及基因型分布,基因序列的相似性,核苷酸的变异及遗传进化趋势,为寨卡的防控提供生物信息学方面的依据。方法应用Bio Edit Sequence Alignmemt Editor软件,DNAStar 7.1及Mega 7.0软件对NCBI-Nucleotide中收录的85条寨卡病毒全基因组核苷酸序列及遗传进化进行分析,探索寨卡的起源及传播过程。结果寨卡病毒组内核苷酸序列最低相似性为94.5%,最高相似性为100%;65株全基因序列中,共有765处碱基发生变异,组内变异率在0.00%~24.44%;在所有的碱基突变中,碱基转换占84.32%,而碱基颠换占15.68%;分离时间、地区相近的菌株,其遗传距离较近。结论寨卡病毒存在较高变异,这些变异可能在寨卡病毒本身的毒力、致病性及传播方式的改变中发挥重要作用。 刘兰兰 郭小芹 吴建勇 郭中敏 陆家海关键词:遗传进化 格林-巴利综合征 基孔肯雅病毒全基因组的多序列比对及遗传进化分析 被引量:4 2015年 目的 了解基孔肯雅病毒(Chikungunya virus,CHIKV)毒株的时间、地区及基因型的分布情况,不同时间和地区分离毒株的相似性,核苷酸位点的变异情况以及病毒的遗传进化趋势,为基孔肯雅热的预防和控制奠定基础。方法 对美国国立生物技术信息中心(NCBI)中收录的CHIKV毒株全基因组序列共133条用DNAStar7.1软件进行核苷酸和氨基酸相似性比较及变异分析,用Mega6.06进行遗传进化分析。结果 CHIKV组内核苷酸序列相似性在97.7%~100.0%之间,CHIKV组内氨基酸序列相似性在80.3%~100.0%之间,组内相似性较高,变异率较低;CHIKV碱基间的转换较为常见占碱基突变的81.02%;分离时间、地区相近的毒株遗传距离较近,不同谱系的东/中/南非型毒株已蔓延至欧亚各地区。结论 CHIKV毒株存在一定的变异,但具有较高的遗传稳定性。 龙遗芳 柯昌文 郭中敏 陆家海关键词:基孔肯雅病毒 基因频率 广州市2001-2010年输入性登革热监测与流行特征研究 被引量:13 2013年 目的分析2001-2010年广州市输入性登革热病例的流行病学特征,探讨防控策略和措施。方法从国家《疾病监测信息报告管理系统》、登革热个案调查表和调查报告收集病例资料,设计并建立输入性登革热病例数据库,采用描述流行病学方法分析其流行病学特征。结果2001-2010年广州市共报告输入性病例83例(3.40%),每年均有病例报告。2006-2010年报告61例,比2001-2005年的22例多了39例,增幅达177.27%。除1月份无病例报告外,各月份均有输入性病例报告,高峰期在8-11月份(53例,63.86%)。最大来源地区为东南亚,共67例(80.72%),包括印度尼西亚14例(16.87%)、泰国12例(14.46%)、柬埔寨11例(13.25%)、越南10例(12.05%)、新加坡8例(9.64%)、马来西亚7例(8.43%)、菲律宾3例(3.61%)和缅甸2例(2.41%)。入穗后发病28例(33.73%),入穗前发病55例(66.27%)。结论广州市输入性登革热压力逐渐增加,输入性病例的发现和报告重点在于加强出入境口岸的检疫能力,提高医疗机构的及时诊断率和报告率。 景钦隆 张競文 李意兰 曹庆 罗雷 龙遗芳 肖新才 陆家海 杨智聪关键词:输入性 登革热 防控策略