潍坊医学院医学检验学系
- 作品数：213 被引量：793H指数：13
- 相关作者：宋伟宋淑亚刘丹董娜路晓红更多>>
- 相关机构：中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心天津医科大学代谢病医院内分泌研究所山东大学附属省立医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金山东省自然科学基金中国高等教育学会医学教育专业委员会医学教育研究立项课题更多>>
- 相关领域：医药卫生文化科学生物学环境科学与工程更多>>
- 潍坊地区血小板捐献汉族人群HLA-A、B和HPA1-17系统基因多态性研究被引量：8
- 2015年
- 目的探讨潍坊地区汉族血小板捐献者HLA-A、B和HPA1-17系统基因多态性区域分布特点,初步建立血小板捐献者HLA、HPA基因资料库。方法分别采用PCR-SSOP和PCR-SSP方法对200名无血缘关系的汉族血小板捐献者做HLA-A、B和HPA1-17系统基因分型,计算基因频率、基因型频率。结果受检者共检出HLA-A位点14个,HLA-B位点30个,其中HLA-A座位频率较高的有A*02、A*11、A*30和A*24,基因频率分别为0.317 5、0.1450、0.127 5、0.125 0;HLA-B座位频率较高的有B*15、B*13、B*40和B*51,基因频率分别为0.157 5、0.145 0、0.1200、0.100 0。每个标本均检测到HPA1a、4a、5a、7a-14a、16a、17a基因,HPA7a-14a、16a、17a呈单特异性,未检测出相应的等位基因HPA-b;在HPA1-17中,杂合度最高的是HPA15,基因型HPA15a/15a、HPA15a/15b、HPA15b/15b频率分别是0.28、0.565、0.155;其次为HPA3,基因型HPA3a/3a、HPA3a/3b、HPA3b/3b频率分别是0.355、0.51、0.135。经χ2检验,结果符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律。结论探明了潍坊地区汉族血小板捐献者HLA-A、B和HPA1-17系统区域性分布特点,为免疫性血小板减少患者寻找匹配的血小板提供保障。
- 冯云飞宿军杨春晴步立强车玲玲赵玲朱传福张毅
- 关键词：HLAHPA基因多态性血小板输注无效
- 长链非编码RNA TUG1在肝细胞癌中的生物信息学分析被引量：2
- 2018年
- 目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)在肝细胞癌(HCC)中的意义,并对TUG1进行靶基因预测,为TUG1在HCC中的进一步研究提供借鉴。方法利用UALCAN数据库分析TUG1在HCC中的差异表达,并对TUG1进行生存分析。利用RegRNA 2.0生物学软件、HMDD、targetscan、microT-CDS进行TUG1的靶基因预测,构建lncRNA TUG1-microRNAs-mRNAs调控网络。并运用FunRich平台对预测的靶基因进行Gene Ontology(GO)分析和KEGG信号转导通路富集分析。结果 TUG1在HCC中表达明显增高,随着肿瘤分级增高TUG1的表达呈上升趋势。lncRNA TUG1低表达患者的总生存期较高表达患者明显延长。TUG1上存在hsa-mir-122-5p、hsa-mir-200a-3p、hsa-mir-34c-3p、hsa-mir-629-3p这4个与HCC相关microRNAs的可能结合位点,从而调节下游245个靶基因,形成了lncRNA TUG1-microRNAs-mRNAs调控网络。在生物学过程中,microRNAs靶基因高度富集到碱基、核苷、核苷酸和核酸代谢调节等过程。KEGG pathway分析中,microRNAs靶基因高度富集到Syndecan、TRAIL等介导的信号通路。结论TUG1在HCC中表达水平增高,并与不良预后有关。利用生物信息学方法,可以从分子水平探究肿瘤发生机制,可为后续实验及临床诊疗提供有价值的信息。
- 朱玉翠张晓彤周亚男胡成进胡成进
- 关键词：肝细胞癌靶基因生物信息学
- 自噬在人类免疫缺陷病毒和结核分枝杆菌共同感染中的作用
- 2018年
- 人类免疫缺陷病毒/结核分枝杆菌(HIV/M.tb)共同感染已经成为发展中国家的主要公共卫生威胁。自噬是一种溶酶体分解代谢过程,正常状态下维持细胞内环境的稳态,还涉及细胞内病原体如HIV-1和M.tb的清除,可增强机体的免疫防御能力。本文概述在HIV-1和M.tb单独感染以及共同感染的背景下自噬对机体免疫防御的调控,全面了解病原体与自噬的相互作用,展望未来开发基于自噬原理新的预防性疫苗和治疗干预措施的巨大潜力。
- 张霞张霞付玉荣李猛高昆山高昆山
- 关键词：自噬人类免疫缺陷病毒结核分枝杆菌
- 结核分枝杆菌CarD蛋白结构与功能的生物信息学分析被引量：12
- 2017年
- 目的应用生物学信息分析软件预测结核分枝杆菌CarD蛋白的结构和功能。方法运用NCBI中Blast工具,将结核分枝杆菌H37Rv carD基因序列与GenBank中相似序列进行核苷酸比对;利用MEGA 6.06软件,采用邻位相连法构建N-J进化树;运用ClustalX 2.1软件,将结核分枝杆菌H37Rv CarD及与其同源性较高的分枝杆菌CarD氨基酸序列进行多重比对分析;登录ExPASy网站,运用ProtParam工具分析CarD蛋白的理化性质,运用ProtScale进行蛋白质疏水性分析,运用SignalP 4.1Server预测蛋白质信号肽,运用TMHMM Server v.2.0以及TMPred预测蛋白质跨膜螺旋区,运用SOPMA预测蛋白质二级结构,运用SWISS-MODEL进行蛋白质三级结构同源建模;运用NetPhos 3.1Server预测蛋白质磷酸化位点;运用NCBI中CDD工具预测CarD蛋白保守结构域。结果分枝杆菌carD基因序列相似度为100%,进化关系较近。H37Rv与田鼠分枝杆菌起源于同一物种,同源性较高。CarD分子在进化过程中高度保守,为稳定、亲水性蛋白,无跨膜区、无信号肽,蛋白序列中存在4个丝氨酸磷酸化位点,二级结构中以α-螺旋为主,三级结构同源建模成功。CarD蛋白是一种结合RNA聚合酶的转录调控因子,属于CarD/CdnL/TRCF家族。结论 CarD蛋白为RNA聚合酶结合蛋白,调控转录和控制结核分枝杆菌的生长。该蛋白序列保守稳定,是治疗结核病潜在的新靶标。
- 张德峰付玉荣伊正君
- 关键词：结核分枝杆菌CARD生物信息学分析
- 巨噬细胞内microRNA与结核分枝杆菌相互作用的研究进展被引量：6
- 2017年
- 结核分枝杆菌(MTB)为结核病的病原菌,感染机体后主要寄生于巨噬细胞内。MiRNA是一类内源性非编码小分子RNA,在转录水平上负向调控基因的表达。miRNA在MTB感染机体后部分可稳定存在于巨噬细胞内,miR-125a,miR-144,miR-146a,miR-155等表现出明显的上调或下调的变化。本文就巨噬细胞内miRNA与MTB相互作用的研究进展作一综述。
- 袁秋露付玉荣伊正君
- 关键词：结核分枝杆菌MIRNA巨噬细胞MIR-155
- 基于MALDI-TOF MS技术食管鳞癌诊断预测模型的建立及初步验证被引量：6
- 2019年
- 目的建立食管鳞癌诊断预测模型,寻找食管鳞癌潜在肿瘤标志物。方法收集59例食管鳞癌患者及57例体检健康者血清标本,按照3∶1随机分为训练组(患者44例,健康人对照42例)和验证组(患者15例,健康人对照15例)。弱阳离子交换磁珠(WCX-MB)提纯血清蛋白质/肽后,经基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)检测,筛选出差异表达蛋白质/肽,构建诊断预测模型并初步验证。结果经Clin ProTools软件分析,共筛选出差异多肽峰31个(P<0.05),其中18个峰差异有统计学意义(P<0.01);与健康人对照组相比,8个峰在食管鳞癌组中表达上调; 10个峰在食管鳞癌组中表达下调。其中差异峰m/z 2 660.84和m/z 5 336.49的ROC曲线下面积(AUCROC)分别为0.95和0.91,且均在食管鳞癌组中表达上调。应用遗传算法(GA)建立的食管鳞癌诊断预测模型经验证其准确性为93.10%,敏感性为92.90%,特异性为93.30%。结论建立的食管鳞癌诊断预测模型能较好的用于食管鳞癌辅助诊断,多肽峰m/z 2 660.84和m/z 5 336.49有望成为食管鳞癌潜在肿瘤标志物。
- 张婷王娜娜杨璐陈英剑胡成进
- 关键词：基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱蛋白质组学食管鳞状细胞癌肿瘤标志物
- 浅谈医学检验专业实验教学考试改革
- 实验教学对培养应用型医学检验专业人才至关重要，考试是评价实验教学成败的手段。因此，建立科学的实验教学考试评价体系是实验教学面临的重要任务。但目前的实验教学考试评价内容过于单一，严重影响了实验教学质量的提高。本文就医学检验...
- 李猛邵丽军伊正君付玉荣
- 关键词：实验教学考试改革
- 基于医学研究生创新能力培养的导师指导能力提升策略被引量：14
- 2020年
- 导师指导能力在专业性和创新型研究生培养过程中起到毋庸置疑的主导作用,通过总结导师指导方法和医学研究生培养的现状和实际情况,分析目前存在的一些问题,如课程单一化、科研能力培养缺乏有效组织和科学管理等。并针对这些问题提出几点合理建议,如强化科学方法指导观、提升科研水平、建立科学系统的科研创新制导能力等,为研究生导师指导能力提升提供借鉴。
- 李文静付玉荣伊正君
- 关键词：导师
- 结核分枝杆菌LepB蛋白的功能预测及生物信息学分析被引量：4
- 2018年
- 目的应用生物信息学方法预测分析结核分枝杆菌Rv2903c基因编码蛋白LepB的结构与功能。方法在GenBank数据库中获取Rv2903c的基因信息;运用ProtParam及ProtScale预测其编码LepB蛋白的理化性质及亲疏水性;应用NetPhos、TMHMM、MotifScan分析LepB的磷酸化位点、跨膜区及翻译后修饰位点;分别利用SOPMA、SWISS MODEL分析LepB蛋白的二级结构并建立三级结构模型;利用Bepired、BCpred及SYFPEITHI、NetMHCIIpan预测LepB蛋白的B细胞与T细胞表位。结果 Rv2903c编码的LepB蛋白含有294个氨基酸残基,亲水系数-0.230,为亲水性蛋白。LepB含有21个磷酸化位点,存在一处跨膜区域,二级结构以无规则卷曲为主(占55.1%),结构较疏松,利用SWISS-MODEL建构建出LepB蛋白的三级结构。LepB蛋白含有9个B细胞抗原表位。结论 LepB蛋白是结核分枝杆菌的信号肽酶,切割完成蛋白质分泌的信号肽。生物信息学预测LepB是跨膜蛋白,含有多个抗原表位,可作为结核治疗的潜在分子靶标。
- 袁秋露付玉荣伊正君
- 关键词：结核分枝杆菌生物信息学
- 对临床微生物学检验实验教学改革的探讨
- 为了提高临床微生物学检验实验课的教学质量，使学生获得更多、更全面、更扎实的专业理论知识和操作技能，提高学生实践能力和创新意识，我们对以往临床微生物学检验实验课教学中存在的问题做了总结并对其进行一些改革与探讨。
- 楚海荣
- 关键词：实验教学临床微生物学检验
