长治医学院中心实验室
- 作品数：41 被引量：53H指数：3
- 相关作者：常艳丽赵美蓉刘畅郭颖郭萍更多>>
- 相关机构：山西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室山西医科大学基础医学院湖南医科大学肿瘤研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金山西省自然科学基金山西省高等学校大学生创新创业训练项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学经济管理更多>>
- DCLK1的空间结构和理化性质分析被引量：1
- 2018年
- DCLK1(Doublecortin-like kinase 1)是胃肠道肿瘤干细胞的分子标志物,也是一个潜在的基因治疗分子靶点,但其致癌机制和预后价值仍未被完全阐明。为了全面认识DCLK1,本文利用生物信息学手段,对DCLK1蛋白的理化性质、组织表达、亚细胞定位、信号肽、跨膜结构域、空间结构、蛋白质相互作用网络及序列同源性进行分析。结果表明人DCLK1基因编码729个氨基酸组成的蛋白,在进化过程中高度保守,属于TGS超家族和PKc_like超家族,是碱性不稳定的亲水蛋白,无信号肽和跨膜区域。该蛋白定位于细胞核的可能性最大,主要二级结构为无规卷曲。经GO分析和KEGG通路分析可知,与DCLK1相互作用的蛋白中,NOTCH蛋白、PRDM8和PRUNE2值得深入研究,预示DCLK1存在更为复杂的作用机制。本文结果为进一步研究DCLK1的功能及致癌机制提供了一定的参考。
- 刘畅刘安
- 关键词：生物信息学相互作用蛋白
- 2010—2013年山西省东南部地区新农合住院患者恶性肿瘤构成和顺位分析被引量：3
- 2015年
- 目的:了解山西省东南部地区新型农村合作医疗(新农合)恶性肿瘤住院患者构成情况,为配置卫生资源提供科学依据。方法:按照经济发展水平随机选取山西省东南部地区2010—2013年4个县的新农合住院恶性肿瘤患者的资料进行收集整理,分析恶性肿瘤住院患者疾病构成。结果:4年新农合恶性肿瘤住院人数共6 384人,前10位恶性肿瘤疾病住院人次数为5 856人,占4年新农合全部恶性肿瘤住院人数的91.73%。前5种恶性肿瘤分别为食管癌、胃癌、贲门癌、宫颈癌、肺癌。男性主要以消化道肿瘤为主,女性主要以妇科肿瘤为主。50岁以下人群除了消化道肿瘤外,宫颈癌、乳腺癌和肺癌等非消化道肿瘤占了很大的比重;50岁以上的人群主要以消化道肿瘤为主。结论:山西省东南部地区4年新农合住院患者恶性肿瘤疾病构成中,前10位肿瘤类型基本未发生变化。男性主要以消化道肿瘤为主,女性主要以妇科肿瘤为主,尤其是女性乳腺癌顺位逐年提前,老年人群以消化道肿瘤为主,应加强对这些恶性肿瘤的防治,提高农村居民的健康水平。
- 杨建洲李志芳郭崇政原建慧李奇纪爱芳
- 关键词：新型农村合作医疗恶性肿瘤疾病构成住院患者
- miR-105对2种胃癌细胞株生物学功能的影响被引量：1
- 2018年
- 目的:探讨miR-105对胃癌细胞生物学功能的影响。方法:采用实时荧光定量PCR法(RTqPCR)检测miR-105在细胞株GES-1和SGC-7901中的表达水平。转染miR-105 mimics后,设立为miR-105mimics组,并同时设立阴性对照组(NC组)。RT-qPCR法检测miR-105表达水平,MTT法检测细胞活力,细胞计数试剂盒(CCK-8)法检测细胞增殖能力,划痕实验检测细胞迁移能力,Caspase3活性检测细胞抗凋亡能力。通过生物信息学软件分析预测miR-105的下游靶向调控基因蛋白激酶(AKT1),RT-qPCR和Western Blot检测AKT1表达水平变化。结果:miR-105 mimics转染SGC-7901后,miR-105的表达水平为2.58±0.08,与NC组相比明显增高(P<0.05);miR-105 mimics组胃癌细胞活力为1.38±0.08,随着时间递增细胞增殖能力增强,高于NC组(P<0.05);迁移能力增强到128.2±4.22,高于NC组(P<0.05);miR-105mimics组Caspase3活性在48h降到最低为0.53±0.13,低于NC组(P<0.05);miR-105mimics组中AKT1表达水平为1.54±0.03,高于NC组(P<0.05)。结论:miR-105能促进胃癌细胞SGC-7901增殖,增强其细胞活力、迁移能力,抑制其凋亡,可能参与了胃癌发生发展过程。
- 郭萍曹文君麻丽霞任晨霞郭颖
- 关键词：胃癌细胞增殖凋亡
- 脂多糖结合蛋白在胃癌组织中的表达及其意义的生物信息学分析被引量：1
- 2021年
- 目的:通过生物信息学方法分析脂多糖结合蛋白(LBP)在胃癌组织中的表达及意义。方法:从Ualcan数据库获取正常胃组织及胃癌组织LBP表达数据,利用GEPIA数据库分析LBP表达与胃癌患者预后的关系,在LinkedOmics中检索LBP在胃癌中的共表达基因,通过GO富集分析、KEGG通路分析确定这些基因参与的生物学过程及功能。最后利用STRING数据库分析相关基因编码蛋白的互作网络。结果:与正常胃组织相比,Ⅰ和Ⅲ分期、老年和男性患者胃癌组织中LBP表达水平均明显升高,但与幽门螺杆菌感染与否无显著相关性。在胃癌中与LBP共表达的基因主要涉及急性炎症反应、激活蛋白级联、蛋白质-脂质复合物亚基组织等生物学过程,介导货物受体活性、脂多糖结合、蛋白质-脂质复合物的绑定、糖胺聚糖绑定等分子功能,富集于血液微粒、蛋白质-脂质复合物、内质网腔等细胞组分。富集的KEGG信号通路主要与补体和凝血级联、胆固醇代谢、PPAR信号等通路相关。LBP高表达患者的总生存率和无病生存率明显低于LBP低表达患者。LBP蛋白与TLR4、STAT3、IL-6、STAT6、IL-4、IL-10、JAK1、JAK2、JAK3、SOCS3等存在互作关系。结论:LBP在胃癌组织中高表达,且与胃癌的发生、发展及预后密切相关,可以作为胃癌筛选、预后预测的标志物之一。
- 任晨霞武翠玲韩鹏勇
- 关键词：胃癌脂多糖结合蛋白生物信息学分析
- 氢化物-原子吸收光谱法测定人凝血酶原复合物中锑的含量
- 2020年
- 目的建立人凝血酶原复合物中锑含量的测定方法。方法使用氢化物-原子吸收光谱法测定人凝血酶原复合物中锑的含量。结果锑含量在0-25.0 ng/ml范围内呈良好的线性关系,相关系数大于0.99;检出限为0.5533 ng/ml,定量限为1.844 ng/ml;加样回收率为95.93%-118.62%。结论本研究所建立方法简单、快速、灵敏度高,可用于测定人凝血酶原复合物锑的含量。
- 吴勰乾韩杨霍建富连建科任飞
- 关键词：锑
- 2010—2013年某县新农合利用情况的横断面调查
- 2016年
- 目的:通过研究2010—2013年农民新农合参合率、住院率、补偿比和负担比等指标变化情况及常见慢性病的患者住院服务利用情况,发现当前存在的问题,为新农合制度的进一步改革提供科学依据。方法:将2010—2013年期间参合住院农民报销的原始资料整理录入数据库。采用SPSS18.0软件,对住院人次、住院费用、药物费用、补偿比和负担比等指标进行统计描述性,2组或多组间比较采用H检验、χ2检验等。结果:2010—2013年,研究地参合率从96.71%提高到99.41%,基本实现全覆盖;参合农民住院人次逐年提高,次均补偿比由47.13%增加到55.12%,次均住院负担比由48.41%降低到45.02%,药费比从41.51%下降到36.60%;恶性肿瘤次均住院费用最高。结论:研究地新农合基本实现全覆盖,参合农民住院服务利用率逐年提高,住院补偿比逐年增加,但负担比仍旧沉重,尤其是恶性重大疾病和慢性病负担比最为明显。
- 李志芳杨建洲李奇纪爱芳冯向先
- 关键词：新型农村合作医疗住院费用
- 人PRMT5基因的生物信息学分析被引量：2
- 2019年
- PRMT5 (Protein arginine methyltransferase 5)已经广泛地作为组蛋白甲基转移酶修饰H4R3、H2AR3和H3R8,从而潜在地影响多个信号传导途径。本研究为了对人PRMT5基因进行生物信息学方面的深入分析,以PRMT5基因序列及编码蛋白序列为材料,通过生物信息学方法分析了PRMT5基因的DNA序列、启动子及CpG岛、RNA结构,及该蛋白的理化性质、亚细胞定位、信号肽与跨膜区域、互作蛋白、系统发育等。研究结果表明,人PRMT5在物种间的保守性相对较高,位于染色体14q11.2,大小为1 911 bp,潜在核心启动子在1 014~1 064 bp,没有预测到CpG岛。PRMT5基因编码637个氨基酸残基,分子量为10 157 Da,等电点为5.88,不稳定系数是44.33;该蛋白更可能定位于细胞质,无明显的信号肽及跨膜结构;主要的二级结构元件是α-螺旋结构和无规卷曲,包含一个SAM-dependent MTase功能结构域,同时有10个可能的互作蛋白;进化分析表明黑猩猩和猕猴与人PRMT5蛋白亲缘关系最近。
- 郭萍任晨霞麻丽霞郭颖曹文君
- 关键词：生物信息学分析
- 企业实践教学在医学微生物学实验技术教学中的应用探索被引量：3
- 2019年
- 参照实验课程教学经验,制定医学实验技术专业的《医学微生物学实验技术》课程教学计划,增加企业实践教学。建设"双师素质"教学队伍,选取意愿强烈、专业基础扎实的学生参与企业的产品研发和生产活动,培养具有专业性的创新创业精神、良好职业素养的应用型人才。从学校、企业、学生三方面评价企业实践教学效果,在企业实践教学中总结成绩、发现不足,为进一步开展企业实践教学积累经验。
- 陈云霞王金胜张翠英张雄鹰孟莉麻丽霞崔国艳程红兵
- 关键词：应用型人才
- 基于网络药理学对金银花抗癌机制的研究被引量：2
- 2020年
- 目的:研究金银花治疗癌症的有效成分及作用机制。方法:通过数据库检索金银花的有效成分、作用靶蛋白等信息,构建"药物-化学成分-靶蛋白-疾病"网络,进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路、基因本体(GO)富集分析,研究金银花活性成分的抗癌机制。结果:构建一种药物,23种有效活性成分,248个相应靶蛋白的"药物-化学成分-靶蛋白-疾病"网络。有效成分包括槲皮素、木犀草素、金圣草素和山柰酚等;作用靶蛋白包括肿瘤转移相关的基质金属蛋白酶(MMP2、MMP1)、肿瘤坏死因子(TNF)等;KEGG通路富集分析包括磷脂酰肌醇激酶3(PI3K)等97条通路。结论:金银花抗癌是多成分、多靶标、多途径的作用机制。
- 徐彩霞张鑫韩鹏勇
- 关键词：金银花抗癌网络药理学
- IL-17调控溃疡性结肠炎分子机制的生物信息学分析被引量：3
- 2023年
- 目的利用生物信息学方法分析溃疡性结肠炎(UC)的枢纽基因和关键通路。方法通过基因表达数据库(GEO)下载UC表达谱芯片GSE134025。利用R语言的Limma包筛选UC组与正常组肠黏膜细胞差异表达基因,对这些基因进行GO和KEGG分析;利用STRING数据库构建蛋白互作网络(PPI)并将结果导入Cytoscape筛选出核心基因;利用KEGG mapper绘制核心基因所在的信号通路图。结果筛选出190个差异表达基因,其中147个上调,43个下调。GO分析结果表明,差异表达基因主要涉及炎症反应、细胞增殖的正调控等生物学过程,主要富集于细胞膜、质膜等细胞成分,具有肝素结合、生长因子等分子功能。KEGG分析显示差异基因主要富集于趋化因子信号通路,细胞因子受体相互作用等相关信号通路。从PPI网络中筛选出10个枢纽基因:白细胞介素6(IL-6)、CXC趋化因子配体8(CXCL8)、CXCL10、CXCL1、CXCL9、膜联素A1(ANXA1)、IL-1β、CC趋化因子配体20(CCL20)、CXCL2、CXCL11,其中多个基因位于IL-17调控的信号通路下游。结论发现了10个与UC发病风险相关的枢纽基因,IL-17可能通过这些核心基因调控UC的发生发展。
- 武翠玲任晨霞
- 关键词：溃疡性结肠炎核心基因
