南华大学生命科学与技术学院SNP研究所
- 作品数：17 被引量：76H指数：5
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- 发文基金：国家自然科学基金湖南省自然科学基金教育部科学技术研究重点项目更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 核化线粒体的进化加速作用与转基因人模型分析被引量：4
- 2004年
- 生物分子钟的应用在当代生物研究领域具有十分重要的意义。然而 ,分子钟仅能用于粗略估计不同种群生物间的进化时程 ,间接表明进化可能不是或不仅仅是由于中性突变通过遗传渐变所造成 ;相反 ,染色体DNA与外源性DNA之间 ,以及染色体DNA相互之间的大量基因重组 ,则可能是推动进化进程的更大动力之一。鉴于人体内的线粒体DNA是一种外源性环状DNA ,人类可认为是一种天然发生的整合了外源性线粒体DNA的转基因物种。本文引入转基因人分析法并应用这一方法探讨与人类进化过程相关的基因重组。通过对人、小鼠、大鼠进行核化线粒体组学分析 ,发现人类染色体基因组含有大量与线粒体DNA同源的核酸片段 ;人体基因组内核化线粒体基因在重组数与总碱基长度上均较小鼠和大鼠高出数倍。人体内大量存在的线粒体DNA介导的基因重组可能在促进人类进化中发挥了一定的作用。
- 李凯廖端芳张佳陈琳玲彭翠英王春
- 关键词：线粒体分子钟进化
- DNA聚合酶与DNA复制的忠实性
- 2008年
- DNA复制过程的忠实性对生命的存在与延续起着关键作用，而DNA聚合酶是影响DNA复制忠实性的最重要因素。本文就DNA聚合酶的种类和结构以及它们与DNA复制忠实性的关系作一综述。
- 祖旭宇陈铎廖端芳李凯
- 关键词：DNA聚合酶
- 湖南娄底地区汉族人群内皮素基因rs5370G/T多态性研究被引量：1
- 2007年
- 目的了解湖南省娄底地区汉族人群原发性高血压相关的内皮素(ET-1)基因的rs5370G/T单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)分布,并与Genbank多种族人群进行比较。方法收集湖南娄底地区84名无血缘关系的汉族人群的静脉血,其中健康个体57名,高血压患者27名,提取DNA,应用PCR/SNP敏感性分子开关对ET-1基因rs5370G/T多态性进行分析,并与Genbank中的多种族人群的分布进行比较分析。结果湖南娄底地区汉族人群中ET-1基因rs5370G/T的G、T的频率分别为51.2%和48.8%,且不同性别间高血压人群与正常人群间均未见显著差异,在高血压人群与正常人群中G的频率分别为0.537,0.518(χ2=0.056,P>0.05)。然而在Genbank中,ET-1基因rs5370G/T的G、T基因频率分别为80.4%和19.6%,与湖南娄底地区人群比较有显著性差异(χ2=22.132,P<0.001)。结论湖南娄底地区汉族人群中ET-1基因rs5370G/T多态性与高血压无相关性,与Genbank中的多种族人群比较分布有明显的差异,这种差异可能是导致高血压在不同种族间的表现有所不同的遗传因素之一。
- 吴孟津廖端芳彭翠英胡卫民王春周翠兰
- 关键词：单核苷酸多态性种族差异
- 比较全血DNA提取法适用单核苷酸多态性分析被引量：4
- 2005年
- 目的比较两种提取冰冻全血基因组DNA的方法,即分离白细胞法和裂解红细胞法所获得基因组DNA的质量。方法分别测定所获DNA的效率和纯度,同时,笔者用PCR/SNP敏感性分子开关技术,对两种方法获得的模板DNA进行单核苷酸多态性(single-nucleotidepolymorphism,SNP)分析。结果结果显示分离白细胞法DNA产量与纯度均高,裂解红细胞法获得的DNA产量、纯度相对较低;PCR/SNP敏感性分子开关检测表明:分离白细胞法和裂解红细胞法制备的DNA模板,均可在体外进行有效的PCR扩增,但分离白细胞法获得的目的DNA带特异性凸显,而裂解红细胞法获得的目的带特异性相对较差。结论预先分离纯化白细胞是从冰冻全血中获得较高纯度DNA和有效提高DNA产量的重要操作步骤。
- 彭翠英陈琳玲秦志峰胡卫民李凯廖端芳李国庆
- 关键词：SNP分析聚合酶链式反应
- 单核苷酸多态性及其检测方法被引量：13
- 2004年
- 彭翠英廖端芳张佳陈琳玲李凯
- 关键词：单核苷酸多态性基因突变
- 个体基因差异与艾滋病的防治
- 2009年
- 本研究室曾在1998年讨论了CCR5用于艾滋病防治的可能性,随后提出了骨髓移植治疗艾滋病的观点。通过移植对HIV具有一定抗性的CCR5-Δ32突变基因型骨髓,能让机体免受HIV侵袭,避免HIV侵入正常细胞内寄生,将有可能使其从艾滋病患者逆向转化成HIV携带者,甚至病毒消失。同时,本研究室还进一步提出了可以有效克服异体骨髓移植弊端的自体骨髓移植疗法,即通过对其自身造血干细胞进行CCR5基因特定体外致突变。最近报道称进行CCR5-Δ32突变基因定向骨髓移植,成功治愈了艾滋病。显然,通过针对CCR5或其它提高HIV抗性的特定靶标的骨髓移植或干细胞基因干预,在HIV防治中有一定的实用价值。
- 廖端芳郭紫芬李凯
- 关键词：艾滋病骨髓移植
- 两种冰冻全血基因组DNA提取方法的比较被引量：2
- 2004年
- 目的比较挑取白细胞法和裂解红细胞法获得人冰冻全血中的白细胞，提取基因组DNA的方法。方法分别分析DNA的收获量和OD260／0D280比值，同时，用PCR/SNP敏感性分子开关技术对两种方法获得的模板DNA进行SNP分析。结果挑取白细胞法DNA收获率高，纯度高，裂解红细胞法得到的DNA的产量和纯度相对较低；用PCR/SNP敏感性分子开关检测表明挑取白细胞法和裂解红细胞法制备的DNA模板可进行有效的体外扩增，但挑取白细胞法目的条带特异，而裂解红细胞法有扩增条带但有非特异带。结论对冰冻全血推荐采用挑取白细胞法进行大规模血样DNA的提取，建立高质量的DNA库，用于复杂疾病的基因检测和疾病SNP相关性研究。
- 彭翠英陈琳玲李凯易岚刘运莲廖端芳
- 关键词：白细胞全血红细胞SNP血样
- 核化线粒体组学与转基因人分析法被引量：3
- 2003年
- 二十世纪遗传与基因工程技术的发展为人类从生物化学和遗传学角度探索基因及其产物的分子机制开辟了新途径。然而,现有基因工程技术,特别是转基因技术,因伦理学上的原因并不完全适用于涉及人类自身的生物医学研究。因此,有待新技术与方法的建立以使基因工程策略能更好地用于人类基因组水平的研究。本文提出一种转基因人分析法即以人类染色体DNA与线粒体DNA的重组作为研究对象。我们将这种研究线粒体DNA与染色体DNA的相互作用的科学称之为核化线粒体组学。利用核化线粒体组学方法,一个长度为16 kb与人类线粒体参考序列NG-001807具有94％同源性的人类古线粒体已组装完成,其无疑将对现代医学与进化研究具有不可估量的作用。
- 李凯李凯廖端芳廖端芳
- 关键词：线粒体DNA进化
- DNA聚合酶高保真机理的新发现及其在SNP分析中的应用被引量：13
- 2005年
- 高保真DNA聚合酶在遗传与进化等生命活动中具有十分重要的生理与病理意义。高保真聚合酶除具有广为人知的校正功能外,最近的实验进一步表明, 由不能及时校正或难于纠正的错配碱基引发的“关”闭 DNA聚合反应的效应, 同样保证了DNA聚合反应终产物的纯度。高保真聚合酶这一“关”闭 DNA聚合反应的能力, 促成了其与耐外切酶消化的3′末端碱基特异性引物共同构成一个 SNP敏感性纳米级复合分子“开/关”,高保真聚合酶分子中相距三纳米的聚合中心和3′→5′外切酶酶解中心则既合作又独立地起到了复合分子开关中“开”和“关”的效能:对于配对的引物,则直接在该酶的聚合中心进行聚合反应,即“开”的效应;而对于 3′末端错配的引物,则从该酶的聚合中心转移至3′→5′外切酶的酶解中心,由于引物修饰了的 3′末端耐外切酶的特点,继而出现了一种长时间无酶解产物的酶解过程,最后因酶的聚合中心空转而“关”闭 DNA聚合反应,即“关”的效应。这一新的复合分子“开/关”在很大程度上满足了后基因时代对SNP分析的要求。该SNP分子开关的应用, 使基因诊断提高到单碱基水平。同时, 利用该方法通过SNP对基因组扫描, 在单基因遗传病病因研究及法医学鉴定上具有很强的理论和实用价值。
- 陈琳玲张佳彭翠英廖端芳李弘剑高汉林李凯
- 关键词：DNA聚合酶分子开关
- 肿瘤化疗药物中的表遗传药理学研究被引量：3
- 2006年
- 表遗传事件与肿瘤的发生、发展密不可分。近年来,对肿瘤化疗药物的研究已不再局限于原有单独使用经典的化疗药物,而发展到从表遗传药理(epigenetic pharmacology)角度进行单独或联合用药的深入研究。现就与表遗传药理相关的甲基化抑制剂、去乙酰化酶抑制剂、两者联合使用及其与经典化疗药物联合应用的研究进展进行综述。
- 肖莉周翠兰陈琳玲高汉林廖端芳李凯
- 关键词：表遗传甲基化抑制剂去乙酰化酶抑制剂化疗
