吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室
- 作品数:475 被引量:1,040H指数:14
- 相关作者:唐敖庆张明瑜孙延波杨丽李作盛更多>>
- 相关机构:黑龙江大学化学化工与材料学院东北师范大学化学学院东北师范大学化学学院功能材料化学研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家教育部博士点基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”更多>>
- 相关领域:理学化学工程医药卫生生物学更多>>
- 直接动力学方法研究氢提取反应RCN+C2H(R=CH3,C2H5,和C3H7)
- <正>乙炔基(C2H)已成为化学工作者研究的热点之一,它是化学燃烧进程和太阳系大气层的重要中间体,因此研究乙炔基在较低温度下的一些化学反应的速率和产物的分支比,对于精确研究太阳系大气层的光化学是十分重要的。本文用双水平直...
- 赵增霞刘靖尧张红星孙家钟
- 文献传递
- 恢复蛋白Recoverin正则模式分析的理论研究被引量:1
- 2009年
- 采用旋转平移块方法对Ca2+/豆蔻酰基开关进行了正则模式分析(NMA).研究结果表明,恢复蛋白(Recoverin)的T态的N-末端与C-末端易于发生刚体逆向旋转,一旦结合Ca2+,很容易发生构象变化,形成具有双向构象转变特征的I态.I态是一个中间结构,既可以发生构象回转到T态,又可以继续相对旋转到R态,使豆蔻酰基完全暴露,从而行使其信号传导生物功能.从低频振动模式分析可以看出,恢复蛋白具有构象转变这一本质属性.
- 李吉来耿彩云步宇翔陈效华王军黄旭日孙家锺
- 关键词:信号传导低频振动
- 二萘并苯中非局域电子-声子耦合的理论研究
- 电荷传输是有机电子器件应用的基础,因此准确全面地理解有机分子晶体中的电荷传输机制是非常重要的。非局域电子-声子耦合在有机半导体电荷输运中起着重要的作用。有机半导体中分子间的电荷传输积分与分子的堆积密切相关,即使很小的分子...
- 张守峰任爱民陈先凯
- 文献传递
- [MAl_5]^+ (M=Si,Ge,Sn,Pb)体系结构和稳定性的理论研究被引量:2
- 2010年
- 利用B3LYP和CCSD(T)(单点)方法,研究了含Si,Ge,Sn,Pb的六原子体系[MAl5]+中各个异构体的结构及稳定性.研究结果表明,尽管与[CAl5]+一样也具有18个价电子,但[MAl5]+(M=Si,Ge,Sn,Pb)体系并不存在具有平面五配位结构的异构体,其能量的全局极小点为具有Cs对称性的蝶形异构体Int1,这是由于中心原子M(Si,Ge,Sn,Pb)较大的体积显著破坏了[MAl5]+中平面五配位结构的稳定性所致.
- 贺海鹏崔中华丁益宏
- 关键词:异构体热力学稳定性
- C_(40)异构体的结构和稳定性的理论研究被引量:9
- 2003年
- 利用 Gaussian98程序 ,采用密度泛函 ( DFT)方法中的 B3LYP,选用 6 -31 G基组对富勒烯 ( Fullerene)C40 的 6种异构体 [D5d,Td,D2 h,C3 v,D2 ( ) ,D2 ( ) ]进行了几何构型优化 ,其中 ,对于 Td 对称性的 C40 由于易发生 Jahn-Teller畸变 ,则降低其对称性为 D2 d,再进行优化 .对它们的平衡几何和电子结构进行了比较具体的分析 ,同时 ,根据计算得到的总能量推断出这 6种异构体的稳定性顺序是 D2 ( ) >D5d>Td>C3 v>D2 h>D2 ( ) .
- 刘桂霞张红星孙家锺唐敖庆
- 关键词:C40异构体电子结构稳定性富勒烯密度泛函
- CH_3O_2~·+NO气相反应的密度泛函理论研究被引量:6
- 2003年
- 用密度泛函方法分别研究了单态和三态 CH3 O·2 + NO CH3 O· + NO2 气相反应 .结果表明 ,反应中 NO进攻 CH3 O·2 经过了一个顺反异构化的过程 ,摘取 CH3 O·2 的端基氧 .整个反应是吸热反应 ,理论计算吸热值为 5 0 .93k J/ mol,单态为多通道多步骤反应 ,决定速度步骤的能垒为 1 90 .6 1 k J/ mol.而三态为单通道反应 ,其决定速度步骤的能垒为 1 6 3.31 k J/ mol.三态反应为最佳反应通道 .该反应的研究将为保护臭氧层及大气环境提供重要的理论依据 .
- 傅强陈丽莉潘秀梅李泽生孙家锺
- 关键词:气相反应密度泛函理论反应机理大气臭氧层甲基自由基
- 关于七叶皂苷的构象转换以及透膜机理的理论研究
- <正>近年来,天然来源药物一直是药学基础研究和创新药物研发的重点。阐明其中活性成分的作用机制和体内过程对于进一步开发利用天然药物、以至以有效成分(体内起效成分)为先导化合物开发出新类型的药物均具有重大意义。七叶皂苷问世于...
- 李帅高雪峰赵熹黄旭日
- 文献传递
- [Au(PH3)]^+修饰的芳香基炔基配合物发光机制的从头计算研究被引量:1
- 2008年
- 用从头计算法研究H3PAuC≡CPh(a),H3PAu(C≡C-1,4-C6H4)Ph(b)和H3PAu(C≡C-1,4-C6H4)C≡CPh(c)3种Au(Ⅰ)配合物的磷光发光性质,使用MP2和CIS方法分别优化配合物的基态和激发态的几何结构.计算结果表明,激发态的电子跃迁减弱了Au与配体的成键作用.由计算得出3种Au(Ⅰ)配合物的最低能量磷光发射光谱分别为530,610和615nm,皆由A3A′→1A′产生,属于Au(6p)→C(2p)的电荷转移(MLCT)修饰下的pπ*(C≡C,■)→pπ(C≡C,■)跃迁本质,并伴有Au(6p)→Au(5d)的金属中心电荷转移(MCCT)性质.随着分子增长,其激发态轨道中Au的p轨道成分减少,相应的最低能量磷光发射的波长红移.
- 矫玉秋潘清江张红星
- 关键词:发光机制从头计算研究磷光
- Sirt1及Sirt2与活性分子INA的作用机制研究被引量:2
- 2013年
- 应用分子模拟理论与方法研究了人类沉默信息调节因子2相关酶类Sirtuin家族成员Sirt1及Sirt2与一种活性分子(命名为INA)的作用机制.同源模建了Sirt1的三维结构,通过分子对接手段得到Sirt1(NAD+)-INA及Sirt2(NAD+)-INA的两种复合物体系,进行了分子动力学模拟.并且分别计算了两种体系中关键氨基酸残基与INA的结合自由能值,由此推测出Sirt1(NAD+)-INA、Sirt2(NAD+)-INA体系结合位点分别为Val72,Ser73和Arg272及Phe235,Leu264和Gly305,确证了两种体系的结合模式.模拟结果表明,在Sirt1(NAD+)-INA体系中,INA与催化底物NAD+距离较近,可以相互作用,具有较高活性;在Sirt2(NAD+)-INA体系中,INA与催化底物NAD+距离较远,与在Sirt1体系中比较,INA对Sirt2体系的活性较弱,结果与实验一致.本文的研究,对今后以去乙酰化酶Sirt1,Sirt2为靶点的新药开发具有一定指导意义.
- 陈晓光赵晓杰王嵩王丽萍李惟孙家钟
- 关键词:分子模拟SIRT1
- NO+HCCCO反应势能面的理论研究被引量:2
- 2008年
- 在CCSD(T)/6-311G(d,p)//B3LYP/6-311G(d,p)+ZPVE水平下,对反应NO+HCCCO进行了研究.建立了反应势能面,揭示了该反应的反应机理,通过O迁移、C—C键或N—O键断裂等多步反应,得到4种产物,其中,最主要产物为P1(HCCO+NCO).
- 王嵩于健康丁大军孙家锺
- 关键词:势能面密度泛函理论反应机理