张小艳
- 作品数:63 被引量:204H指数:10
- 供职机构:福建省农业科学院更多>>
- 发文基金:福建省省级财政专项国家科技支撑计划国家科技基础条件平台建设计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学经济管理更多>>
- 生物技术在枇杷种质资源保存与利用的研究进展被引量:10
- 2008年
- 枇杷是原产于我国的名优特色树种。我国分布有极其丰富的枇杷种质资源,拥有开展遗传改良和农业生产等工作的良好基础。本文综述了生物技术,包括细胞工程技术、分子标记技术在我国枇杷种质资源的应用发展现状,并分析存在的问题,展望未来的深入研究方向。
- 黄爱萍郑少泉胡文舜张立杰谢丽雪陈秀妹张小艳
- 关键词:生物技术种质资源枇杷
- 侵染西番莲的东亚西番莲病毒全基因组序列特征及TC-RT-PCR检测技术被引量:2
- 2022年
- 【目的】东亚西番莲病毒(East Asian Passiflora virus,EAPV)是西番莲(百香果)上危害严重的一种病毒。本研究对我国大陆地区东亚西番莲病毒福建分离物(EAPV-FJ)的全基因组序列进行测定,明确其基因组序列特征,并建立适用于EAPV特异性检测的TC-RT-PCR(tube capture RT-PCR)技术,旨在为该病毒的检测、监测及防治提供理论依据和技术支持。【方法】采用小RNA深度测序技术结合分段克隆方法和RACE技术,测定EAPV-FJ的全基因组序列,对获得的序列进行序列特征、系统发育关系和重组分析;通过反应条件及反应体系优化,建立用于EAPV快速检测的TC-RT-PCR技术,测定其特异性和灵敏度,并应用建立的TC-RT-PCR技术对福建省西番莲果园采集的样品进行检测,同时利用普通RT-PCR检测方法进行验证。【结果】测序获得的EAPV-FJ核苷酸序列全长为10065 nt(不含polyA尾),含有一个长度为9663 nt的开放阅读框,编码3220 aa的多聚蛋白(polyprotein),经剪切后最终生成P1、HC-Pro、P3、6K1、CI、6K2、VPg、NIa、NIb和CP 10个蛋白。基因组序列一致性分析结果表明,EAPV-FJ全基因组与GenBank登录的4个EAPV代表分离物核苷酸序列一致性为80%—99%,其中与AO株系的越南分离物EAPV-GL1(GenBank登录号:MT450870)一致性最高,为99%;EAPV-FJ多聚蛋白核苷酸、氨基酸序列与GenBank登录的4个EAPV代表分离物一致性分别为79%—99%、82%—98%。基于多聚蛋白核苷酸序列的系统发育关系分析显示,EAPV分离物共分为两个类群(Group I为AO株系、GroupⅡ为IB株系),未表现出明显的地理相关性,其中EAPV-FJ属于Group I,与已报道的越南分离物EAPV-GL1亲缘关系最近。重组分析结果表明,EAPV-FJ为非重组分离物。建立的TC-RT-PCR检测技术具有较好的特异性和灵敏度,仅能检测到感染EAPV的西番莲样品,而黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV)、西番莲潜隐病毒(Passiflora latent virus,PLV)、木槿潜隐�
- 谢丽雪张小艳张立杰郑姗李韬
- 关键词:西番莲全基因组
- 侵染西番莲的夜来香花叶病毒的分子鉴定及特异性检测被引量:26
- 2017年
- 【目的】鉴定福建果园西番莲上的夜来香花叶病毒(Telosma mosaic virus,Te MV),并建立用于该病毒特异性检测的分子快速检测方法,为该病毒的防治提供参考依据。【方法】采用血清学检测、电镜观察、通用简并引物RT-PCR、特异性引物RT-PCR对福建西番莲样品进行病毒检测,并对阳性样品的PCR产物进行克隆、测序;根据已报道的夜来香花叶病毒基因序列和本研究的序列测定结果,设计一对用于扩增Te MV外壳蛋白(coat protein,CP)基因全长的特异性引物,通过反应条件优化,建立该病毒的特异性RT-PCR检测方法;序列测定结果利用BLAST程序和DNAMAN软件进行比对,同时对获得的CP基因序列采用Mr Bayes软件的贝叶斯法(Bayesian inference,BI)构建系统发育树并进行系统发育分析。【结果】血清学检测发现,一株表现有花叶、皱缩症状的西番莲样品与马铃薯Y病毒属(Potyvirus)通用抗体反应呈阳性;电镜观察结果表明,该株疑似带毒样品中含有大小约750 nm×12 nm的弯曲线状病毒粒子;Potyvirus通用简并引物RT-PCR从该样品中扩增到一条与预期大小相符的目的片段,克隆、测序获得长度为680 bp的序列,该序列与已报道的Te MV核苷酸序列一致性最高(98.2%)。特异性引物扩增获得的CP基因序列全长为816 bp(命名为BXGFJ-13分离物),与已报道的Te MV核苷酸序列、氨基酸序列一致性分别为86.2%—98.4%和88.2%—97.8%。系统发育分析结果表明,13个Te MV分离物共形成3个类群,相同地区或寄主来源的分离物优先相聚成簇,表现出很强的地理和寄主特异性。本研究获得的BXGFJ-13分离物与中国广西分离物(KJ789129)先以较高的后验概率聚为一个分支,再与泰国2个分离物(AM409188、AM409187)聚为第2类群(Group II),表明其在系统发育关系上与中国广西分离物的亲缘关系最近。利用特异性引物Te MV-CPf/Te MV-CPr建立的RT-PCR方法,具有良好的特异性,仅能从
- 谢丽雪张小艳郑姗张立杰李韬
- 关键词:西番莲分子鉴定
- 龙眼新品种(品系)的ISSR指纹图谱研究初探被引量:11
- 2012年
- 利用ISSR分子标记技术,以冬宝9号、高宝等6份龙眼新品种(品系)与我国11份主栽品种为试材,构建17份龙眼品种(品系)的DNA指纹图谱。从30条ISSR引物中筛选出5条稳定的多态性引物。采用NTSYS-PC 2.0进行聚类分析,17份龙眼种质的遗传相似系数为0.75~0.93,在0.785的水平可将试材分为4个类群。引物py-9可将17个龙眼品种(品系)区分开,并依此建立了数字化的DNA指纹图谱,为探索龙眼新品种的鉴别、资源评价利用等方面提供了重要的依据。
- 郑姗张立杰张小艳谢丽雪李韬
- 关键词:龙眼ISSR指纹图谱
- 一种夜来香花叶病毒分子检测用试剂盒及检测方法
- 本发明涉及一种夜来香花叶病毒分子检测用试剂盒及检测方法,属于植物检疫技术领域。本发明提供的夜来香花叶病毒分子检测用试剂盒,包括以下组分:病毒抽提缓冲液;PBST缓冲液;包被缓冲液;夜来香花叶病毒特异性抗体;正向引物,所述...
- 谢丽雪张立杰李韬张小艳郑姗金铃
- 文献传递
- 枇杷种质资源果实抗逆性初步调查评价被引量:3
- 2011年
- 对国家果树种质福州枇杷圃内251份枇杷种质资源的果实抗逆性(抗锈斑病、裂果病、日灼病和皱果病)进行了调查评价。结果表明:22份种质对这4种生理病害均表现强抗性;41份种质表现较强抗性(对其中3种病害抗性强、1种病害抗性中);9份种质的抗逆性较差,特别是坑本、纳溪早红和杨柳白肉等3份种质仅对日灼病抗性表现中等,对其他3种病害抗性弱;野生种质抗逆性优于栽培种质;红肉类型种质抗逆性优于白肉类型;不同来源地种质资源的果实抗逆性也有一定差异。
- 张小艳许奇志李韬郑少泉
- 关键词:枇杷种质资源
- 龙眼品种SRAP指纹检索系统的开发及遗传多样性研究
- 本文应用SRAP技术开发了龙眼(Dimocarpus Lour.)指纹检索系统并进行了遗传多样性分析。12对引物组合在17份龙眼及龙荔(Dimorcarpus vonfinis(How et Ho))种质中共扩增出252...
- 张立杰李韬郑姗张小艳胡文舜郑少泉
- 关键词:龙眼种质资源
- 文献传递
- 蓝莓休克病毒巢式RT-PCR检测试剂盒及其检测方法
- 本发明涉及一种蓝莓休克病毒巢式RT-PCR检测试剂盒及其检测方法,专用于蓝莓休克病毒的检测。该试剂盒包括:正向引物BlShV-f、外侧反向引物BlShV-r1、内侧反向引物BlShV-r2、RT Buffer、RNA酶抑...
- 谢丽雪李韬郑姗张立杰张小艳金铃蔡伟
- 文献传递
- 枇杷种质资源果实描述性状多样性分析被引量:11
- 2009年
- 对国家果树种质福州枇杷圃内不同来源地的172份枇杷种质资源进行了果实的风味、剥皮难易、果肉颜色、心皮质地、种子形状、种皮颜色、种皮开裂、种子斑点、种子基套大小、果肉化渣程度、果肉质地和汁液等12个描述性状的多样性分析,结果表明:枇杷种质的12个果实描述性状变异系数范围为28.34%-78.75%,Simpson多样性指数为0.349-0.834,果实风味、果肉质地和果肉颜色的多样性指数较高,具有丰富的多样性,种皮开裂和种子形状的多样性指数较低,多样性较差。在不同果肉类型当中,红肉类型枇杷种质的果肉化渣程度的Simpson多样性指数比白肉类型高3.2倍,而种皮开裂的Simpson指数比白肉类型低0.196,其余描述性状的Simpson指数相差不大。
- 邓朝军陈志峰张小艳张立杰谢丽雪郑姗章希娟林旗华魏秀清许奇志陈秀妹郑少泉
- 关键词:枇杷种质资源多样性
- 枇杷种质资源果实可食率变异研究被引量:8
- 2009年
- 对国家果树种质福州枇杷圃内168份枇杷种质的果实可食率进行了鉴定评价,结果显示,枇杷种质资源果实可食率变异系数为11.38%,呈偏态分布,可食率大于75.0%的种质有16份。不同来源地之间的枇杷种质资源果实可食率存在较大的差异,野生枇杷种质的果实可食率较栽培种质低,呈极显著差异,红肉与白肉枇杷种质之间果实可食率差异不显著。
- 郑姗章希娟张小艳张立杰林旗华邓朝军谢丽雪魏秀清许奇志陈秀妹郑少泉
- 关键词:枇杷种质资源可食率