周睿 作品数:58 被引量:232 H指数:9 供职机构: 首都医科大学附属北京朝阳医院 更多>> 发文基金: 国家临床重点专科建设项目 首都卫生发展科研专项 北京市科技计划项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 自动化与计算机技术 文化科学 生物学 更多>>
使用CRISPR/Cas9技术构建DNMT3A R882H细胞系用于质控急性髓系白血病分子检测 被引量:1 2021年 对于不同基因位点的突变,急性髓系白血病的发病机制和治疗策略各不相同,因此精准的分子检测在急性髓系白血病的诊断中发挥至关重要的作用。但是目前临床实验室进行分子检测时,缺乏高度模拟病人样本的室内质控品,同时也无完善的外部质量评估系统来评估临床实验室检测结果的正确性。为了提高临床实验室分子检测的正确性和可信度,我们使用CRISPR/Cas9技术构建DNMT3A(R882H,2645G>A)HEK293T细胞系,以用于急性髓系白血病分子检测的质量控制。同时将单链供体模板中cas9蛋白识别位点AGG更换为AGA,以阻止同源重组的细胞系再次被cas9蛋白切割,从而提高同源重组细胞系制作的成功几率。经验证构建成功的DNMT3A(R882H,2645G>A)细胞系能够稳定遗传,同时使用该细胞系DNA提取产物制作的室间质评样本中目的基因的突变频率,在2种Sanger测序仪器和3种高通量测序仪器上得到较好的验证。以上结果表明,制备的DNMT3A(R882H,2645G>A)HEK293T细胞系的DNA提取产物不仅可用作室内质量控制,同时也能作为监控不同厂家、多种平台的室间质评样本,从而提高临床实验室分子检测的准确性和可信度。 王宁 魏亚丽 安旭 曹沁梅 周睿关键词:急性髓系白血病 高通量测序 质控品 基于机器学习和差值校验的识别混淆样本方法的建立及评价 被引量:1 2021年 目的利用患者历史对比数据,建立基于机器学习中支持向量机(support vector machine,SVM)算法识别临床混淆样本的方法,并验证该方法的临床有效性。方法收集约45万例血常规检测结果,经过数据清洗过滤,同一患者只保留2次检验结果并计算差值校验的绝对值。用同一患者与不同患者的差值(delta)分别制作正配样本与错配样本。采用SVM分类算法实现用多项目识别2种样本,与基于单项目识别的参考变化值法(reference change value,RCV)作比较。结果SVM算法识别正配和错配2种样本,精确率达到92.21%。基于统计学的RCV方法在不同项目下效果不同,其中红细胞平均血红蛋白量(MCH)在绝对值delta下的准确率最高,为81.51%。结论基于多项目的SVM算法可识别混淆样本,可在结果审核中应用。 张金杰 梁玉芳 王清涛 王哲 冯祥 韩泽文 宋彪 高志琪 宋彪关键词:支持向量机 基于随机森林算法检出hs-cTnT项目小偏移的实时质控方法 被引量:2 2021年 目的利用机器学习随机森林(random forest,RF)算法,建立一种准确识别检测小偏移的实时质控方法,并以浮动异常值之和的方法(moving sum of outlier,MovSO)作为参比方法,评价新算法效能。方法收集来自航空总医院实验室信息系统导出的2016年1月至2021年8月在罗氏化学发光E601设备检测的hs-cTnT项目检测结果,按照规定的数据清洗规则筛选出54243个结果作为无偏数据,人为引入10个不同大小的偏移,生成相应的有偏数据,每种偏移下用RF与MovSO两种算法进行实验。采用分类模型标准及临床指标对算法进行评价。结果RF算法在浮动窗口大小为10时,对10个小偏移均能检出,假阳性率(FPR)为4.0%~4.7%,受影响的患者样本数中位数(MNPed)在12以下。除了在±1 ng/L偏移时准确度为85%,其余8个偏移检出准确度均在90%以上;MovSO算法的最优浮动窗口大小为200,除了在1 ng/L时偏移无法检出,对其他9个偏移均可检出,FPR在3.5%~4.6%之间,MNPed均在100以上,仅在5 ng/L偏移时识别准确度方可达89%。RF算法总体显著优于MovSO,RF可准确识别hs-cTnT的测量小偏移。结论基于机器学习RF算法建立的质控方法可以改进类似hs-cTnT等临床对检测质量要求较高的项目的测量准确度,为实验室质控方案提供了新思路。 梁玉芳 程华丽 王清涛 王哲 冯祥 韩泽文 宋彪 周睿关键词:实验室数据 全自动尿沉渣分析仪UF-1000i的性能评价及临床应用 被引量:10 2014年 目的 评价流式尿沉渣分析仪UF-1000i性能,以提高检测的准确度、敏感度和特异度.方法 使用流式尿沉渣分析仪UF-1000i对200份新鲜的中段尿液样本进行检测,以验证该检测系统的精密度、线性、携带污染及与手工方法比较的一致性,评价用于尿路感染筛查和诊断的敏感度和特异度.结果 该检测系统的五项参数红细胞、白细胞、上皮细胞、管型和细菌计数的精密度分别为2.6%,2.61%,9.6%,14.3%和6.9%;该系统的线性可达到红细胞18 178个/μl、白细胞8053个/μl和细菌78 867个/μl.红细胞和白细胞的携带污染率均小于0.49%.该方法与手工方法比对的符合率分别为红细胞87.5%,白细胞95.9%,上皮细胞91.5%,管型84.4%,细菌计数96%.该方法用于尿路感染的筛查和诊断,其敏感度为0.98,特异度为0.86,阳性预测值为0.97,阴性预测值为0.91,与手工尿培养的符合率为0.96.结论 UF-1000i具有良好的分析检测性能,且与手工方法比对的相关性好.独立的细菌通道大大提高了定量细菌检测的敏感度和特异度.UF-1000i可以用于快速、准确的尿路感染的筛查和诊断的方法. 高志琪 王清涛 周睿关键词:性能评价 显微镜检查 尿路感染 实验诊断学PBL教学实践研究及体会 被引量:14 2011年 实验诊断学(Laboratory Diagnosis)是诊断学的一部分,它是基础医学与临床医学之间过渡的桥梁课程之一。实验诊断学的任务是将临床检验所提供的检验信息,通过医师的综合分析,科学地应用于临床诊断、鉴别诊断、病情观察、预后判断及疾病预防等,也称为临床检验诊断学[1]。 梁玉芳 赵燕田 翟玉华 赵书弘 周睿 马怀安 陈文明 王清涛关键词:实验诊断学 教学实践 临床检验诊断学 PBL 检验信息 关于个性化质控计划的临床应用及常见问题探讨 被引量:3 2016年 个性化质量控制计划( IQCP)是一种针对检验全过程的质控方法。2016年1月,美国正式采用IQCP替代原有的等效质控。本文将介绍如何在实验室建立、实施IQCP,并对其应用过程中的常见问题加以讨论。 周睿 王清涛关键词:实验室能力验证 北京地区142家医疗机构互认实验室临床化学和临床免疫及临床检验专业室内质量控制现况调查 被引量:27 2016年 目的:了解北京地区医疗机构互认实验室临床化学、临床免疫及临床检验专业的室内质量控制现状。方法采用问卷调查及现场调查相结合的方式,使用参考方法定值的新鲜冰冻血清和全血标本,对北京地区142家互认实验室临床化学、临床免疫,临床检验专业的室内质量控制的现状进行调查,并对结果进行分析。结果发放临床化学、临床免疫和临床检验专业调查问卷各142份,分别有120、97和101家实验室回报了问卷,信息回馈率分别为84.5%、68.3%、71.1%,各专业有效回馈率均为100%。问卷调查结果显示:各专业>50%实验室设置了质量控制目标且大多为误差检出概率(Ped)95%,假失控概率(Pfr)5%;约70%实验室不同的检测项目使用相同的质控方案;使用最多的质控规则是12 s/13 s/22 s。现场调查结果显示,以临床化学专业为例,采用基于生物学变异的适当标准和WS/T 403-2012确定分析质量要求,发现在现有质量控制方法下,多数检测项目不能满足实验室所设置的质量控制目标要求,即Ped 95%,Pfr 5%。结论实验室需考虑实际情况,评估自身能达到的质量水平,为实验室设置合理的质量标准,制定适宜的个性化质量控制计划。 周睿 秦妍妍 郭健 何美懿 杨延敏 张瑞 张顺利 岳育红 宋智心 吴春颖 尹弘毅 梁玉芳 贾婷婷 王清涛关键词:临床化学试验 免疫学试验 血液学试验 免疫分析仪和生化分析仪维修后性能验证的解决方案 被引量:5 2013年 方法学性能验证是临床实验室风险管理要素之一。ISO 15189和美国病理学家协会(CAP)最新认可准则明确规定仪器在装机前、使用中和关键部件维修后需进行性能验证。目前行业内尚未发布仪器维修后性能验证相关标准,仪器维修后性能验证的操作不规范。本实验室在对市场上主要生化、免疫分析仪调研的基础上,根据国际标准,结合实际工作经验,探索仪器维修后性能验证方案,为临床实验室标准化操作提供建议。 周睿 李勇 翟玉华 岳育红 杨月娟 孙先兵 王清涛关键词:风险管理 危急疾病床旁检测第25届国际论坛有感 被引量:1 2015年 危急疾病床旁检测(criticalandpoint-of-caretesting.CPOCT)第25届国际论坛于2014年9月17至20日在美国加利福尼亚州圣地亚哥市举行。CPOCT为美国临床化学学会(AmericanAssociationforClinicalChemistry,AACC)的一个分支,其主要职能是为AACC成员提供培训并促进成员间交流等。 周睿 王继华 才蕾 王清涛关键词:床旁检测 疾病 临床化学 医学实验室认可中关于方法学性能验证的高频问题及应对 被引量:9 2013年 方法学性能验证是风险管理的核心内容之一,它直接影响医学实验室检测结果的可靠性。本文对中国合格评定国家认可委员会现场初评的54家医学实验室评审结果进行分析,按不符合项出现频次的高低,列出《医学实验室质量和能力认可准则》中居于前10位的条款,并对其中与方法学性能验证相关的3个重点条款所涉及的不符合项进行归类总结,寻求相应的解决方法,以帮助医学实验室更好地满足《医学实验室质量和能力认可准则》要求,提升检验质量和能力。 周睿 王清涛