赵林清 作品数:185 被引量:1,414 H指数:23 供职机构: 首都儿科研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 北京市自然科学基金 北京市科技计划项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 农业科学 历史地理 更多>>
北京地区部分儿童严重急性呼吸综合征的血清学研究 被引量:1 2006年 目的 确定临床诊断为严重急性呼吸综合征(SAILS)患儿感染的病原是否为SAILS相关冠状病毒(SAILS-CoV);同时探讨儿童sARS患者的传播能力。方法2003年6-8月收集到的SAILS患者及其接触者血清标本177例,同时期的来源于非疫区择期手术儿童血清标本49例,以及无SAILS接触史的北京健康儿童血清标本93例,SAILS流行前儿童血清标本90例,总计409例。应用不同方法(包括酶联免疫吸附实验、间接免疫荧光、Western-blot等)、不同单位生产的试剂盒测定抗SAILS-CoV抗体。结果不同检测方法中,SAILS.CoV特异性IgG抗体阳性率在SAILS患儿中为39.1%-43.5%。成人SAILS患者中为57.1%-71.4%;与SAILS患儿接触的儿童中均为阴性。与SAILS患儿接触的成人中为6.0%-9.0%;与成人SAILS接触的儿童中为0-9.7%;与成人SAILS接触的成人中为4.4%-7.1%;同时期的正常儿童与非疫区择期手术儿童以及SAILS流行前的正常儿童血清标本用不同方法和试剂检测结果不尽相同。结论临床诊断为SAILS的患儿SAILS-CoV特异性IgG抗体阳性率(40%左右)明显低于临床诊断为SAILS的成人患者。提示在流行期间有相当一部分儿童sARS实际上是由其他的呼吸道病毒感染所致。与成人sARS接触的儿童和成人中,有一部分SAILS抗体为阳性,提示可能存在SAILS-CoV的隐性感染。目前已推广使用的SAILS诊断试剂对于儿童SAILS诊断的正确性还需要进一步的验证。 赵林清 钱渊 朱汝南 邓洁 王芳 陈慧中 曹力 王天有 张霆关键词:严重急性呼吸综合征 儿童 试剂盒 免疫球蛋白G 从北京地区急性呼吸道感染患儿标本中检测到新型冠状病毒NL63基因 被引量:32 2006年 目的了解北京地区婴幼儿急性呼吸道感染是否与一种新发现的冠状病毒——HCoV-NL63相关。方法选取2003年12月—2004年3月,从首都儿科研究所附属儿童医院收集的245份因急性呼吸道感染就诊的门诊患儿的咽拭子标本以及住院患儿的鼻咽洗液标本,进行HCoV-NL63的筛查。这些标本已经过间接免疫荧光法和病毒分离检测,常见的七种呼吸道病毒(包括RSV,甲、乙型流感病毒,Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型副流感病毒和腺病毒)检测均为阴性;同时还经逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测人偏肺病毒(hMPV)也为阴性。首先用位于HCoV—NL631b基因的两对引物用巢式PCR方法进行筛查,阳性者再用位于HCoV-NL63 1a基因的两对引物扩增进行复核。对用HCoV—NL63 1a基因扩增的长片段产物进行测序并与GenBank中相关序列进行比较分析。结果用HCoV-NL63 1b基因的引物经巢式PCR方法从245份标本中检测到3份阳性标本,阳性率为1.2%。3份阳性标本用HCoV-NL63 1a基因的两对引物经巢式PCR方法进行复核均得到阳性结果,这3份标本均取自住院患儿,患儿年龄分别为4个月、1岁和1岁5个月,临床诊断分别为毛细支气管炎、喉炎和支气管炎,男女比例为2:1。对其中基因扩增产量较高的BJ3140和BJ3787的1a基因长片段扩增产物(838bp)进行序列测定和分析的结果显示,这两株HCoV-NL63与GenBank公布的不同地区的HCoV—NL63的1a基因序列同源性最高,达到98%~99%。基于部分1a基因序列的系统进化分析显示,BJ3140和BJ3787属于HCoV-NL63的第一簇(group 1)。结论结果提示北京地区部分婴幼儿的急性呼吸道感染与HCoV-NL63相关。 朱汝南 钱渊 赵林清 邓洁 王芳 廖斌关键词:呼吸道感染 冠状病毒属 北京地区两株人偏肺病毒M蛋白基因的原核表达及抗原活性分析 被引量:1 2007年 Human metapneumovirus(hMPV) is a recently identified respiratory virus more like human respiratory syncytial virus in clinical symptoms.Matrix protein(M) is one of the most important structural proteins.For further studying of hMPV,the full length of M genes from the recombinant plasmid pUCm-M1816 and pUCm-M1817 were cloned by PCR and sub-cloned into the pET30a(+) vector,which is a prokaryotic expression vector,after dual-enzyme digestion with Bam HI and Xho I.The positive recombinated plasmids were transformed into E.coli BL21(DE3) and expressed under the inducing of IPTG.Target proteins were characterized by SDSPAGE and Western blotting.In this article,we’ve successfully constructed the recombinated plasmids pET30a-M1816 and pET30a-M1817 which have correct open reading frames confirmed by dual-enzyme digestion analysis and sequencing. The fusion proteins with 6·His-N were highly produced after inducing by 1mmol/L IPTG at 37℃.A unique protein band with approximate 27.6 kD was characterized by SDS-PAGE.Most of the target protein existed in inclusion body.Western blot analysis showed that the target protein has specific binding reaction to rabbit antiserum against polypeptides of the matrix protein of hMPV.So the M genes were highly expressed in the prokaryotic system and the expressed M proteins have specific antigenic activities.It can be used for further studying of hMPV infections in Beijing. 曹守春 钱渊 李国华 朱汝南 赵林清 丁雅馨关键词:人偏肺病毒 原核表达 2010-2012年北京地区门诊和住院腹泻儿童中轮状病毒流行调查 目的 监测北京地区腹泻患儿中轮状病毒(RV)的流行情况.方法 收集2010年10月-2012年12月门诊和住院就诊的腹泻患儿粪便标本,分别用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE,门诊)和抗原检测(住院)进行RV初筛,用RT-PC... 董慧瑾 钱渊 张又 刘立颖 贾立平 陈冬梅 朱汝南 赵林清2000—2006年北京地区婴幼儿乙型流感病毒感染的监测 被引量:17 2008年 目的通过连续的监测,了解北京地区婴幼儿乙型流感的流行规律。方法采集2000年11月-2006年6月间因急性呼吸道感染到门诊就诊和住院患儿的呼吸道标本10770份,分别经传代狗肾细胞(MDCK细胞)进行病毒分离和(或)间接免疫荧光进行流感病毒的检测,分离阳性的病毒进一步用血凝抑制试验进行流感病毒株的型别鉴定。结果从10770份呼吸道标本中,检测到乙型流感病毒阳性标本384份(其中有376份分离出病毒),总阳性率为3.57%。2000年11月-2006年6月,每年有一个乙型流感病毒的流行峰,几乎都出现在流感流行季节的后期。除2003—2004年流行季节乙型流感病毒的最高阳性检出率为2.91%(2004年4月)外,其余各年份的最高阳性检出率都高于10.00%。2005—2006年流行季节乙型流感病毒的最高阳性检出率达到历年的最高峰(23.69%,2006年3月)。每年的乙型流感病毒的流行高峰检出的病例都以门诊患儿为主。乙型流感病毒阳性的门诊患儿中,〉3岁的患儿占77.6%(264/340),乙型流感病毒阳性的住院患儿中,〈3岁的患儿占66.O%(29/44)。乙型流感病毒与其他呼吸道病毒的合并感染少见。监测期间乙型流感病毒与甲3型流感病毒的阳性检出率相差不大,但2005年9月-2006年5月期间,乙型流感病毒的阳性检出率明显高于甲3型(23.9%对1.1%)。2000—2002年流行季节北京地区婴幼儿中流行的乙型流感病毒为B/Yamagata/16/168系,2002—2003年流行季节B/Victoria/2/87系乙型病毒占优势,2003年以后的流行季节同时流行着以上两个系的乙型流感病毒,但以B/Yamagata/16/168系为主。2005—2006年流行季节B/Victoria/2/87系乙型病毒占优势。结论2000年11月-2006年6月每年2—5月份都有一次乙型流感病毒的流行(除2002—2003年流行季节为2002年12月),检测阳� 王芳 朱汝南 钱渊 邓洁 赵林清 廖斌 车莉关键词:流感病毒B型 流感 儿童 某基层医院与三甲儿童医院儿童呼吸道感染病原谱比较 2024年 目的 比较分级诊疗下某基层医院和三甲儿童医院的儿童急性呼吸道感染病原谱差异。方法 收集2021年11月至2022年3月北京某基层医院及某三甲儿童医院临床诊断为急性呼吸道感染患儿的呼吸道标本,采用多重逆转录-聚合酶联反应(RT-PCR)与毛细电泳联用技术检测13种呼吸道病原,统计学方法分析两家医院急性呼吸道感染儿童病原谱差异。结果 基层医院纳入患儿112例,男女比例为1∶1,呼吸道病原总阳性检出率为71.43%(80/112),单种病原感染72例(64.29%,72/112),混合感染8例(7.14%,8/112,均为2种病原);三甲儿童医院纳入患儿115例,男女比例1.02∶1,呼吸道病原总阳性检出率为70.43%(81/115),单种病原感染66例(57.39%,66/115),混合感染15例(包括2种病原感染12例,10.43%,12/115;3种病原感染3例,2.61%,3/115)。0~3岁婴幼儿中,基层医院与三甲儿童医院HMPV阳性检出率(52.9%,9/17;5.3%,4/75)差异有统计学意义(χ^(2)=38.10,P<0.05);三甲儿童医院儿童RSV阳性检出率(44.0%,33/75)高于基层医院(23.5%,4/17),但差异无统计学意义(χ^(2)=2.415,P>0.05)。4~15岁儿童中,基层医院Flu B阳性检出率为31.58%(30/95),三甲儿童医院为20.0%(8/40),差异有统计学意义(χ^(2)=6.96,P<0.05);三甲儿童医院MP阳性检出率为37.5%(15/40),基层医院未检出,差异有统计学意义(χ^(2)=40.08,P<0.05)。结论 2021-2022年冬春季节北京某基层医院与三甲儿童医院的儿童呼吸道感染病原谱构成存在差异,各年龄段病原谱分布也不同,提示分级诊疗以及基层医院开展核酸检测的必要性。 黄宇轩 贾立平 德日 赵林清 李晓惠关键词:儿童 急性呼吸道感染 病原谱 婴幼儿喘息与呼吸道病毒感染及过敏的关系 目的:探讨婴幼儿喘息与呼吸道病毒感染及过敏的关系。
方法:选择反复喘息患儿(婴幼儿哮喘和喘息性支气管炎)152例、毛细支气管炎患儿191例进行研究,并选择肺炎患儿101例作对照,三组患儿均取鼻咽分泌物检测呼吸道... 刘传合 康小惠 赵京 钱渊 陈育智 张嘉林 沙莉 陈超 宋欣 朱汝南 赵林清 邓洁 王芳关键词:婴幼儿喘息 呼吸道病毒 过敏性哮喘 病原 文献传递 呼吸道合胞病毒黏附糖蛋白基因新变异形式的发现及其感染患儿临床特征分析 2024年 目的分析北京地区呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)流行特征,监测黏附糖蛋白(G)基因序列变异及感染患儿临床特征。方法收集2023年1月1日—2023年12月31日首都儿科研究所附属儿童医院急性呼吸道感染患儿呼吸道标本,对经呼吸道病原体多重核酸检测确定为RSV阳性的样本,进一步通过PCR方法扩增得到RSV G蛋白基因全长,测序后建立系统发育进化树确定RSV分型及G蛋白序列变异,通过电子病历系统获得临床资料,分析北京地区RSV感染患儿临床特征。结果共收集5489份急性呼吸道感染患儿呼吸道标本,其中男3046例,女2443例,平均年龄4.36岁。核酸检测确定为RSV阳性的589例(10.7%,589/5489),其中男349例,女240例,平均年龄(2.51±2.78)岁,中位年龄0.48岁。2023年3月开始RSV呈现持续流行趋势,存在两个流行高峰,分别为5月(24.6%,122/496)和12月(18.2%,126/693)。2023年7月前以A亚型为优势亚型,8—10月为两个亚型博弈阶段,11月转变为B亚型。通过序列分析发现一种长度为954 bp的RSV B亚型新序列(RSV-B-BA9-954bp),在进化树中独立成一簇。存在新变异的RSV B亚型感染患儿收入重症监护病房(ICU)的比例(44.1%,15/34)高于未变异的RSV B亚型感染患儿(25.2%,31/123)(χ^(2)=4.600,P=0.032),但白细胞计数和C-反应蛋白低于未变异的RSV B亚型感染患儿(P<0.05)。结论2023年北京地区儿童中RSV自3月份开始持续流行,出现两个流行高峰,优势流行亚型由A转换为B,监测到一种新的RSV B亚型G蛋白基因变异(RSV-B-BA9-954bp)。 江明礼 王凤杰 韩振志 徐炎鹏 孙宇 朱汝南 陈冬梅 郭琪 周禹彤 赵林清关键词:呼吸道合胞病毒 G蛋白 人呼吸道合胞病毒北京地区A亚型ON1基因型地方株感染A549细胞转录组学分析 2024年 目的应用转录组测序方法,分析北京地区人呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)A亚型优势流行基因型ON1地方株感染A549细胞后差异表达基因,为RSV防治提供潜在靶点。方法选用已经过全基因组测序确定为RSV A亚型ON1基因型的地方株(61397-ON1)感染A549细胞,提取总mRNA,通过转录组测序筛选出与未感染的A549细胞为对照的差异表达基因,对其进行GO分析、KEGG通路分析,同时随机选择6个差异表达倍数大于2倍的基因进行qRT-PCR验证。结果以未感染的A549细胞为对照,筛选出1632个差异表达基因,其中807个基因表达上调,825个基因表达下调。差异基因主要参与细胞因子反应以及MAPK级联反应正向调控等免疫应答相关生物过程,并在MAPK信号通路、NOD样受体信号通路、p53信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路及NF-κB信号通路发生了富集。选择的6个差异表达基因qRT-PCR验证结果与转录组数据趋势一致。结论RSV A亚型ON1基因型毒株感染A549细胞后的差异表达基因主要参与细胞因子应答及免疫相关信号通路,为RSV致病的分子机制及防治策略研究提供基础资料。 王凤杰 江明礼 郭琪 李晓芸 孙宇 朱汝南 赵林清关键词:呼吸道合胞病毒 地方株 肠道病毒71型北京分离株VP4基因序列及蛋白抗原性分析 被引量:5 2011年 为探讨肠道病毒71型(EV71)VP4基因序列与手足口病(HFMD)不同临床类型之间的关系,分析重组蛋白EV71 VP4的抗原性,并初步探讨其与柯萨奇病毒A16(CA16)重组蛋白VP4是否存在交叉反应性,对2007~2009年从北京患HFMD儿童标本分离到的10株EV71的VP4基因进行克隆测序,运用生物学软件对测序结果进行比较分析,并选择其中1株与1株同期分离的CA16的VP4分别进行原核表达;用表达产物对189份正常体检的成人及来首都儿科研究所就医的非HFMD患儿血清中的IgG进行Western Blot检测,并分析14份确诊为EV71感染和12份CA16感染患者急性期血清中的IgM抗体。分析表明这10株EV71 VP4基因核苷酸同源性为94.20%~100.00%,所推导的氨基酸序列则完全相同,从重症与轻症患儿分离的毒株之间VP4的核苷酸序列未见一致性的差异,基于EV71 VP4基因核苷酸序列的进化树分析表明2007~2009年北京地区所流行的毒株均属于C4亚型;本研究中EV71和CA16的VP4核苷酸序列的同源性为69.60%,所推导的氨基酸序列的同源性为78.60%,在运用Western Blot检测189份血清中的VP4特异性IgG时,EV71 VP4的血清阳性率为38.10%,说明其具有良好的抗原性,CA16 VP4的血清阳性率为58.20%,两者差别具有显著统计学意义(2χ=15.30,P〈0.01),提示EV71 VP4与CA16 VP4没有交叉反应性;在用表达的VP4检测已确诊为相应病毒的特异性IgM时,两者皆为阴性,提示感染后机体对VP1和VP4产生不同的反应。 李玉运 朱汝南 钱渊 邓洁 孙宇 王芳 赵林清 刘立颖关键词:肠道病毒 EV71 CA16 VP4