司雪峰
- 作品数：7 被引量：87H指数：3
- 供职机构：中国疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家杰出青年科学基金卫生部艾滋病防治应用性研究项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 我国抗病毒治疗效果实验室评价及耐药性分析
- 自1985年我国首次报告艾滋病病例以来，HIV在我国的传播经过散发期、局部流行期，从1995年转入快速增长期，现正处在由高危人群向普通人群大面积扩散的临界点。目前抗病毒治疗已陆续在全国大范围开展，国产抗艾滋病毒药物将广泛...
- 司雪峰
- 关键词：人类免疫缺陷病毒抗病毒治疗耐药性逆转录酶蛋白酶
- 文献传递
- 中国HIV-1主要流行重组株B/CTat基因第一外显子序列特征分析被引量：2
- 2006年
- 目的研究我国人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)流行重组株B/CTat基因第一外显子变异特点,探讨这些变化对其功能的影响。方法从确诊的HIV-1感染者全血样本中提取基因组DNA,经套式聚合酶链反应(PCR)扩增和测序。使用GCG和Bioedit软件中的程序进行系统进化树和氨基酸变异分析,同时进行网上三级结构预测。结果总计154份样品中CRF07-BC为120份,CRF08-BC为34份,两种亚型有较广泛的分布,CRF07-BC与标准株的平均基因离散率为(5.748±1.352),CRF08-BC与标准株的平均基因离散率为(1.259±1.931)。结论我国流行重组株CRF07-BC比CRF08-BC有较长的流行时间,CRF07-BC与CRF08-BC基因第一外显子氨基酸相比,主要为半胱氨酸富含区和核心区的变化。在这两个区位点变化可能影响Tat与细胞因子如cyclinT1的结合能力,而成为CRF07-BC在我国流行中获得传播优势的原因。
- 黄海龙邢辉马鹏飞关琪魏民洪坤学陈建平梁浩司雪峰全宇谢必峰邵一鸣
- 关键词：HIV-1
- TREAT ASIA机构2004年度会议暨艾滋病耐药问题被引量：3
- 2005年
- 司雪峰徐建青邢辉
- 关键词：艾滋病研究耐药性
- 我国HIV-1 B′亚型毒株gag基因变异特征研究被引量：1
- 2007年
- 目的研究我国人免疫缺陷病毒1型(HIV-1)B’亚型主要流行株在宿主免疫压力下的基因变异及抗原表位的变化特征,探讨选择压力、基因离散率和抗原表位变化之间的关系。方法从确诊的HIV-1感染并的全血样本中提取基因组DNA,经套式聚合酶链反应(PCR)扩增后,将扩增产物进行纯化和测序。然后将所得序列进行系统进化树和氨基酸变异分析,使用GCG软件包的Distance程序对P17和P24两个区段计算基因距离,用Diverge程序计算同义替换(Ks)和非同义替换(Ka)及二者之间的比值,并对我国人群中较常见的HLA型别限制的CTL表位的突变情况进行分析。结果HIV-1 B’亚型毒株的P17区段的Ks/Ka值<1,而P24区段的Ks/Ka值>1;P24部分的基因离散率低于P17部分;P17区段抗原表位的保守率为34.94%,而P24区段抗原表位的保守率为67.38%;从基因离散率、所受的选择压力及抗原表位的突变率3个方面来看,HIV-1的P17区段均明显大于P24区段。结论HIV-1 B’亚型毒株的P17区段的抗原表位变化较大,而P24区段的抗原表位相对较为保守。提示P24区段的CTL表位更适合于表位疫苗的研制。
- 关琪邢辉黄海龙魏民洪坤学马鹏飞司雪峰陈健平梁浩张卓然邵一鸣
- 关键词：HIV-1基因型抗原表位
- 中国HIV-1B/C重组病毒的gag-pol区基因序列特征分析被引量：29
- 2004年
- 目的 对 6株中国人类免疫缺陷病毒 1型 (HIV 1)B/C重组病毒的完整 gag基因和部分pol基因进行序列分析 ,从基因水平上分析是否存在新模式的B/C重组病毒并与其母本毒株进行比较研究 ,尝试对其不同的生物学表型进行解释。方法 从确诊的HIV感染者的全血样本中 ,提取样本基因组DNA ,经套式聚合酶链反应 (PCR)扩增后 ,将扩增产物进行纯化和测序。然后将所得序列进行系统进化树和氨基酸变异分析。用Simplot软件进行序列重组分析并确定重组断点区域 ;用MEGA软件按断点分段做基因进化树分析以验证该断点的正确性 ;用GCG软件包的Distance程序计算基因距离。并分析所研究的HIV 1B/C重组毒株长 2 5 5 0bp基因区段的分区段的基因离散率及基因重组对其功能可能造成的影响。结果 新疆 5份样本均未发现重组断点的变化 ,而重庆 1份样本的逆转录酶区内的B/C断点发生了 16 0个核苷酸的移动。氨基酸序列分析显示 ,我国流行的B/C重组株与其母本B、C毒株之间发生第 2 86位 (R→K/N)和第 799位 (A→T)的变化。结论 我国现在流行的HIV 1B/C重组病毒仍以CRF0 7 BC和CRF0 8 BC两种模式为主 ,在本研究涉及的基因区内尚未发现新模式重组毒株的流行。初步分析表明我国B/C重组毒株 2 86位和 799位氨基酸的变异可能为B/C重组株在我?
- 关琪魏民黄海龙邢辉洪坤学马鹏飞梁浩司雪峰黑发欣张卓然邵一鸣
- 关键词：人类免疫缺陷病毒1型重组病毒GAG基因生物学表型
- 我国HIV-1感染者耐药突变的流行性研究被引量：49
- 2004年
- 目的 掌握我国大规模用药前耐药突变在我国HIV 1感染者中流行情况的本底资料。方法 在第二次全国HIV流行病调查 2 0 0 2年样本中随机选取 2 0 % ,对于蛋白酶 (PR)基因区全长和逆转录酶 (RT) 2 0～ 2 30氨基酸位点进行PCR扩增、测序并使用HIVdb DrugResistanceAlgorithm软件进行分析 ,检测耐药相关突变。结果 分别得到 16 4份PR基因区样本和 138份RT基因区样本。PR基因区样本中发现 1份 ( 0 6 1% )样本存在蛋白酶抑制剂 (PI)主要相关突变 ,16 3份 ( 99 39% )样本存在PI次要耐药相关突变。RT基因区样本中发现 8份 ( 5 80 % )具有核苷类逆转录酶抑制剂 (NRTI)耐药相关突变 ,2份 ( 1 4 5 % )存在非核苷类逆转录酶抑制剂 (NNRTI)耐药相关突变。结论 我国未用药HIV感染者中耐药相关突变尚处于低流行状态 。
- 司雪峰黄海龙魏民关琪宋艳辉马鹏飞全宇邢辉邵一鸣
- 关键词：耐药突变HIV-1感染NNRTI非核苷类逆转录酶抑制剂流行性
- 确山县抗HIV治疗效果的实验室评价及分析被引量：7
- 2005年
- 目的 了解确山县抗艾滋病病毒(HIV)治疗过程中,接受治疗(治疗方案为齐多夫定胶囊、去羟基甘散和奈韦拉平片)的患者的免疫学和病毒学指标的变化和耐药毒株的出现情况。方法 对已开展抗HIV治疗的确山县部分接受治疗的HIV感染者进行了横断面调查(平均治疗时间为5 2个月) ,并在8个月后对该人群进行了随访,观察血浆病毒载量(VL)、CD+ 4 T淋巴细胞计数的变化以及耐药突变出现的情况。结果 ①8个月后VL低于检测限的病人的比例显著降低(横断面调查时为5 1 .1 %,随访时降为31 9%,P <0 . 0 5 ) ;②服药依从性<95 %的患者血浆VL显著升高(平均升高0 5 2log ,P <0 . 0 5 ) ,而CD+ 4 T淋巴细胞计数显著降低(平均降低96个/ μl,P <0 . 0 5 ) ;③随着治疗时间的延长耐药突变率由5 3 .7%上升到6 9. 8%。结论 应加强对病人的管理,提高服药依从性,降低耐药性的产生速度,保证治疗效果;及时对治疗病人进行耐药性监测,防止耐药毒株的传播。
- 姜树林王哲邢辉崔为国司雪峰朱新朋王玉李福安 彭虹王连恩 全宇马鹏飞阮玉华邵一鸣
- 关键词：艾滋病高效抗逆转录病毒疗法病毒载量耐药性
