孙颖 作品数:4 被引量:13 H指数:2 供职机构: 中国海洋大学海洋生命学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 International Foundation for Science 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 环境科学与工程 更多>>
弧菌16S rRNA基因特异引物设计及海洋弧菌菌群结构分析 被引量:3 2010年 弧菌是海水中最常见的细菌类群之一。弧菌属的一些种是致病菌,能引起海洋生物弧菌病,给养殖业造成损失。根据已有弧菌16S核糖体RNA基因(16S rDNA)序列,设计了3条弧菌属特异引物VF169、VR744和VR1150,与细菌16S rDNA通用引物VF27一起,组成VF169/VR744、VF169/VR1150和VF27/VR744 3引物对。从海水中直接提取浮游生物总DNA,用VF169/VR744,VF169/VR1150和VF169/VR744(巢式)以及VF27/VR744引物分别扩增弧菌16SrDNA片段并克隆,分别构建了弧菌16S rDNA片段变异类型文库。从各文库中分别随机选取一定数量的克隆测序,共获得72条序列。系统学分析表明所有72个序列都与已知的弧菌属细菌的序列聚类,具有很高的相似性,证明所设计的引物能用于海水样品弧菌菌群分析。另外,VF27/VR744既具有对海洋弧菌的高度特异性,也具有恰当的海洋弧菌覆盖面,是1对选择扩增海水中弧菌16S rDNA的较理想引物。从获得序列的分布情况看,胶州湾存在较高的弧菌多样性,其中,类灿烂弧菌菌群(Vibrio splendidus-related group)是优势类群。 孙颖 刘泳 王华磊 陈吉祥 杨官品关键词:弧菌 RRNA基因 长菱形藻(Nitzschia longissima)和新月细柱藻(Cylindrotheca closterium)分子分类研究 被引量:10 2006年 本研究自胶州湾分离了两种底栖硅藻,形态学初步鉴定为长菱形藻和新月细柱藻。对其18S rDNA和rbcL基因进行了测序并用邻接法构建了系统树。结果表明,两藻在18S rD-NA和rbcL基因序列上均存在较大的差异,基于DNA序列的分类结果与形态学分类结果一致。在依据形态指标难以确定藻类分类地位的情况下,18S rDNA和rbcL基因序列是有用的鉴定工具。 李海涛 杨官品 石媛嫄 吴岁寒 孙颖关键词:RDNA RBCL基因 春秋季四溴双酚A在渤、黄海的分布及生物富集 2021年 针对四溴双酚A(TBBPA)作为常用溴代阻燃剂是持久性有机污染物(POPs)的一种,其在塑料制品、纺织品和各类树脂等一些高分子聚合物中广泛应用的同时,在水体与水生生物中含量不断升高,本文于2018年春季和2019年秋季在渤、黄海采集样本,测定水体中和浮游动物体内TBBPA的含量,研究TBBPA在渤、黄海海域的分布特征和在浮游动物体内的生物富集情况,并结合环境因子进行相关性分析。结果表明,春秋季水体样本中TBBPA的浓度范围分别为0.04285~1.096和0.1294~1.490μg/L,浮游动物中TBBPA的浓度范围为0.4755~13.03和1.145~25.91μg/g,生物富集因子(BAF)范围为2.268×10^(3)~69.37×10^(3)和1.566×10^(3)~60.66×10^(3),浮游动物对TBBPA有生物富集能力。各环境因子中仅水温与秋季水体TBBPA含量呈显著正相关(P<0.05)。 戴铃灵 赵婉婷 吴月娇 孙颖 朱丽岩关键词:浮游动物 生物富集 海洋产毒甲藻——塔玛亚历山大藻(Alexandrium tarmarense)基因组DNA微卫星位点分离 2012年 采用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing repeats site)方法富集、分离海洋产毒甲藻——塔玛亚历山大藻基因组DNA微卫星位点。结果发现,测序分析的22个克隆中全部含有微卫星位点,插入片段大小为175-687 bp,微卫星DNA的重复数最低4次,最高27次,平均11次;在全部的39个微卫星位点中,其中25个属于完美重复型,13个不完美重复型,1个复合型。为塔玛亚历山大藻系统进化生物学、分子生态学研究提供了很好的标记位点。 孙颖 刘永健 聂间间 杨官品关键词:塔玛亚历山大藻 甲藻 微卫星 FIASCO