宋艳斌 作品数:83 被引量:325 H指数:9 供职机构: 南方医科大学基础医学院基因工程研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广州市重大科技攻关项目 广东省自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
SARS冠状病毒N基因的扩增与克隆 被引量:2 2004年 目的RT-PCR扩增、克隆SARS冠状病毒N蛋白基因。方法根据GenBank数据库中TOR2株的全基因组序列,利用Primer Premier 5.0软件设计引物RT-PCR巢式扩增SARS冠状病毒的N基因,PCR产物克隆后进行测序鉴定。结果序列分析表明,pMD18-T载体中已成功重组了N基因。结论N蛋白基因的扩增、克隆成功,为N蛋白的表达、N蛋白结构与功能的研究奠定了基础。 肖维威 马文丽 张宝 王艳 毛向明 彭翼飞 宋艳斌 吴清华 郑文岭关键词:严重急性呼吸综合症 传染性非典型肺炎 冠状病毒 基因扩增 N蛋白 弱精子症患者精子线粒体MTCYB、MTATP6基因的检测 被引量:14 2008年 目的:探讨精子线粒体MTCYB、MTATP6基因突变与弱精子症的关系。方法:提取80例成年男性弱精子症和20例活力正常者的精子mtDNA,设计PCR引物并扩增MTCYB、MTATP6基因,PCR产物纯化后进行序列测定和BLAST序列比对。结果:在80例弱精子症样本中有60例同时扩增出MTCYB、MTATP6片段,16例仅扩增出MTATP6片段,4例仅扩增出MTCYB片段。在20例精子活力正常的样本中均同时扩增出MTCYB、MTATP6片段。弱精子症样本中MTCYB和MTATP6基因的缺失率分别为20%和5%。扩增片断的序列分析发现,在弱精子症样本中,MTATP6基因出现G8887A的点突变,突变率为20%,而MTCYB基因未见有规律的突变。精子活力正常的样本中MTCYB、MTATP6基因未检测到明显的点突变。结论:精子线粒体MTCYB和MTATP6的基因缺失以及MTATP6基因的G8887A突变可能影响成年男性的精子活力。 冯春琼 宋艳斌 邹亚光 毛向明关键词:弱精子症 突变 5-氮杂-2’-脱氧胞苷和4-苯基丁酸对慢性粒细胞白血病细胞的miR-196b表达水平有协同作用 2014年 目的探讨慢性粒细胞白血病细胞中影响miR-196b表达水平的表观遗传学因素。方法分别采用DNA甲基化转移酶抑制剂5-氮杂-2’-脱氧胞苷(5-Aza-2’-dc)、组蛋白去乙酰化酶抑制剂4-苯基丁酸(PBA)和两者联合处理K562细胞,采用实时定量PCR(Real-time PCR)检测miR-196b的表达水平变化。结果 PBA的半数抑制浓度为1.58mmol/L。和正常人骨髓细胞miR-196b的表达水平相比,Aza组、PBA组和阴性对照组miR-196b的表达水平显著降低且基本一致,Aza+PBA组miR-196b的表达水平和正常人表达水平基本一致。结论单独使用5-Aza-2’-dc或PBA不能使K562细胞中miR-196b的表达恢复正常,两者联合使用共同处理K562细胞,可使miR-196b的表达恢复正常,表明K562细胞中miR-196b的表达水平和基因组甲基化及组蛋白乙酰化均有关系。 刘玥 帅春 李杰生 尹虹 宋艳斌 马文丽关键词:组蛋白乙酰化 K562细胞 实时定量聚合酶链反应 芯片杂交中荧光标记样品定量与非定量的比较研究 2002年 比较在芯片杂交中 ,荧光标记样品定量与非定量对杂交结果的影响。其方法是 ,提取经As2 O3 作用K5 6 2细胞前后的总RNA ,逆转录成cDNA第一链 ,并分别用Cy3/Cy5标记。标记后的样品再次定量或不定量 ,但均取相同体积上样与K5 6 2芯片杂交 ,用扫描仪扫描并分析。其结果 ,标记后样品定量与不定量杂交的结果都与理论推测一致 ,但以样品定量进行杂交的效果更好 ,标记样品杂交前再次定量的 ,分析发现 2个基因表达下调 ;杂交前不定量仅取相同体积进行杂交的 ,发现 6个基因片段表达下调 ,其中只有 2个基因与细胞凋亡通路密切相关。认为在芯片的杂交检测中 ,对荧光标记样品杂交前再次定量可大大提高杂交结果的可靠性。 冯春琼 马文丽 李凌 宋艳斌 石嵘 吴清华 郭秋野 郑文岭关键词:荧光标记 AS2O3 K562细胞 杂交 总RNA 基因片段 自杀基因治疗的作用机制及其应用 1999年 自杀基因治疗已逐渐成为肿瘤等疾病基因治疗中的一种重要方法。本文介绍了TK、CD等几种常见的自杀基因;并概述了自杀基因治疗中的旁观者效应、基因转移系统和靶向性研究及自杀基因治疗在肿瘤、骨髓移值、心血管疾病等领域中的应用。 宋艳斌关键词:自杀基因 基因表达调控 基因治疗 基因芯片中60mer寡核苷酸SARS冠状病毒探针的制备 被引量:9 2003年 目的 用合成仪合成60mer寡核苷酸SARS冠状病毒的探针来制作寡核苷酸基因芯片。方法 根据寡核苷酸探针的制作要求,选取SARS冠状病毒的特异序列30条、长度为60mer的片段进行合成,并对合成后的纯化方法与条件进行探索。将经12%变性PAG胶纯化后的探针直接点样制备成12×12阵列的寡核苷酸的基因芯片,初步与处理后的临床样品进行杂交。结果 经PAGE纯化的寡核苷酸探针的纯度高,能满足寡核苷酸芯片制备的要求。临床SABS患者标本进行处理后与寡核苷酸芯片杂交、扫描检测,效果较好。结论 该室合成的60mer的寡核苷酸SARS冠状病毒探针能用于基因芯片的制备与检测,这为该疾病的实验室诊断提供了一种快速、平行的检测方法。 广东省防治非典型肺炎科技攻关病原分离专题组 吴清华 马文丽 石嵘 郭秋野 张宝 宋艳斌 郑文岭关键词:严重急性呼吸综合征 冠状病毒 寡核苷酸探针 基因芯片 SARS冠状病毒检测60mer寡核苷酸基因芯片的设计及应用 2003年 目的 设计并应用60 mer寡核苷酸基因芯片实现对SARS冠状病毒的检测。方法 根据寡核苷酸基因芯片的设计原则设计出3O条60mer的寡核苷酸片段,覆盖SARS冠状病毒(以TOR2株为参考序列,GENEBANK索取号:AY274119)全基因组,点样制备成12×12的寡核苷酸基因芯片,将临床诊断SARS患者痰液标本抽提病毒RNA,采用限制性显示技术进行标记,将标记好的样品与芯片杂交,洗脱,扫描。初步探索寡核苷酸芯片诊断SARS冠状病毒的敏感性及特异性,并对芯片做进一步的优化。结果 来自SARS患者样品与芯片上的多个SARS探针杂交,出现了明显的荧光信号;阴性和空白对照探针上没有杂交信号,而对照样品仅与一个SARS探针有杂交。结论 采用60 mer寡核苷酸基因芯片可以从基因水平实现对SARS冠状病毒多段序列的平行检测,对于提高检出率有一定意义,此外,尚可用于监测在发病过程的各个阶段中病毒基因的活动状况。 广东省防治非典型肺炎科技攻关病原分离组 石嵘 马文丽 吴清华 张宝 宋艳斌 郭秋野 肖维威 王艳 郑文岭关键词:SARS冠状病毒 寡核苷酸基因芯片 荧光标记 分子杂交 大肠杆菌poly(A)化mRNA基因片段的RD-PCR克隆 被引量:5 2002年 目的研究大肠杆菌(E.coli)中哪些基因mRNA3'端存在poly(A)化。方法利用E.colimRNA中可能存在的poly(A)尾,以oligo(dT)-cellulose进行mRNA的纯化,并以oligo(dT)18为引物逆转录合成cDNA,应用限制性显示-聚合酶链反应(RD-PCR)分离不同组别的基因片段并进行克隆。结果成功克隆100多个基因片段,并对其中30个进行了测序分析。结论细菌mRNA的poly(A)化可能不是偶然和个别的现象。 胡子有 马文丽 宋艳斌 张宝 吴清华 郭秋野 彭翼飞 郑文岭关键词:E.COLI POLY(A) 基因克隆 大肠杆菌 活细胞计数试剂盒在检测5-氮杂-2’-脱氧胞苷对慢性粒细胞白血病细胞的增殖抑制作用中的应用 被引量:1 2014年 目的探讨活细胞计数试剂盒(CCK-8)在检测5-氮杂-2’-脱氧胞苷(5-Aza-2’-dc)对慢性粒细胞白血病细胞的增殖抑制作用中的应用。方法采用CCK-8检测不同浓度5-Aza-2’-dc对K562细胞的增殖抑制作用,并检测其半数抑制浓度对K562细胞的细胞周期和凋亡的影响。结果 5-Aza-2’-dc的半数抑制浓度为15.55nmol/L,采用该浓度处理K562细胞后,G2期发生阻滞,增殖抑制,并出现凋亡峰。结论不同浓度的5-Aza-2’-dc对K562细胞增殖的抑制作用不同,且呈浓度依赖关系。CCK-8检测法可运用于甲基化转移酶抑制剂对人慢性粒细胞白血病细胞增殖的影响。 刘玥 帅春 李杰生 尹虹 宋艳斌 马文丽关键词:K562 增殖 细胞松弛素B对K562细胞脱核作用的观察 被引量:6 2002年 目的观察细胞松弛素B(cytochalasin B,CB)对K562细胞形态和增殖能力的影响.方法以人红白血病K562细胞为细胞模型,经不同浓度的CB作用不同时间(4~48 h),通过相差显微镜和Giemsa染色观察细胞形态学改变.细胞计数法绘制细胞不同条件下的生长曲线.结果细胞形态发生显著变化,处理组细胞出现不同程度的脱核,细胞生长受到显著抑制.结论CB对K562细胞的脱核作用与其浓度呈正相关,随作用时间延长而增强;秋水仙素有显著提高CB诱发细胞脱核的作用;CB对细胞的增殖能力有显著抑制作用. 危敏 马文丽 毛向明 宋艳斌 张宝 冯春琼 郑文岭关键词:细胞松弛素 K562细胞 秋水仙素 细胞增殖 白血病