杨琛
- 作品数：9 被引量：50H指数：2
- 供职机构：中国科学院上海生命科学研究院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划中国科学院“百人计划”更多>>
- 相关领域：生物学化学工程理学自然科学总论更多>>
- 代谢流量比率分析及其在代谢工程中的应用被引量：10
- 2009年
- 细胞内代谢反应流量在系统理解细胞代谢特性和指导代谢工程改造等方面都起着重要的作用。由于代谢流量难以直接测量得到,在很多情况下通过跟踪稳定同位素在代谢网络中的转移并进行相应的模型计算能有效地定量代谢流量。代谢流量比率分析法能够高度体现系统的生物化学真实性、辨别细胞代谢网络的拓扑结构,并且能够相对简单快速地定量反应速率等,因此受到代谢工程研究者越来越多的重视。以下着重介绍并讨论了利用代谢物同位体分布信息分析关键代谢节点合成途径的流量比率、基于流量比率的代谢流量解析、以及应用于代谢工程等的相关原理、实验测量、数据分析、使用条件等,以期充分发挥代谢流量比率分析法的优势,并将其拓展推广至更多细胞体系的代谢特性阐明和代谢工程改造中去。
- 花强杨琛
- 关键词：同位素标记
- 合成生物学与工业生物技术被引量：2
- 2009年
- 合成生物学是近年来发展起来的新兴学科,因其具有重要的研究意义和巨大的应用开发潜力而备受关注,发展极为迅速。本文对合成生物学的国内外研究概况、发展方向及其对工业生物技术领域的推动作用进行了概述。
- 杨琛姜卫红杨晟赵国屏
- 关键词：合成生物学工业生物技术
- 一种新的精氨酸水解酶及其编码基因和应用
- 本发明提供了一种新的精氨酸水解酶及其编码基因和应用，具体地，本发明提供了一种生产鸟氨酸的方法，本发明的精氨酸水解酶制备获得鸟氨酸的副产物是氨和二氧化碳，它们可以很容易的从反应体系中分离，方便鸟氨酸的分离纯化。
- 杨琛张昊刘玉洁聂晓群
- 文献传递
- 生物炼制中的科学难点——戊糖利用及其调控机制
- 2009年
- 以可再生的生物质资源替代不可再生的化石资源,实现工业原材料的根本转变,是转变经济增长模式、保障社会经济可持续发展的重大战略需求。木质纤维原料富含己糖和戊糖,而微生物戊糖代谢能力上的不足是一个共性问题。因此,解析微生物戊糖代谢及其调控过程的本质,是拓展微生物底物利用范围、提高微生物利用木质纤维原料能力的关键。本文综合概括了戊糖代谢及其调控的研究意义、国内外的研究概况、拟解决的关键科学问题以及研究方向。
- 顾阳杨琛杨晟姜卫红
- 关键词：可再生资源生物炼制
- 一种动态代谢流量分析技术的建立与应用
- 本发明提供了一种动态代谢流量分析技术的建立与应用，具体地，本发明提供了一种动态流量代谢分析方法，所述方法包括步骤：a)样品制作；b)生物样品的检测：通过色谱质谱联用方法对所述的细胞提取物进行分析，得到一个或多个代谢物的标...
- 杨琛刘丽霞张昊刘玉洁
- 文献传递
- 丙酮丁醇梭菌木糖代谢相关基因的鉴定和途径优化
- 丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)是重要的产溶剂梭菌,它不仅能够高效利用葡萄糖和淀粉质原料,还能够代谢木质纤维素中最主要的五碳糖—木糖,生成丙酮、乙醇和丁醇,因此具有重要的工业应用价值。...
- 顾阳任聪孙喆杨晟杨琛姜卫红
- 文献传递
- 基因组网络分析与功能模块设计-2013年度科技报告
- 2016年
- 该年度进展顺利,主要年度进展均已完成,发表论文20篇(其中SCI论文20篇),申请专利5项。年度进展亮点包括:(1)基因组尺度代谢网络模型的构建:针对耶氏酵母和微拟球藻两种底盘微生物细胞,针对特定工业性状,构建了基因组规模代谢网络模型。同时开发了新型的基于差量网络分析技术的代谢网络模拟方法,能够更有效地寻找过表达、限制表达等代谢改造靶点。该方法在既有的大肠杆菌模型和该课题组构建的解脂耶氏酵母模型上,对多种代谢物的合成进行了模拟仿真,得到的结果中不但包含了现有文献中已证实的操作,更能够建议一些非直观但仿真效果很好的遗传改造策略。(2)人参皂苷合成途径解析:完成了不同参龄、品种、生长环境及组织的人参转录组样本的采集,并完成3年和5年须根转录组文库的测序;对人参Panax ginseng C.A.Meyer和西洋参American ginseng(Panax quinquefolius L)转录组数据进行了重新拼接和分析;发现了与验证了可参与皂苷合成的微生物来源的角鲨烯合成酶(SS)和鲨烯环氧酶(SE)基因,以及多个潜在参与皂苷合成的糖基转移酶基因。(3)次级代谢产物合成途径解析和设计:实现了在大肠杆菌和蓝藻中异戊二烯的异源生物合成;已经挖掘、改造、合成了10多个异戊二烯生物合成途径上的关键结构元件;实现了异戊二烯合成限速酶的催化性能的提高。并建立了C13代谢流量分析平台,发展了稳定同位素标记结合核磁共振分析或质谱分析的代谢流量组学分析技术,可用于代谢途径的发现和代谢通路的识别,为人工细胞的优化设计提供理论依据。(4)元件与模块检测关键技术的建立:在蛋白质水平,选择蓝细菌为模型发展了高效的蛋白复合体分析技术,完善了对相关生物功能模块的认识,为进一步工程改造多不饱和脂肪酸合成,以及将高效模块用于提高其他高附加值的产�
- 徐健花强陈磊杨琛冯露
- 关键词：合成生物学细胞工厂单细胞
- 合成生物学发展现状与前景被引量：38
- 2011年
- 合成生物学是综合了科学与工程的一个崭新的生物学研究领域,为生命现象及其运动规律的解析提供了一种采用"自下而上"合成策略的正向工程学的研究思路和方法手段,在经济和社会发展中具有巨大的应用开发潜力。近年来,DNA合成与系统生物学技术的发展使生命系统复杂基因回路的设计、合成与组装逐步成为可能,并应用于生物基化学品、生物燃料、医药中间体、保健产品的生产和环境保护等领域。但是,合成生物学的研究仍然面临科学、技术和伦理的挑战,只有积极地应对这些问题,在加大研究开发支持力度的同时,做好必要的风险监管,才能真正把握合成生物学发展带来的历史机遇。
- 熊燕陈大明杨琛赵国屏
- 关键词：合成生物学DNA合成
- 代谢流的定量与定向调控
- 代谢流的定量及其调控机制研究对于认识并改造和优化微生物的代谢能力具有重要意义.代谢流分析技术不仅能够识别代谢通路,还能鉴定代谢网络中影响生物合成功能的关键节点,揭示目标化合物合成的瓶颈,为微生物的优化设计和改造提供理论依...
- 杨琛
