祁长乐
- 作品数:2 被引量:2H指数:1
- 供职机构:西安交通大学生命科学与技术学院生物医学信息工程教育部重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学文化科学更多>>
- DNA保守序列识别算法的并行化和MPI集群环境构建被引量:1
- 2009年
- DNA序列中保守序列的识别需要较大的计算量。开发了一个转录因子结合位点识别的并行算法,能够从多条DNA序列中识别指定长度的序列模式。算法使用概率模型进行序列模式保守性的度量,利用迭代过程实现保守序列的搜索。使用C编程结合MPI消息传递模型开发了相应的程序,并在Windows平台下构建了一个3节点的集群环境,利用20个长度均为200的序列数据集进行测试,实现了模体识别工作,结果表明并行算法使模体识别的效率得到提高。
- 祁长乐吴晓明尹瑞刘丽丽王波
- 关键词:模体识别基因调控转录因子结合位点
- 利用组件技术增强网络课件交互功能的探索——生物信息学算法示教的实现被引量:1
- 2009年
- 介绍了多媒体网络课件中的交互式技术,提出利用网络组件,通过Web浏览器运行Linux平台生物信息软件,并实现网络课件中交互功能的方案。基于这一方案,开发了生物信息学网络课件的部分内容,构建了Blast、Emboss等常见生物信息学算法和软件的运行环境,实现了网络环境下生物信息学算法教学的实践环节。
- 吴晓明杜建强刘丽丽王旭祁长乐张虎勤王波
- 关键词:网络课件生物信息学交互操作LINUX