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陆生植物鲨烯合酶适应性进化正选择位点分析被引量：11: 2013年; 鲨烯合酶是三萜类皂苷生物合成途径中的关键酶,其活性的高低决定了三萜皂苷、植物甾醇等后续次生代谢物的含量.对鲨烯合酶进行正选择位点分析,可为识别重要的功能位点提供有意义的信息.本研究在克隆获得五加科三七、葫芦科绞股蓝鲨烯合酶cDNA的基础上,结合GenBank中所登载的植物鲨烯合酶cDNA序列信息,利用位点模型检测并分析了38种陆生植物鲨烯合酶的适应性进化.结果显示,进化上相对保守的鲨烯合酶受到正选择作用,检测到的21个正选择位点大部分集中于第2跨膜区及其两侧,其中189S、194S、196S、265I、389P、390T、408A、410R和414N等9个位点很可能与鲨烯合酶的活性有关.本研究从分子进化角度为调控三萜类化合物的生物合成提供了一个新的思路.; 刘镛吴耀生胡艳玲晁耐霞唐银琳蒋东; 关键词：鲨烯合酶适应性进化正选择陆生植物

绞股蓝法呢基焦磷酸合酶基因的克隆及其序列分析被引量：8: 2014年; 目的：克隆并分析绞股蓝法呢基焦磷酸合酶（FPS）基因的全长序列。方法：参照罗汉果法呢基焦磷酸合酶基因，设计扩增绞股蓝FPS基因的3’RACE引物，采用3＇RACE和5＇RACE法克隆绞股蓝FPS基因全长eDNA。结果：获得绞股蓝FPS基因全长eDNA序列共1288个核苷酸，包含一个1026核苷酸的开放读框，编码342个氨基酸残基，推断该蛋白的相对分子质量为3．94x10^4。NCBIBlast结果显示绞股蓝FPS基因编码蛋白的氨基酸序列与已知的植物FPS氨基酸序列的同源性为91％～74％，核酸序列的同源性为88％-78％。结论：克隆了绞股蓝FPS基因全长eDNA序列，为进一步研究绞股蓝FPS基因的表达及三萜皂苷合成通路关键酶分子的进化奠定了基础。; 蒋东唐银琳陶晨陈吴耀生; 关键词：绞股蓝基因克隆

DNA条形码(ITS2)在葫芦科鉴定中应用价值的评估被引量：5: 2012年; 探讨在纳入分析数据时,数据信息的选择对ITS2序列作为DNA条形码在葫芦科植物中鉴定能力的影响。首先,建立由葫芦科植物ITS2序列组成的3个资料组,其中Dataset1为实验样本,Dataset2由实验样本及Gen-Bank数据库样本组合,Dataset3为从Dataset2中去除部分序列后所得。通过比较3个资料组的种间、种内的变异、Barcoding Gap及鉴定成功率,评估纳入分析的数据选择差异对ITS2鉴定能力的影响。结果显示ITS2序列在3个资料组属水平上的鉴定成功率均达到100%;种水平上,用BLAST1法鉴定成功率分别为100%、67.8%、90.6%,Nearest Distance法鉴定成功率分别为100%、52.5%、66.5%。可见纳入分析的数据选择有差异时,会导致鉴定成功率的较大变化。3个资料组中,ITS2分析仅有Dataset2的Barcoding Gap不够显著。因此对于DNA条形码分析中的数据纳入标准,值得进一步研究。; 唐银琳刘镛姚辉陈振东吴耀生徐鹏蒋东; 关键词：葫芦科 ITS2

基于DNA条形码(ITS2)的绞股蓝与其混伪品的分子鉴定方法分析被引量：2: 2012年; 目的探讨基于ITS2序列的绞股蓝与其混伪品鉴定的新方法。方法从GenBank中下载绞股蓝及其混伪品的ITS2序列,用软件MEGA4.0等进行相关数据分析,通过ITS2数据库预测ITS2二级结构,并用最大简约法构建系统发育树。结果绞股蓝与其混伪品的ITS2序列存在差异,其二级结构在4个螺旋区的茎环数目、大小、位置以及螺旋发出时的角度均有明显差异,绞股蓝最大种内K2P遗传距离远远小于其与混伪品的最小种间K2P遗传距离,构建的系统发育树显示绞股蓝与其混伪品可明显分开。结论基于DNA条形码的ITS2序列为绞股蓝及其混伪品的准确、简便鉴定提供了新的分子鉴定方法。; 刘镛唐银琳吴铁吴耀生蒋东; 关键词：绞股蓝混伪品分子鉴定

绞股蓝法呢基焦磷酸合酶(FPS)基因的克隆及其原核表达: 本研究采用RACE技术对药用植物绞股蓝法呢基焦磷酸合酶(FPS)基因进行克隆分离，并在此基础上对该酶进行原核表达。主要研究结果如下:　　(1)获得绞股蓝FPS基因全长cDNA序列。使用TaKaRa公司3'FullRACE...; 蒋东; 关键词：绞股蓝基因克隆原核表达 RACE技术; 文献传递

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蒋东